CuGenDBv2

Gene ID	CSPI06G23360
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	Chr6:21029485..21031300
RNA-Seq Expression	CSPI06G23360
Synteny	CSPI06G23360
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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KAA0061727.1 FAM210B-like protein [Cucumis melo var. makuwa]

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3.6e-97

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XP_008449587.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491427 [Cucumis melo]

1.4e-93

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XP_023512163.1 uncharacterized protein LOC111776967 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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80.81

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XP_038901803.1 uncharacterized protein LOC120088508 [Benincasa hispida]

2.4e-85

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0KEW3 DUF1279 domain-containing protein

1.7e-97

99.48

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A0A1S3BN10 uncharacterized protein LOC103491427

6.8e-94

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A0A5A7V4A0 FAM210B-like protein

8.1e-95

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A0A5D3B9U1 DUF1279 domain-containing protein

6.8e-94

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A0A6J1JG12 uncharacterized protein LOC111484182

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SwissProt top hits

e value

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Alignment

Q96KR6 Protein FAM210B, mitochondrial

1.2e-07

32.04

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        E   +SK  Q K++  +YG   ++  I +SLIS  + Y ++S+GVD+  +L K+G        K+     TF +AYA HK  +P+R   T+   P++  +
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Query:  IGK
          K
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Q9D8B6 Protein FAM210B, mitochondrial

1.4e-06

31.68

Show/hide

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        GT K  S+  Q K++  +YG   ++  I +SL+S  + Y ++S+G+D+  +L K+G        K+     TF +AYA HK  +P+R   T+   P V  
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Query:  W
        +
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

1.7e-04

29.91

Show/hide

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        KE++ KYG   L    ++S +S S  Y  I   VDV+ LL+K               + + ++E G                G  ALA   +KA  PIR 
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        P T+ALTP +A ++ ++
Subjt:  PPTVALTPIVASWIGKK

AT2G27290.1 Protein of unknown function (DUF1279)

3.6e-55

63.64

Show/hide

Query:  ASSLIAFSSSSNISFTHPNFRFHFNFPNPPLKFNSKPFRVQALKQKTGEIERP-SPSSSS----SADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEE--GEGTN---KS
        A  L+    SS++  T         F +  +  +SK FR +A+++K  +I++  SP SSS    SA+EVTKKYGLE GLWKI SSK++   +G N   KS
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Query:  KGDQAKELLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQVLLQKVGISIDETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKE
        K D+AKELLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCY L+++GVDVQ LL KVGIS +ETGEKVG FALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVA+WIGKKV+KE
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCAACTGCTTCTTCTCTAATTGCCTTCTCATCTTCTTCCAACATTTCTTTTACTCATCCAAATTTCAGATTTCACTTCAATTTTCCTAACCCACCTCTCAAATTCAA
CTCCAAACCTTTCAGGGTTCAAGCCCTTAAACAGAAAACCGGCGAAATCGAACGCCCATCTCCTTCTTCCTCTTCTTCTGCAGATGAAGTTACCAAAAAATACGGACTTG
AAGCTGGTCTTTGGAAGATATTTAGCTCTAAGGAGGAGGGTGAAGGGACAAACAAATCAAAGGGTGATCAAGCAAAAGAGTTGCTAGCAAAATATGGAGGTGCATACTTA
GCCACCTCCATAACTCTATCCTTGATTTCTTTCTCTCTATGTTACGCGCTCATCAGTGCTGGTGTTGACGTTCAAGTTCTTCTGCAGAAGGTAGGAATTTCAATTGATGA
GACAGGAGAGAAAGTTGGAACATTTGCTTTGGCATATGCAGCACATAAAGCTGCTTCTCCAATAAGGTTTCCTCCAACAGTCGCTCTCACTCCAATTGTTGCAAGTTGGA
TTGGGAAGAAAGTAGAGAAAGAGAATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ACCTATTTGGCTAACTTTTTTGTGTTTGGAAGTGTGTGAAGAACAACGGTGGTGACGACAGTCGATTAAGCTTGGAAGCAAATATCTGGCTTATAATGCTTCACATAAAT
TTCTCTTTCTCTCTTGATTTTGTGGGATCCTTGTTTTTTTTTTCTCTCTAAAACCCAAACTCTCAATTCAGAGCCTATGTTTCGTTAATAGATTTTGAGATTCCAACCTT
TAATTTGGTTTTCTGATAATGGCAACTGCTTCTTCTCTAATTGCCTTCTCATCTTCTTCCAACATTTCTTTTACTCATCCAAATTTCAGATTTCACTTCAATTTTCCTAA
CCCACCTCTCAAATTCAACTCCAAACCTTTCAGGGTTCAAGCCCTTAAACAGAAAACCGGCGAAATCGAACGCCCATCTCCTTCTTCCTCTTCTTCTGCAGATGAAGTTA
CCAAAAAATACGGACTTGAAGCTGGTCTTTGGAAGATATTTAGCTCTAAGGAGGAGGGTGAAGGGACAAACAAATCAAAGGGTGATCAAGCAAAAGAGTTGCTAGCAAAA
TATGGAGGTGCATACTTAGCCACCTCCATAACTCTATCCTTGATTTCTTTCTCTCTATGTTACGCGCTCATCAGTGCTGGTGTTGACGTTCAAGTTCTTCTGCAGAAGGT
AGGAATTTCAATTGATGAGACAGGAGAGAAAGTTGGAACATTTGCTTTGGCATATGCAGCACATAAAGCTGCTTCTCCAATAAGGTTTCCTCCAACAGTCGCTCTCACTC
CAATTGTTGCAAGTTGGATTGGGAAGAAAGTAGAGAAAGAGAATTAGTATAATGTCTTAGTAGAGAAAGAGAATTAGTATAATGTCTTACTTTGAGACTACAAAGTTATT
CGTTAGAGTTCTTATATAAAGTTACTTGACAGTGTATATTGGGTTTAATCCTAATCCCATGTAGATTGTATACCAATGAGTTATAATGTGCCCATCCTTTTTGAATCATA
GCTAATGGTTCCGACATTTAGGAGTCTATAAGATTGGTGATTTTACACAATCACTTGGTCATTAAGTAAAATGGAGAATAGAGACATTAATGAAGAATGAAGAAACGAAA
ATCAAGAAAAAGAAGAGGAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MATASSLIAFSSSSNISFTHPNFRFHFNFPNPPLKFNSKPFRVQALKQKTGEIERPSPSSSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEGEGTNKSKGDQAKELLAKYGGAYL
ATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQVLLQKVGISIDETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKEN

CSPI06G23360 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome