; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G22880 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G22880
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionprotodermal factor 1-like isoform X1
Genome locationChr6:20659363..20661522
RNA-Seq ExpressionCSPI06G22880
SyntenyCSPI06G22880
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039923 - Protodermal factor 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647347.1 hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus]1.6e-23089Show/hide
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XP_011657562.2 protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus]2.8e-22784.12Show/hide
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        ANEGRFKPRT
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XP_016900774.1 PREDICTED: protodermal factor 1-like isoform X1 [Cucumis melo]1.7e-19583.52Show/hide
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                 GGGYYSPPTYDPT   PT+PSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG     
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        NRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+FKPRT
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XP_031743089.1 protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus]1.0e-22987.73Show/hide
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           TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTS   PSTPSGGGGYSSPPTY
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Query:  DPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMG
        DPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMG
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        SAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
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XP_038888912.1 protodermal factor 1-like [Benincasa hispida]1.0e-20081.95Show/hide
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Query:  K----------PPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT----------GGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTP------TP
        K          PPTHDPTPSTPSKPPSG GG+HNPPT          GGGGYYSPP+HDPTPTP TP+     GGGYYSPPS+DPTPTPSTP      TP
Subjt:  K----------PPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT----------GGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTP------TP

Query:  STPSTPSGGGYYSPPTNDP-----TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPT--SPSTPSGGGGYSSPPTYDPTP---TPSTPSGGGGYYSPPTYDP
        STPSTPSGGGYYSPP+ DP     TPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT DPTPT  +PSTPSGGGGY SPPTYDPTP   TPSTPSGGGGYYSPPTYDP
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Query:  ---TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPS---TPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITN
           TPSTPPSGG GY+SPPTFDPTPS   TPPSG          GTPFYGTPP TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITN
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Query:  APGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
        APGFGATLS+PQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVR+SFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGQ1 Uncharacterized protein1.9e-22481.92Show/hide
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        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY SPPSHDPTPTPSTP                                                     
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Query:  ----------------------------------TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGY
                                          TPSTPSGGGYYSPP++DPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT DPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGY
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Query:  YSPPTYDPTPTS---PSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVP
        YSPPTYDPTPTS   PSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVP
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        DPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKA
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        AAAQAQVFQMANEGRFKPRT
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A0A1S4DXR0 protodermal factor 1-like isoform X18.1e-19683.52Show/hide
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        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTP                       TPSTPSG                  
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Query:  TPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPT---PTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG-----
                 GGGYYSPPTYDPT   PT+PSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG     
Subjt:  TPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPT---PTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG-----

Query:  -----GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVN
             GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVN
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Query:  NRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
        NRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+FKPRT
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A0A1S4DYH9 protodermal factor 1-like isoform X21.2e-19482.5Show/hide
Query:  MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MER+LASLLLWT+I+GLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPP+DSHG PPYG+PPPHGSG SHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
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Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTP
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPP++DPTP                                 
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Query:  TPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG--------
                             +PT+PSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG        
Subjt:  TPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG--------

Query:  --GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRY
          GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVNNRY
Subjt:  --GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRY

Query:  PFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
        PFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+FKPRT
Subjt:  PFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT

A0A6J1ES52 protodermal factor 1-like isoform X12.6e-17873.15Show/hide
Query:  MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPT-DSHGNPPYG-SPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPT
        M   LA LLLWTL +GLVS ++AIPLTS  +EDQKTYYTPDPHAGSPP+  S G+PPYG +PPP GSGGSHGGKPP+HGHGGKK  PKPGNCGNPP+TPT
Subjt:  MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPT-DSHGNPPYG-SPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPT

Query:  PSKPPT----------HDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT------------------GGGGYYSPPSHDPTP------------------TPSTPTPSTP
        PSKPP+          ++PTPS PS PPS GGG+++PP+                  GGGGYYSPPS+DPTP                  TPSTPTPS P
Subjt:  PSKPPT----------HDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT------------------GGGGYYSPPSHDPTP------------------TPSTPTPSTP

Query:  SGGGYYSPPSHDPTPTPSTP-TPS--TPSTPS-GGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP-TPTSPSTPS----GGGGYSSPPTYDP
        SGGGYYSPP++DPTPTPSTP TPS  TPS PS GGGYYSPPT DPTPTPSTP+  TPSTPSGGGYYSPPT +P TP++PSTP+      GGY+SPPTYDP
Subjt:  SGGGYYSPPSHDPTPTPSTP-TPS--TPSTPS-GGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP-TPTSPSTPS----GGGGYSSPPTYDP

Query:  TPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP---TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGII
        TPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP   TPSTPPSGG GY+SPP++DP PSTPPSG          GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG I
Subjt:  TPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP---TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGII

Query:  WGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR
        WGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS+VNNRYPFTTN+VR+SFVSALSSN+AAAAQA+VFQMANEGRFKPR
Subjt:  WGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR

A0A6J1EXH4 protodermal factor 1-like isoform X24.8e-18074.85Show/hide
Query:  MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPT-DSHGNPPYG-SPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPT
        M   LA LLLWTL +GLVS ++AIPLTS  +EDQKTYYTPDPHAGSPP+  S G+PPYG +PPP GSGGSHGGKPP+HGHGGKK  PKPGNCGNPP+TPT
Subjt:  MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPT-DSHGNPPYG-SPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPT

Query:  PSKPPT----------HDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT------------------GGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPST--------PSGGGYYSPPS
        PSKPP+          ++PTPS PS PPS GGG+++PP+                  GGGGYYSPPS+DPTPTPSTPTPST        PSGGGYYSPP+
Subjt:  PSKPPT----------HDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT------------------GGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPST--------PSGGGYYSPPS

Query:  HDPTPTPSTP-TPS--TPSTPS-GGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP-TPTSPSTPS----GGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGG
        +DPTPTPSTP TPS  TPS PS GGGYYSPPT DPTPTPSTP+  TPSTPSGGGYYSPPT +P TP++PSTP+      GGY+SPPTYDPTPTPSTPSGG
Subjt:  HDPTPTPSTP-TPS--TPSTPS-GGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDP-TPTSPSTPS----GGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGG

Query:  GGYYSPPTYDP---TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTM
        GGYYSPPTYDP   TPSTPPSGG GY+SPP++DP PSTPPSG          GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTM
Subjt:  GGYYSPPTYDP---TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG----------GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTM

Query:  GSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR
        GS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS+VNNRYPFTTN+VR+SFVSALSSN+AAAAQA+VFQMANEGRFKPR
Subjt:  GSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P13983 Extensin5.7e-0533.79Show/hide
Query:  YTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----PPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYY
        Y+P P    PPT S   P +  P P      H  +PP+H H    H+  P     P + P+P +     P   P P T S PP               Y 
Subjt:  YTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSK----PPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYY

Query:  SPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYS--PPTYDPTPTSPSTPSG
          P   PT +P  PT S P     YSPP    +P+P  PTP+   +P    Y  PPT  P P    P PS+P        YS  PP Y P P    +P  
Subjt:  SPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYS--PPTYDPTPTSPSTPSG

Query:  GGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPST----PPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFT
              PPTY P P PS+P        PPTY+ +P  PP+      +PPT+ P P T    PP+   P    PPT S PP    P  P T
Subjt:  GGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPST----PPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFT

P14918 Extensin2.0e-0537.1Show/hide
Query:  YTPDPHAGSPPTDSHGNPPY--GSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTP----SKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGG
        YTP P    PPT     P Y     PP     +    PP++    K   PKP     P YTP+P    +KPPT  PTP T +  P        PPT    
Subjt:  YTPDPHAGSPPTDSHGNPPY--GSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTP----SKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGG

Query:  YYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPS-TPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPS
          +PP++ P+P P    P TP      +PP++ P+P P TP P+ P+ TPS      PPT  PTP   TP+P  P+ P+     +PPTY P+P  P TP 
Subjt:  YYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPS-TPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPS

Query:  GGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYN-SPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDP
              +PPTY P+P P TP       +PPTY P+P  P +       +PPT+ PTP  PP+   P Y   P  S  P  P P
Subjt:  GGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYN-SPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDP

P24152 Extensin8.3e-0434.48Show/hide
Query:  LILGLVSQNIAIP--LTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPP-YTPTPS-KPPTHDPT
        L+L LV+  +A+      AG      Y TP P            PP   P P         KPP+ GHG K  KP   +   PP YTP+P   PP   P 
Subjt:  LILGLVSQNIAIP--LTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPP-YTPTPS-KPPTHDPT

Query:  PSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPS--TPS-GGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTP
        P+ P+  PS        P      Y PP    TP   TP+P  P+      PP++ PTP P    P TP   TPS       PPT  PTP   TP P  P
Subjt:  PSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPS--TPS-GGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTP

Query:  STPSGGGYYSPPTYDPTPTSPS--------TPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPT-PSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPF
         T        PPT+ P+P  P+        TPS      SPPTY PTP P           PPT  PT P   P        PPT+ P P   P   TP 
Subjt:  STPSGGGYYSPPTYDPTPTSPS--------TPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPT-PSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPF

Query:  YGTPPTTSAPPFVPDPNSP
          TPP +  P   P P  P
Subjt:  YGTPPTTSAPPFVPDPNSP

Q9S728 Protodermal factor 13.7e-5245.26Show/hide
Query:  YGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGG
        Y SPP     GSH G PPS       H P   NCG+PPY          DP+PSTPS P                  SPPSH       TPTPSTPS   
Subjt:  YGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGG

Query:  YYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY
                      TPTP TPS                    TPTP TP    G    SPP++  TP+ PSTPS              PTPS P  GG Y
Subjt:  YYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY

Query:  YSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP---PTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNA
         SPP   P   TPPS        P  D  P TP  GG+P   TP   P T   PF+P P  P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG     ++ 
Subjt:  YSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP---PTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNA

Query:  PGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR
        PGF   ++L QALSNTR+D +G+LYREG A++LNSMVN+++PFTT QVR+ FV+ LSSNKAA  QA  F++ANEGR KPR
Subjt:  PGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR

Q9SN46 Leucine-rich repeat extensin-like protein 58.5e-0939.75Show/hide
Query:  TPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSH
        TP P  GSPP+ S    P  + P   +  S GG PPS         P P     P  TP+P  PPT   TP+    PPS        PT GG   SPPS 
Subjt:  TPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSH

Query:  DPTPTP--STP-TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT-NDPTPT---PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTP-TSPSTPS
          TPTP  S P +P+TPS GG  SPPS   +P+P    PS PSTP+  G  SPP+ + PTP+   PS PTPSTP TP   G  SPP     P T PS PS
Subjt:  DPTPTP--STP-TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT-NDPTPT---PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTP-TSPSTPS

Query:  G---------------GGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTY----DPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPP---F
                        G   SSPP   PTP  S P    GY  PP +     P+P  PP        PPTF P+PS PP     +   PP    PP   +
Subjt:  G---------------GGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTY----DPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPP---F

Query:  VPDPN------SPFTGT
         P P+      SP  GT
Subjt:  VPDPN------SPFTGT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42840.1 protodermal factor 12.6e-5345.26Show/hide
Query:  YGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGG
        Y SPP     GSH G PPS       H P   NCG+PPY          DP+PSTPS P                  SPPSH       TPTPSTPS   
Subjt:  YGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGG

Query:  YYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY
                      TPTP TPS                    TPTP TP    G    SPP++  TP+ PSTPS              PTPS P  GG Y
Subjt:  YYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY

Query:  YSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP---PTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNA
         SPP   P   TPPS        P  D  P TP  GG+P   TP   P T   PF+P P  P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG     ++ 
Subjt:  YSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP---PTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNA

Query:  PGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR
        PGF   ++L QALSNTR+D +G+LYREG A++LNSMVN+++PFTT QVR+ FV+ LSSNKAA  QA  F++ANEGR KPR
Subjt:  PGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR

AT3G19430.1 late embryogenesis abundant protein-related / LEA protein-related2.2e-0740.7Show/hide
Query:  PYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGG
        P   PP   S G  GG   S G  G    P P     PP +P P  P    PTP  P  PP        PPT      S P+   +P P TPTPS PS  
Subjt:  PYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGG

Query:  GYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGG
           SPP   PTPTPS P+P+ P +P       PP   PTPTPS P+P TP  P+      P    P P SP  P+      SPP  D TPTP TPS    
Subjt:  GYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGG

Query:  YYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN
          SPP   PTP TP        SPP   PTP TPPS  TP       + +PP+VP P+
Subjt:  YYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN

AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein6.1e-1039.75Show/hide
Query:  TPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSH
        TP P  GSPP+ S    P  + P   +  S GG PPS         P P     P  TP+P  PPT   TP+    PPS        PT GG   SPPS 
Subjt:  TPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSH

Query:  DPTPTP--STP-TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT-NDPTPT---PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTP-TSPSTPS
          TPTP  S P +P+TPS GG  SPPS   +P+P    PS PSTP+  G  SPP+ + PTP+   PS PTPSTP TP   G  SPP     P T PS PS
Subjt:  DPTPTP--STP-TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT-NDPTPT---PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTP-TSPSTPS

Query:  G---------------GGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTY----DPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPP---F
                        G   SSPP   PTP  S P    GY  PP +     P+P  PP        PPTF P+PS PP     +   PP    PP   +
Subjt:  G---------------GGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTY----DPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPP---F

Query:  VPDPN------SPFTGT
         P P+      SP  GT
Subjt:  VPDPN------SPFTGT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAGAAAACTAGCTTCTCTCCTTCTATGGACTCTAATTCTTGGGTTGGTTTCTCAAAACATAGCTATCCCTTTGACGTCTGCAGGCAACGAAGATCAGAAAACTTA
TTACACTCCAGACCCACATGCAGGAAGCCCGCCCACAGATTCACATGGGAATCCACCTTATGGATCTCCACCACCTCATGGTTCGGGAGGAAGCCATGGAGGAAAACCAC
CCTCTCATGGGCATGGTGGTAAGAAACACAAGCCAAAACCAGGGAACTGCGGCAACCCACCATACACTCCTACTCCGTCAAAACCTCCTACACACGATCCAACCCCATCA
ACTCCATCGAAGCCTCCTTCCGGTGGTGGTGGACATCACAACCCACCCACTGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTCATGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCC
AACGCCATCAACTCCTTCAGGAGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTCATGATCCCACTCCAACTCCATCAACTCCGACACCATCAACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTG
GATACTACAGCCCTCCAACTAATGATCCCACTCCAACTCCATCAACTCCGACACCATCAACTCCCTCTACCCCATCGGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACGTATGAT
CCCACTCCAACGTCACCATCGACTCCTTCCGGTGGTGGTGGATACTCTAGCCCTCCAACTTATGATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGAGGTGGATATTA
TAGCCCACCAACTTATGATCCTACTCCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTGGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCAACACCATCAACTCCTCCTTCAGGTGGTA
CACCATTCTATGGGACCCCACCAACCACATCAGCCCCACCTTTTGTTCCTGATCCCAATTCTCCCTTCACTGGCACATGCAACTATTGGAGGACGCATCCAGGAATAATA
TGGGGTTTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAGTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGGCTTTGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCACTCTCAAACACACGAAC
TGATGGCCTAGGATCACTTTACCGAGAAGGAGCTGCGGCTTTCCTGAACTCCATGGTCAACAACAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGTGAAAGTTTTGTATCGG
CATTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCTAACGAGGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAACTAACCACATAACCTTCTACCTGCAAATATTTACTTCACTCTCTACCTCAGTCCGTCTTTTATATGTATCGTTTAGTCTTCTCATGCATTTTCATCAACAATATATA
ATCCATCGTCTTCCTTTCCTTCCTTCTCAGTAAAACATACATAGCACAATGGAAAGAAAACTAGCTTCTCTCCTTCTATGGACTCTAATTCTTGGGTTGGTTTCTCAAAA
CATAGCTATCCCTTTGACGTCTGCAGGCAACGAAGATCAGAAAACTTATTACACTCCAGACCCACATGCAGGAAGCCCGCCCACAGATTCACATGGGAATCCACCTTATG
GATCTCCACCACCTCATGGTTCGGGAGGAAGCCATGGAGGAAAACCACCCTCTCATGGGCATGGTGGTAAGAAACACAAGCCAAAACCAGGGAACTGCGGCAACCCACCA
TACACTCCTACTCCGTCAAAACCTCCTACACACGATCCAACCCCATCAACTCCATCGAAGCCTCCTTCCGGTGGTGGTGGACATCACAACCCACCCACTGGTGGTGGTGG
ATACTACAGCCCTCCATCTCATGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACGCCATCAACTCCTTCAGGAGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTCATGATCCCACTCCAA
CTCCATCAACTCCGACACCATCAACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACTAATGATCCCACTCCAACTCCATCAACTCCGACACCATCAACT
CCCTCTACCCCATCGGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACGTATGATCCCACTCCAACGTCACCATCGACTCCTTCCGGTGGTGGTGGATACTCTAGCCCTCCAACTTA
TGATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGAGGTGGATATTATAGCCCACCAACTTATGATCCTACTCCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTGGTGGATACAATA
GCCCTCCAACTTTTGATCCAACACCATCAACTCCTCCTTCAGGTGGTACACCATTCTATGGGACCCCACCAACCACATCAGCCCCACCTTTTGTTCCTGATCCCAATTCT
CCCTTCACTGGCACATGCAACTATTGGAGGACGCATCCAGGAATAATATGGGGTTTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAGTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGG
CTTTGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCACTCTCAAACACACGAACTGATGGCCTAGGATCACTTTACCGAGAAGGAGCTGCGGCTTTCCTGAACTCCATGGTCAACA
ACAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGTGAAAGTTTTGTATCGGCATTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCTAACGAGGGT
AGATTCAAGCCTAGAACCTGAAGCAGAATAAATTTACCATACTTGTGAGTGCATTATGTTTAGGGTAGCAAGCCCCACAGTTTGTTTATGTTGTCAAGTATATTACATTT
CCTTCGTGTGCCCCTTATTTTATTCACTAGTGCTACACTGCGATGGATATCATATGTTACATTTCGATGCTTTGCTCGAGCGTTAGTTTTTTTTTTTTAAGAAATCACTG
TTGATCGATCAATTTAAGCCTACTTACCATGCATTTTAAAATAACTCCACAAACGAGATTCATGGTACAAATAATTACAAGAGAAGAGAAAGGAAAGTATTTTCGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MERKLASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDSHGNPPYGSPPPHGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPS
TPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD
PTPTSPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGII
WGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT