; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G22470 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G22470
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionSignaling peptide TAXIMIN 1
Genome locationChr6:20357668..20360013
RNA-Seq ExpressionCSPI06G22470
SyntenyCSPI06G22470
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022930666.1 uncharacterized protein LOC111437071 [Cucurbita moschata]1.1e-3393.51Show/hide
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A0A0A0KGH9 Uncharacterized protein7.6e-36100Show/hide
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A0A1S3BLY0 uncharacterized protein LOC1034912881.3e-3598.7Show/hide
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A0A6J1ER78 uncharacterized protein LOC1114370715.5e-3493.51Show/hide
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A0A6J1GJJ0 uncharacterized protein LOC1114548655.5e-3496.1Show/hide
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A0A6J1I283 uncharacterized protein LOC1114683581.2e-3393.51Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82275 Signaling peptide TAXIMIN 17.9e-3081.82Show/hide
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Q1G309 Signaling peptide TAXIMIN 25.1e-2156.94Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20562.1 unknown protein3.6e-2256.94Show/hide
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AT2G31090.1 unknown protein5.6e-3181.82Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTTGTGGAGATGGCGATTGTAGGCCACTCGGCTTCTTGCTTGGCTTGCCTTTTGCTTTCGTTTCTCTTATCCTTTCCATTATCGGCGTAATTATATGGATTGTGGG
ATTGACGCTTACTTGCATATGTCCTTGTTGTTTGTGCTTAACGGTGATAGTGGAGCTTGCTTTGGAGCTGATCAAAGCCCCATTTCATGTCATGGAGTGGTTCACCTCTC
AGATTCCTTGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGCTCTAACCACTCTGTATTATTGACATTGAGAAGTTTGATTTGGGAAATACAAAATTTTGATTATATAATGAAATTTTGTATTGGAAAAGCAAACCTTTCCGTCGTCA
TCTAAGACTTCCTTTGTCCAAAAGTCAATTATACTCTGTTTATCTCTACACTTTTTGGTCCAAACTCCAAAACCCATTCATTAAAATATATATAACCAACACAAAAGAAT
CGCATTCACAAACACAAAACCCATCTGTTACACATTCTTCTTGATTTCTCAGCATCTTTTTTCTTCTTTCAGCAAAGGGATTCATTCGATCAACCCAAAATTCAGAAGAT
ATGTGTTGTGGAGATGGCGATTGTAGGCCACTCGGCTTCTTGCTTGGCTTGCCTTTTGCTTTCGTTTCTCTTATCCTTTCCATTATCGGCGTAATTATATGGATTGTGGG
ATTGACGCTTACTTGCATATGTCCTTGTTGTTTGTGCTTAACGGTGATAGTGGAGCTTGCTTTGGAGCTGATCAAAGCCCCATTTCATGTCATGGAGTGGTTCACCTCTC
AGATTCCTTGTTGATTGTTCATATTTATCAAAGAGGAAAGTGGGAGAAGCATTATAGTGTGTAATTAGATTACCTTGTTTGTGTGAGATTTACATTTGATATGAATATGA
AGCTTTGTGTGTTCTTTGCTTCATTGTAATAGCCTTCCATTGATTGTTTATTTCGTCGATAATCAATATAGAATTGATGTTCTGTTTTACAATATTTCTGGAATGCAAAT
TTTATTCTCTAGAGATTGGTTTTATGATTTGTGAGGCTACTAGGATAGAAATTCTATGTAAATTATTGTGCTTTTAGGGGTGAACATGACAGAAAACAGTTCTTAAGGCT
CTTCCTCGTCTGTCTCATGATCATCCAGCTTCCAAAAGCCATCAGCATCTTGTACCATTCCTTTGTTTTGAGCACACCACCATGATTCAGGCACTAAATACTCTTCCTTG
AGAGCATTCAAAGCTTTGTTCACACGTGCTATGTCCCTTTTCACTTCTAACGTGAATCCACCTTCATTTCCCTGTGTTCCTGCCACCCCATGTAGATAAGCCTCCAAAGA
ATGCCAGCTCTTGAAACCTCCGGGACTCTTCAAGTATTCTGACTTTCGTGTGTCAATTATCAGCTCCTCTCCAACTTTCGCATAACCCGTCAGTGGGTAATCCGGTACTA
TGTCGGCCTTGTTTCGAGTTCGCAGCAGATGAAGCTCATTCATGGAGTTAAATGTCTTTCTGAAGTTGCGGTCTCCTACATGTGGACTGCCAAACAAAAAGACTGTAACA
GGGCAGGGTTTCTGCGGTTGCTTTTTCCCCCTATTGATCTGATTTGCAATAATGTCTGTTGCATTCAAGGTTCCAAGGGCAGCACCTAAACTATGTCCTGTTATAGTTAT
ACTGATATCTTCATCTTGAAATTCTTCTAGTAGCTTCTCAATTTCAGATAGAACCTGATCATTTAGATGATAGAATATAGTTAGTGATATATATATATATAGAGAGAGAG
AGAATATAGTTAGCAACTCACTTGCTGTCTTGCACTGTTTGTGTTAAACGGTGATCGAGCATCTTGAGAAGTGTAAATGGAAAGCCAGCCTTTATGAACTTTAGAATCAT
TAGATGCTCCAAATAGTTTGTCGGCAGGAACAAGAGGAAATTCAAAGTCATTAACCCATTCCAATGCTTGTATTGTTCCTCTCCAAGCAATTACAATGTCCCTTCTTCCC
AGTGCAGCCTTTCCTTCATCGGTCGCCACAGCAATGTACCCTATCCAATTGGACTCTTTGTTCCATGCTTCCCTTGATAGAGACCTTAATAAAAACGCTTCTGAAACTTC
AATCCCTGATGTTGCATAGAGAAATTTGGTGATATTATACTTGTAGGGGTTGGCAATAGCTAAACCAACTCTGGAGAAGAGGTTCTTCCTTGAAAAATGGCTGTCGCCAG
CAAATTTTGACAACCTGTTCGAGTTGAAACTATCATATGTTGCCTGTGCCATATCTCCATAGTGAAGAATGTATTGTCGAAGATCGATGTCCAAAGGGTCTAAGAGGTTC
TTCCAGTTATCCTCGCCACTGAGCAACCTCCATCTAGTAGCTATGTTACCTATCATTTTCTCAGACGTGCCTACTCCCTCCGGTTGTAACTGTGTTCCTATTCTCTGTTC
TCTAAAGTACATAATGCAACAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCCGDGDCRPLGFLLGLPFAFVSLILSIIGVIIWIVGLTLTCICPCCLCLTVIVELALELIKAPFHVMEWFTSQIPC