; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G19780 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G19780
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionMADS-box transcription factor
Genome locationChr6:17771128..17776099
RNA-Seq ExpressionCSPI06G19780
SyntenyCSPI06G19780
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_016899976.1 PREDICTED: MADS-box protein CMB1 [Cucumis melo]6.5e-10496.23Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALI+FSARGKLYEFSSS SI KTLERYERHSYGALEAS PPKDTERWYQEYLKLKAE
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VEALQYSQRRFLGEELDDLE+KELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKED+LLETNQALRKKLEESS AIHHTSWDSSE NNLQYCRQPEAF
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALEN
        LQLNNNIIALEN
Subjt:  LQLNNNIIALEN

XP_022131973.1 truncated transcription factor CAULIFLOWER A [Momordica charantia]1.4e-9881.22Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFS RGKLYEFSSS SIAKTLERY+RHSYGALE S  PKDT+RWYQEYLKLKAE
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VE+LQ+SQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRS K QTMFDQLSDLQKKE+ LLETNQALR+KLEES+AA+H T W++S+ ++LQY RQ E F
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGAD---GNGLSSHWMLL
        LQ  NNI+ALENSY+P EV+N+EN +NSG +    +G  SHWM+L
Subjt:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGAD---GNGLSSHWMLL

XP_031742477.1 MADS-box protein CMB1 isoform X1 [Cucumis sativus]4.2e-127100Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
        LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
Subjt:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL

XP_031742478.1 MADS-box protein CMB1 isoform X2 [Cucumis sativus]9.7e-10888.43Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRST                            KLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
        LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
Subjt:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL

XP_038886104.1 MADS-box protein CMB1 [Benincasa hispida]2.2e-11290.98Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFS RGKLYEFSSS SIAKTLERYERHSYGALEAS PPKDTERWYQEYLKLKAE
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VE LQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTK QTMFDQLSDLQKKED LLETNQALRKKLEESSA++ HTSWDSSEPNNL+YCRQP  F
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQL--NNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
        LQ   NNNIIALENSYN  EV+N+ENV+NSG DGNGL SHWMLL
Subjt:  LQL--NNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KIR6 K-box domain-containing protein1.6e-92100Show/hide
Query:  IAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAEVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLE
        IAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAEVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLE
Subjt:  IAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAEVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLE

Query:  TNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAFLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
        TNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAFLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
Subjt:  TNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAFLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL

A0A1S4DVG4 MADS-box protein CMB13.1e-10496.23Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALI+FSARGKLYEFSSS SI KTLERYERHSYGALEAS PPKDTERWYQEYLKLKAE
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VEALQYSQRRFLGEELDDLE+KELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKED+LLETNQALRKKLEESS AIHHTSWDSSE NNLQYCRQPEAF
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALEN
        LQLNNNIIALEN
Subjt:  LQLNNNIIALEN

A0A6J1BUY9 truncated transcription factor CAULIFLOWER A6.8e-9981.22Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFS RGKLYEFSSS SIAKTLERY+RHSYGALE S  PKDT+RWYQEYLKLKAE
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VE+LQ+SQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRS K QTMFDQLSDLQKKE+ LLETNQALR+KLEES+AA+H T W++S+ ++LQY RQ E F
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGAD---GNGLSSHWMLL
        LQ  NNI+ALENSY+P EV+N+EN +NSG +    +G  SHWM+L
Subjt:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGAD---GNGLSSHWMLL

A0A6J1GJJ3 truncated transcription factor CAULIFLOWER A2.2e-9780.17Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRG+VELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALI+FS  GKLYEFSSS SIAKTLERY+RHSYGAL AS   KDTE+WY+EYLKLK E
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VE LQ+SQRR LGEEL+DLETKELDQLEIQLE SLKQIR TK QT+FDQLS+L+KKE+ LLETNQALR+KLEESSA + H+SW++SEPNNL YC QPEAF
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
        LQ NN  IALENSYNP EV+N+EN +NS  +GN L SHWM+L
Subjt:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL

A0A6J1KSQ8 truncated transcription factor CAULIFLOWER A1.9e-9678.93Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRG+VELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALI+FS  GKLYEFSSS SIAKTLERY+RHSYGAL AS   KDTE+WY+EYLKLKAE
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        VE LQ+SQR+ LGEEL+DLETKELDQLEIQLEMSLKQIR TK Q+++++LS+L+KKE+ LLETNQALR+KLEESSAA+ H+SW++SEPNNL YC QPEAF
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL
        LQ NN  IALENSYNP EV+N+EN +NS  +GN L  HWM+L
Subjt:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWMLL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
K4BND8 MADS-box protein 04g0053209.2e-6157.89Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRG+VELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELSILC+AEVALIIFS RGKLYEF S+ S++ TLERY R SYG LE     KD++  YQEY+KLKA 
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQP---
        VE LQ SQR  LGE+L  L TK+L+QLE QL+ SL+ IRS + Q M DQLSDLQ+KE  LLE N++L+ KLEE+S A     W  +   N+Q+ +QP   
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQP---

Query:  EAF---LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML
        E F   LQ N NI+   N YN   V   +++  S  +  G+   WML
Subjt:  EAF---LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML

K4DEK0 MADS-box protein J22.7e-6056Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFS+RGKLYEFSS+ S+  TLE+Y++ SY +L+  LP  DT+  Y EY++LKA 
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIH-HTSWDSSEPNNLQYCRQPEA
        VE LQ SQR  LGE+L  L +KEL+QLE QL+ SLK++RS K Q+M DQL+DLQ+KE  L E N+ L+ KLEES+A I    SW ++    ++Y R P  
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIH-HTSWDSSEPNNLQYCRQPEA

Query:  ------FLQLNNNIIALENSYNPTEVTN--EENVVNSGADGNGLSSHWML
              F  L  N  + +  YNP    N  E N   +  + NG    WML
Subjt:  ------FLQLNNNIIALENSYNPTEVTN--EENVVNSGADGNGLSSHWML

Q39685 MADS-box protein CMB15.2e-6460.33Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELS+LCDAEVALI+FS RGKLYEF S+  + KTLERY+R SYG+LE S P K+TE  YQEYLKLKA+
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF
        V+ LQ S R  LGE+L +L TKEL+QLE QL+ SL+QIRS K Q M DQL+DLQKKE+ L E+N+AL+ KLEES A+    +WD  +P +  +   P   
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAF

Query:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEE-NVVNSGADGNGLSSHWML
        L  NNN   L+  YN  E T ++ N   S  + +G +  WML
Subjt:  LQLNNNIIALENSYNPTEVTNEE-NVVNSGADGNGLSSHWML

Q7Y040 MADS-box protein EJ26.0e-6058.3Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE
        MGRGRVELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELS+LCDAEVALIIFS RGKLYEF S+ S+ KT+E+Y+R SY  LEA+    DT+  Y EYL+LKA 
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAE

Query:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIH-HTSWDSSEPNNL--QYCRQP
        VE LQ SQR FLGE+L  L +K+L+QLE QLE SLKQIRS K Q M DQL+DLQ+KE  L E+N+ LR+KLEES A       W+    + L  Q  R P
Subjt:  VEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIH-HTSWDSSEPNNL--QYCRQP

Query:  --EAFLQ-LNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML
          E F Q L  +  +    YNP   T+E N   +  + NG    WML
Subjt:  --EAFLQ-LNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML

Q8LLR2 Agamous-like MADS-box protein MADS21.1e-6158.94Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTER-WYQEYLKLKA
        MGRGRVELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELS+LCDAEVALIIFS RGKLYEF SS S+ KTLERY++ SYGA+E S P K+ E+  Y+EYLKLK+
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTER-WYQEYLKLKA

Query:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIH-HTSWDSSE---PNNLQYCR
        + E+LQ +QR  LGE+L  L TKEL+QLE QLE SLKQ+RSTK Q M DQLSDLQ KE  L+E+N+AL +KL+E S   H   SW+S E   P   Q  +
Subjt:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIH-HTSWDSSE---PNNLQYCR

Query:  QPEAFLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML
            F  L  N   L+  YNP   +++ +  ++  + NG    WML
Subjt:  QPEAFLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G03710.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein9.5e-6150.78Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPS-IAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKA
        MGRG+VELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELS+LCDAE+AL+IFS RGKLYEF SSPS +A+T+++Y +HSY  ++ +   KD +  YQ+YLKLK+
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPS-IAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKA

Query:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEA
         VE LQ+SQR  LGEEL +++  EL+ LE Q++ SL+QIRSTK ++M DQLSDL+ KE+ LLETN+ LR+KLE+S AA+  + W SS     Q  +Q + 
Subjt:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEA

Query:  ----------------FLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML
                        F  L  N+    +S+      N  N   +  + NG    WM+
Subjt:  ----------------FLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML

AT2G03710.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein7.3e-6151.55Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPS-IAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKA
        MGRG+VELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELS+LCDAE+AL+IFS RGKLYEF SSPS +A+T+++Y +HSY  ++ +   KD +  YQ+YLKLK+
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPS-IAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKA

Query:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEA
         VE LQ+SQR  LGEEL +++  EL+ LE Q++ SL+QIRSTK ++M DQLSDL+ KE+ LLETN+ LR+KLE+S AA+  + W SS     Q  +Q + 
Subjt:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEA

Query:  ----------------FLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML
                        F  L  N +AL+ S+      N  N   +  + NG    WM+
Subjt:  ----------------FLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGADGNGLSSHWML

AT3G02310.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein7.0e-5653.39Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEA-SLPPKDTERWYQEYLKLKA
        MGRGRVELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELS+LCDAEV+LI+FS RGKLYEF S+ ++ KTLERY++ SYG++E  + P K+ E  Y+EYLKLK 
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEA-SLPPKDTERWYQEYLKLKA

Query:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHH---TSWDSSEPNNLQYCRQ
          E LQ  QR  LGE+L  L +KEL+QLE QL+ SLKQ+R  K Q M DQLSDLQ KE  LL+ N+AL  KLE+     HH     W+  +  N+ Y   
Subjt:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHH---TSWDSSEPNNLQYCRQ

Query:  PEAFLQ-LNNNI---IALENSYNPTEVTNEENVVNSG--ADGNGLSSHWML
        P+A  Q L  ++     L+  Y+    + +  V   G    GNG    WML
Subjt:  PEAFLQ-LNNNI---IALENSYNPTEVTNEENVVNSG--ADGNGLSSHWML

AT5G15800.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein3.2e-5654.37Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEA-SLPPKDTERWYQEYLKLKA
        MGRGRVELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELS+LCDAEVALIIFS RGKLYEF SS ++ KTL+RY++ SYG++E  + P K+ E  Y+EYLKLK 
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEA-SLPPKDTERWYQEYLKLKA

Query:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEES-SAAIHHT----SWDSSEPN--NLQ
          E LQ  QR  LGE+L  L +KEL+QLE QL+ SLKQ+RS K Q M DQLSDLQ KE  LLETN+AL  KL++      HH      W+  E N     
Subjt:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEES-SAAIHHT----SWDSSEPN--NLQ

Query:  YCRQPEAFLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGA---DGNGLSSHWML
        +  Q +   Q       L+  Y+   V +E+    + A    GNG    WML
Subjt:  YCRQPEAFLQLNNNIIALENSYNPTEVTNEENVVNSGA---DGNGLSSHWML

AT5G15800.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein5.4e-5663.59Show/hide
Query:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEA-SLPPKDTERWYQEYLKLKA
        MGRGRVELK+IENKINRQVTF KRRNGLLKKAYELS+LCDAEVALIIFS RGKLYEF SS ++ KTL+RY++ SYG++E  + P K+ E  Y+EYLKLK 
Subjt:  MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEA-SLPPKDTERWYQEYLKLKA

Query:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEES-SAAIHHT----SWDSSEPN
          E LQ  QR  LGE+L  L +KEL+QLE QL+ SLKQ+RS K Q M DQLSDLQ KE  LLETN+AL  KL++      HH      W+  E N
Subjt:  EVEALQYSQRRFLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEES-SAAIHHT----SWDSSEPN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAGGGGAAGAGTAGAGTTGAAGAAGATAGAGAACAAAATAAATCGACAAGTTACATTCACAAAAAGAAGAAATGGACTTCTTAAAAAGGCTTATGAGCTATCCAT
TTTGTGTGATGCTGAAGTTGCTTTGATCATCTTCTCCGCTCGTGGCAAACTCTATGAATTCTCAAGCTCTCCCAGTATAGCCAAGACACTGGAGAGGTATGAAAGGCATA
GCTATGGTGCACTGGAAGCCTCCCTCCCTCCAAAGGACACTGAGAGATGGTATCAAGAGTATTTGAAGCTGAAAGCAGAAGTGGAAGCTTTACAATATTCACAAAGACGA
TTTCTGGGAGAAGAACTGGATGATTTGGAGACTAAGGAATTGGACCAACTAGAAATTCAATTGGAAATGTCTCTAAAGCAAATTAGATCTACTAAGAGACAAACGATGTT
TGATCAATTATCTGATCTCCAAAAAAAGGAAGATAAACTGCTGGAAACAAATCAAGCTTTGAGGAAGAAGTTGGAGGAAAGTAGTGCAGCTATTCATCATACATCATGGG
ATTCTTCAGAGCCCAACAATTTGCAATACTGCAGACAACCTGAGGCCTTTCTTCAACTCAATAACAATATTATTGCATTGGAAAATAGTTACAATCCAACTGAAGTTACA
AATGAAGAAAATGTTGTGAACTCTGGGGCAGATGGCAATGGTTTGTCTTCACATTGGATGCTGCTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGTGAGCATCGAACCATCAACCTAAAATGACGGAGAAGATGTATATCTCAACCGACATAAAGTTAAGAAGGTAATGGGGTGGGGTTCTCTTTTCCTCTTTCATGATTTT
GTTTATATATGTATATTTTTCTATCTCTCTAGGGTTTTGGGAAGTGTGGGGGAGAGAGAGTTATAAATAGGAGAATTGTGATGAAAATTTAAAGAGGGAGATATAAGGAA
GGAAGGAAGGAAGAAAGAAAAGAATGGGAAGGGGAAGAGTAGAGTTGAAGAAGATAGAGAACAAAATAAATCGACAAGTTACATTCACAAAAAGAAGAAATGGACTTCTT
AAAAAGGCTTATGAGCTATCCATTTTGTGTGATGCTGAAGTTGCTTTGATCATCTTCTCCGCTCGTGGCAAACTCTATGAATTCTCAAGCTCTCCCAGTATAGCCAAGAC
ACTGGAGAGGTATGAAAGGCATAGCTATGGTGCACTGGAAGCCTCCCTCCCTCCAAAGGACACTGAGAGATGGTATCAAGAGTATTTGAAGCTGAAAGCAGAAGTGGAAG
CTTTACAATATTCACAAAGACGATTTCTGGGAGAAGAACTGGATGATTTGGAGACTAAGGAATTGGACCAACTAGAAATTCAATTGGAAATGTCTCTAAAGCAAATTAGA
TCTACTAAGAGACAAACGATGTTTGATCAATTATCTGATCTCCAAAAAAAGGAAGATAAACTGCTGGAAACAAATCAAGCTTTGAGGAAGAAGTTGGAGGAAAGTAGTGC
AGCTATTCATCATACATCATGGGATTCTTCAGAGCCCAACAATTTGCAATACTGCAGACAACCTGAGGCCTTTCTTCAACTCAATAACAATATTATTGCATTGGAAAATA
GTTACAATCCAACTGAAGTTACAAATGAAGAAAATGTTGTGAACTCTGGGGCAGATGGCAATGGTTTGTCTTCACATTGGATGCTGCTTTGATATATATATATATTTCCA
AATAAATTTGCAAAAACAAAAAAACCATAAGTCTATTTCAATCCATTCAATATTGTAATACTAATAATAATATATTTATGAACCTTATAATTATCTATTGGACATGCTTC
TGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRGRVELKKIENKINRQVTFTKRRNGLLKKAYELSILCDAEVALIIFSARGKLYEFSSSPSIAKTLERYERHSYGALEASLPPKDTERWYQEYLKLKAEVEALQYSQRR
FLGEELDDLETKELDQLEIQLEMSLKQIRSTKRQTMFDQLSDLQKKEDKLLETNQALRKKLEESSAAIHHTSWDSSEPNNLQYCRQPEAFLQLNNNIIALENSYNPTEVT
NEENVVNSGADGNGLSSHWMLL