; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G21060 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G21060
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH79
Genome locationChr6:19113368..19116334
RNA-Seq ExpressionCSPI06G21060
SyntenyCSPI06G21060
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038884167.1 transcription factor BHLH089-like [Benincasa hispida]6.3e-14990.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KG05 BHLH domain-containing protein1.8e-165100Show/hide
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A0A1S3CNW1 transcription factor bHLH793.7e-16398.32Show/hide
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A0A5A7TTF0 Transcription factor bHLH793.7e-16398.32Show/hide
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A0A6J1G465 transcription factor BHLH094-like5.2e-13382.89Show/hide
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A0A6J1KBN0 transcription factor BHLH094-like1.1e-13081.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JXE7 Transcription factor BPE2.4e-5051.17Show/hide
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          S K+ ST             ++   KR K     D+  + K EAE    +TEQ  Q    +P +DYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
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        QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSR+ PGIEVFPPK+
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Q69WS3 Transcription factor BHLH0941.0e-5653.21Show/hide
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        D  P+LA  +    H+  HF   ++   + S +         R   G G  + R D+   D D  KV STS  +         +D+   KR+K     D 
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        SMKLEAVNS +  GI  FP KD+G Q ++T  G+ F  Q TRE+++GS+ EWLHMQIG  +ER T
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Q84T08 Transcription factor BHLH0892.1e-5961.19Show/hide
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        G G  ++R+      + DS ++ STS G     + +   DS  KR K +    DN   +TEAE  S    K+   + P PE PKQDYIHVRARRGQATDS
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        HSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKA VLDEIINYIQ+LQRQVEFLSMKLEAVN+ +  GIE FPPKD+G Q ++T  G+ F  Q  REY++G
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Query:  SSP-EWLHMQIGGGFERTT
        S+P EWLHMQIGG +ER T
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Q9FJL4 Transcription factor bHLH782.8e-3552.85Show/hide
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        A+ +PEV+P        ++R     G SK+   S    SP  S T+  N     S +  + GGKR +     +D+ E + E E   G    N++P PE P
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Query:  KQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVN-SRIGPGIEVFPPKD
        K DYIHVRARRGQATDSHSLAER RREKI ERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN +R+   ++    KD
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Q9LV17 Transcription factor bHLH791.1e-5248.71Show/hide
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        MDPP L+N  SF     ANP  + + LSEIW FP++       SG  LA+    +     H G+  +   E S    L          G G S+K RD  
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Query:  SDQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHES--KTEAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARR
        S+ DS K VSS+S+GN          +SG K+ K       N +   + E E  SG      TEQ ++P   +P +DYIHVRARRGQATD HSLAERARR
Subjt:  SDQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHES--KTEAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARR

Query:  EKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHM
        EKISE+M  LQD++PGCNK+IGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLE VNS    GP I VFP  D G    D     +  Q   E +R S PEWLHM
Subjt:  EKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHM

Query:  QIGGGFERTT
        Q+ G F RTT
Subjt:  QIGGGFERTT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G59640.1 BIG PETAL P2.5e-7154.18Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSD
        MDP  ++N+              PFNL+EIW FP++G ++  DS      R + +  N   FGD  +          +   L Q +  G   + KRR+ +
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSD

Query:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
          S K+ ST             ++   KR K     D+  + K EAE    +TEQ  Q    +P +DYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
Subjt:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL

Query:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIG-GGFERTT
        QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSR+ PGIEVFPPK++GQQ F+   + FGSQ+TREYSRG+SPEWLHMQIG GGFERT+
Subjt:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIG-GGFERTT

AT1G59640.2 BIG PETAL P1.7e-5151.17Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSD
        MDP  ++N+              PFNL+EIW FP++G ++  DS      R + +  N   FGD  +          +   L Q +  G   + KRR+ +
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSD

Query:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
          S K+ ST             ++   KR K     D+  + K EAE    +TEQ  Q    +P +DYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
Subjt:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL

Query:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD
        QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSR+ PGIEVFPPK+
Subjt:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD

AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.1e-3354.12Show/hide
Query:  SDQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSG--GKRVKT--------AACRDDNHESKTEAEP-RSGKTEQNSQPTPE-QPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAE
        +++  P+VSS+       ++  AG  SG   ++ KT        A       E K +++P R  K+E+N   T    P +DYIHVRARRGQATDSHSLAE
Subjt:  SDQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSG--GKRVKT--------AACRDDNHESKTEAEP-RSGKTEQNSQPTPE-QPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAE

Query:  RARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD
        R RREKISERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN+R+   ++    KD
Subjt:  RARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD

AT5G48560.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.0e-3652.85Show/hide
Query:  AIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSD-QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQP
        A+ +PEV+P        ++R     G SK+   S    SP  S T+  N     S +  + GGKR +     +D+ E + E E   G    N++P PE P
Subjt:  AIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSD-QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQP

Query:  KQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVN-SRIGPGIEVFPPKD
        K DYIHVRARRGQATDSHSLAER RREKI ERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN +R+   ++    KD
Subjt:  KQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVN-SRIGPGIEVFPPKD

AT5G62610.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.1e-5448.71Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRD--
        MDPP L+N  SF     ANP  + + LSEIW FP++       SG  LA+    +     H G+  +   E S    L          G G S+K RD  
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRD--

Query:  SDQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHES--KTEAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARR
        S+ DS K VSS+S+GN          +SG K+ K       N +   + E E  SG      TEQ ++P   +P +DYIHVRARRGQATD HSLAERARR
Subjt:  SDQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHES--KTEAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARR

Query:  EKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHM
        EKISE+M  LQD++PGCNK+IGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLE VNS    GP I VFP  D G    D     +  Q   E +R S PEWLHM
Subjt:  EKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHM

Query:  QIGGGFERTT
        Q+ G F RTT
Subjt:  QIGGGFERTT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCCACCTACTCTCATCAACCAACCTTCATTTCCAACTACCCCTAATGCCAATCCCAATATCACCCCTTTCAATCTTTCTGAGATCTGGCACTTCCCAATTCATGG
CGGAACCTCCGTTGAGGATTCTGGGCCTGCTCTTGCCCTCAGGATGGCTCATCTCGCTCATAATTTGACCCACTTTGGAGACATTGCCATTGGGAATCCAGAGGTTTCCC
CTACTGACTCACTTCCCTTGCAATTGCAGCAGAGACTACCTCATGGTCATGGCGTTTCCAAGAAGCGCCGTGATTCAGACCAAGATTCGCCTAAAGTCAGTTCCACCAGT
AATGGCAACAATGCCAATGCCAATAGCAGCGCTGGGAATGATTCTGGTGGAAAGCGCGTTAAAACAGCGGCGTGTAGAGATGATAATCACGAATCCAAAACAGAAGCGGA
ACCCAGATCTGGGAAGACCGAACAGAACTCCCAGCCTACTCCAGAACAACCCAAACAGGATTACATCCATGTGCGAGCGAGAAGGGGCCAAGCAACTGATAGCCATAGTC
TGGCCGAAAGGGCTAGAAGAGAAAAGATAAGTGAGAGAATGAAAATTCTACAAGATTTGGTCCCTGGGTGCAATAAGGTGATTGGAAAAGCGCTTGTACTTGATGAGATA
ATAAATTACATTCAATCTCTTCAGCGTCAGGTTGAGTTTTTGTCGATGAAACTGGAAGCAGTTAATTCCCGAATTGGCCCTGGCATTGAAGTGTTTCCTCCAAAAGATTA
TGGTCAACAAACATTCGATACAACCGGCGTTGCGTTTGGTTCACAAGCAACAAGAGAATACAGCCGTGGCTCATCACCAGAATGGTTGCATATGCAGATTGGTGGTGGTT
TCGAAAGAACGACGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAAATATAGAGAGGGATAAATTGATGGGAGAGAAAAGGTGAAGAGAAAAGAAAAAGGATTGACTGAATGGGAGAGGGGTATTTGATTCCTGAGTGCGAACCAACCTACA
ATGTCCAAAGGAGCTTCATGACATAAATACAACTCTCTTCTTCTTCCTTTTTCCAACCTACTTAAACTCCAAATCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTT
TGTTTTTTCAACTCAACTCACAGTACAGCTCAAACAAAACTCGAGCTTTTCCATTAATCTCACCTTCATCCTTTTCCATTCCTGGCTTATATATATACTATCATGGGTTT
ACTTCTACTGCTTTTTCAAACTTGAATCCACCCACAGGCCACAACACACACTACCTTTCGTCAAATGACATGGATCCACCTACTCTCATCAACCAACCTTCATTTCCAAC
TACCCCTAATGCCAATCCCAATATCACCCCTTTCAATCTTTCTGAGATCTGGCACTTCCCAATTCATGGCGGAACCTCCGTTGAGGATTCTGGGCCTGCTCTTGCCCTCA
GGATGGCTCATCTCGCTCATAATTTGACCCACTTTGGAGACATTGCCATTGGGAATCCAGAGGTTTCCCCTACTGACTCACTTCCCTTGCAATTGCAGCAGAGACTACCT
CATGGTCATGGCGTTTCCAAGAAGCGCCGTGATTCAGACCAAGATTCGCCTAAAGTCAGTTCCACCAGTAATGGCAACAATGCCAATGCCAATAGCAGCGCTGGGAATGA
TTCTGGTGGAAAGCGCGTTAAAACAGCGGCGTGTAGAGATGATAATCACGAATCCAAAACAGAAGCGGAACCCAGATCTGGGAAGACCGAACAGAACTCCCAGCCTACTC
CAGAACAACCCAAACAGGATTACATCCATGTGCGAGCGAGAAGGGGCCAAGCAACTGATAGCCATAGTCTGGCCGAAAGGGCTAGAAGAGAAAAGATAAGTGAGAGAATG
AAAATTCTACAAGATTTGGTCCCTGGGTGCAATAAGGTGATTGGAAAAGCGCTTGTACTTGATGAGATAATAAATTACATTCAATCTCTTCAGCGTCAGGTTGAGTTTTT
GTCGATGAAACTGGAAGCAGTTAATTCCCGAATTGGCCCTGGCATTGAAGTGTTTCCTCCAAAAGATTATGGTCAACAAACATTCGATACAACCGGCGTTGCGTTTGGTT
CACAAGCAACAAGAGAATACAGCCGTGGCTCATCACCAGAATGGTTGCATATGCAGATTGGTGGTGGTTTCGAAAGAACGACGTAGTCTAGGAAATTCTCTCAACCATTA
TTACTAATAAAAGCAAGAAAGGAGGGTGTTATTCGACCTCTAGTAGAGCTCTCAACAAGTATAGTCCATATGGAAAAAAAAAATCAAAGGTAGACTTAATTTTCACATTC
AGGGATGAAGATATGGATGCTGTTCATAGATCTGCTTTTAAGTTAGTGATTGAACATCTGTTAATGTGTTGGAAAGTAGATTCTCTGATATCTCTGCCTCATAAACTCCT
CCATATAAATACTAAAAAGTTAACCTGCTGAACAAGCATTATTCTTGTGAAAAATAAAGTATTGCTTGGAATTAAGTTTCAGCATTATTGTCATTGTTGCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSDQDSPKVSSTS
NGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEI
INYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIGGGFERTT