; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G22330 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G22330
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionglycine-rich cell wall structural protein 1-like
Genome locationChr6:20254780..20256292
RNA-Seq ExpressionCSPI06G22330
SyntenyCSPI06G22330
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571715.1 hypothetical protein SDJN03_28443, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-3760.95Show/hide
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        M RGG A G + GRGG+  G +LGRGG+A+G TIGRGGEA          LGE MGRGGEA+G  +GR GG+A+G T+GRGGEA+G + GRGGK  GE++
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Query:  GRGGEALGETMGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRG
        GRGGEA+G  +GRGG AIG   GRGG AMG +LGRGG+ +GE MGRGG+AIG + GRGG+A+G  +GRG
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TYK13397.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]4.2e-5271.93Show/hide
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        RGG A G+I GRGG+  G+ILGRGGEA+GE +GRGGEA+GE +GRGGEALGE +GR GGEA+GE +GRGGEA+GEI GRGGKA GEILGRGGEA+GE +G
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Query:  RGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETM-------------GRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGV
        RGGK IGEIFGRGG AMGEI GRGGE +GE +             GRGGKAIGEIFGRGG+AIGEI GRGV
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XP_011658456.2 chromatin target of PRMT1 protein [Cucumis sativus]7.8e-5187.41Show/hide
Query:  MRRGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGET
        MRRG GAHGKIFGRGGKVTGKIL RGGEALGETIGRGGEALGE  GRGG+A GE +GR GGEALGETMGRGG+A+GEI GRGG+A GEILGRGGE LGET
Subjt:  MRRGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGET

Query:  MGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMG
        MGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGE  G
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XP_016900727.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1-like [Cucumis melo]4.3e-4161.05Show/hide
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        G+I GRGG+ TG+I+GRGGEA+GE +GRGG+A+GE +GRGGEA+GE +GRGG + +GE  GRGGEA+GEIFGRGG+A GEILGRGG+A+GE +GRGG+AI
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Query:  GEIF----GRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGEEDVVTGEEEEEGVV
        GEIF    GRGG+A+GEI GRGG+ +GE  GR G +IG + GRGG  +G I G G G    + G     G+V
Subjt:  GEIF----GRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGEEDVVTGEEEEEGVV

XP_031742894.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis sativus]1.9e-4962.04Show/hide
Query:  MRRGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGET
        M RGG A G+IFGRGG+  G+ILGRGGE LGET+GRGG+A+GE  GRGG A+GE +GR GGE LGETMGRGG+A+GEIFGRGG+A GEILGRGGE LGET
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Query:  MGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGEEDVV--TGEEEEEGVVTEEGEGEVVVSEEEEGLVTEEE
        MGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVG   ++   G+   E +    G G+        G      
Subjt:  MGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGEEDVV--TGEEEEEGVVTEEGEGEVVVSEEEEGLVTEEE

Query:  EGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGVVTEEEEG
         G  V      G       G  V      G       G  V      G      EGEVVVSEEEEGVVTEEEEG
Subjt:  EGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGVVTEEEEG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein2.1e-6277.22Show/hide
Query:  MRRGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRG---------------------GGEALGETMGRGGEALGEIF
        MRRG GAHGKIFGRGGK TG+ILGRGGEALGE  GRGG A+GE +GRGGE LGETMGRG                     GGE LGETMGRGG+A+GEIF
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Query:  GRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRG
        GRGG+A GEILGRGGE LGETMGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGG A+GE++GRG
Subjt:  GRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRG

A0A1S4DXM4 glycine-rich cell wall structural protein 1-like2.1e-4161.05Show/hide
Query:  GKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAI
        G+I GRGG+ TG+I+GRGGEA+GE +GRGG+A+GE +GRGGEA+GE +GRGG + +GE  GRGGEA+GEIFGRGG+A GEILGRGG+A+GE +GRGG+AI
Subjt:  GKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAI

Query:  GEIF----GRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGEEDVVTGEEEEEGVV
        GEIF    GRGG+A+GEI GRGG+ +GE  GR G +IG + GRGG  +G I G G G    + G     G+V
Subjt:  GEIF----GRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGEEDVVTGEEEEEGVV

A0A5A7UQF2 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like1.1e-2659.21Show/hide
Query:  RGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILG
        RGG+  GE  GRG + +GE   RGG+ +GE  GR GG+ +GE  GRG + +GE  GRG +A GEILGR GEA+GE  GRGG+A+GEI GR G AMGEILG
Subjt:  RGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILG

Query:  RGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGEEDVVTGEEEEEGVV
        RGGE LGE +GRGG+AIGEI GRGG A+GEI+GRG     +V G     G+V
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A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like2.0e-5271.93Show/hide
Query:  RGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMG
        RGG A G+I GRGG+  G+ILGRGGEA+GE +GRGGEA+GE +GRGGEALGE +GR GGEA+GE +GRGGEA+GEI GRGGKA GEILGRGGEA+GE +G
Subjt:  RGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMG

Query:  RGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETM-------------GRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGV
        RGGK IGEIFGRGG AMGEI GRGGE +GE +             GRGGKAIGEIFGRGG+AIGEI GRGV
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A0A6I5HA58 Uncharacterized protein (Fragment)5.6e-1042.38Show/hide
Query:  RGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEIFG
        RGG   G +L RGG A G+ + RGG A G+ + RGG A G+ + RGG  A G+ + RGG A G++  RGG A G++L RGG A G+ + RGG A G++  
Subjt:  RGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEIFG

Query:  RGGRAMGEILGRGGE-TLGETMGRGGKAIGEI-FGRGGNAIGEIVGRGVGE
        RGG A G++L RGG   + E  G  G  +    F  GG     + G G  E
Subjt:  RGGRAMGEILGRGGE-TLGETMGRGGKAIGEI-FGRGGNAIGEIVGRGVGE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G15400.1 anther 202.6e-0436.03Show/hide
Query:  TGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMG---RGGEALGETMGRGGGEALGETMG-RGGEALGEIFG-RGGKATGEILGRGGE---ALGETMGRGGKA--I
        T K +G G   +G   G GG  +G  +G    GG   GE +G  GG   GE +G  GG   GE  G  GG   GE +G GG     +GE +G G      
Subjt:  TGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMG---RGGEALGETMGRGGGEALGETMG-RGGEALGEIFG-RGGKATGEILGRGGE---ALGETMGRGGKA--I

Query:  GEIFGRGGRAMGEILGRG---GETLGETMGRGGKAI
        G + G  G   GE +G+G   GE +G  +G+GG ++
Subjt:  GEIFGRGGRAMGEILGRG---GETLGETMGRGGKAI

AT3G15400.2 anther 202.6e-0436.03Show/hide
Query:  TGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMG---RGGEALGETMGRGGGEALGETMG-RGGEALGEIFG-RGGKATGEILGRGGE---ALGETMGRGGKA--I
        T K +G G   +G   G GG  +G  +G    GG   GE +G  GG   GE +G  GG   GE  G  GG   GE +G GG     +GE +G G      
Subjt:  TGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMG---RGGEALGETMGRGGGEALGETMG-RGGEALGEIFG-RGGKATGEILGRGGE---ALGETMGRGGKA--I

Query:  GEIFGRGGRAMGEILGRG---GETLGETMGRGGKAI
        G + G  G   GE +G+G   GE +G  +G+GG ++
Subjt:  GEIFGRGGRAMGEILGRG---GETLGETMGRGGKAI

AT3G23450.1 unknown protein1.5e-0439.38Show/hide
Query:  RGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMG
        +GGG  G I G+GG + G I   GG   G   G+GG  +G  +G+GG  +G   G G G  +G  +G+GG  +G  FG+GG   G I G GG   G   G
Subjt:  RGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMG

Query:  RGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGET-LGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVG
        +GG   G I   GG   G   G+GG    G   G+GG   G  FG GG   G   G G+G
Subjt:  RGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGET-LGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGACGAGGTGGTGGGGCTCATGGTAAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGTTACAGGCAAAATATTGGGACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATTGGGCGAGG
TGGTGAAGCTCTAGGTGAAACAATGGGGCGAGGTGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGGGGTGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTGAAG
CTCTTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGCTACAGGCGAAATATTAGGACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAG
ATATTTGGACGGGGTGGTAGAGCTATGGGCGAAATACTGGGACGAGGGGGTGAAACTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAGATATTTGGACG
GGGTGGTAATGCTATTGGTGAAATAGTTGGACGAGGTGTTGGTGAGGAGGACGTGGTGACGGGGGAGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGGGGAGGGGGAGG
TCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTC
GTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGT
GGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGG
TGTCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTG
TCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTT
GGAGGAGGAGGAGGACGTGGTGACGGAGGTGGAGGAGGAGGACGAAGAGGAAATGGAAAAGGAGGGAGTC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGACGAGGTGGTGGGGCTCATGGTAAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGTTACAGGCAAAATATTGGGACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATTGGGCGAGG
TGGTGAAGCTCTAGGTGAAACAATGGGGCGAGGTGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGGGGTGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTGAAG
CTCTTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGCTACAGGCGAAATATTAGGACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAG
ATATTTGGACGGGGTGGTAGAGCTATGGGCGAAATACTGGGACGAGGGGGTGAAACTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAGATATTTGGACG
GGGTGGTAATGCTATTGGTGAAATAGTTGGACGAGGTGTTGGTGAGGAGGACGTGGTGACGGGGGAGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGGGGAGGGGGAGG
TCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTC
GTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGT
GGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGG
TGTCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTG
TCGGAGGAGGAGGAGGGCGTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTCGGAGGAGGAGGAGGGCTTGGTGACGGAGGAGGAGGAGGGGGAGGTCGTGGTGTT
GGAGGAGGAGGAGGACGTGGTGACGGAGGTGGAGGAGGAGGACGAAGAGGAAATGGAAAAGGAGGGAGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRRGGGAHGKIFGRGGKVTGKILGRGGEALGETIGRGGEALGETMGRGGEALGETMGRGGGEALGETMGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGE
IFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGEEDVVTGEEEEEGVVTEEGEGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEV
VVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVSEEEEGVVTEEEEGEVVVSEEEEGVVTEEEEGEVVVSEEEEGVVTEEEEGEVVVSEEEEGVVTEEEEGEVVV
SEEEEGVVTEEEEGEVVVSEEEEGLVTEEEEGEVVVLEEEEDVVTEVEEEDEEEMEKEGV