; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G26700 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G26700
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionprotein RALF-like 19
Genome locationChr6:23547936..23548701
RNA-Seq ExpressionCSPI06G26700
SyntenyCSPI06G26700
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647467.1 hypothetical protein Csa_004319 [Cucumis sativus]5.8e-3978.57Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSR                       RKNN PCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

XP_004148669.1 protein RALF-like 19 [Cucumis sativus]2.1e-5799.11Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

XP_004150814.1 protein RALF-like 4 [Cucumis sativus]6.0e-3673.91Show/hide
Query:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPY
        LCL LLL+A +A  L +AL  DWTR+Y + PDY F         N  +DSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRG SYYDC KR+KANPY
Subjt:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPY

Query:  RRGCIAITGCARFTD
        RRGCIAITGCARFTD
Subjt:  RRGCIAITGCARFTD

XP_008441015.1 PREDICTED: protein RALF-like 19 [Cucumis melo]7.3e-5089.29Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRS KL LFLL+IAVVAAPLCLA SDDWT +YA  P+YDFT +NEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKR+KANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

XP_016902249.1 PREDICTED: protein RALF-like 4 [Cucumis melo]8.7e-3571.79Show/hide
Query:  KLCL-FLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKAN
        KLCL  LLL+A  AA L +AL  DWTR++ + P+Y F         N  +DSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCR RG SYYDC KR+KAN
Subjt:  KLCL-FLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKAN

Query:  PYRRGCIAITGCARFTD
        PYRRGCIAITGCARFTD
Subjt:  PYRRGCIAITGCARFTD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD7 F3H9.8 protein2.9e-3673.91Show/hide
Query:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPY
        LCL LLL+A +A  L +AL  DWTR+Y + PDY F         N  +DSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRG SYYDC KR+KANPY
Subjt:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPY

Query:  RRGCIAITGCARFTD
        RRGCIAITGCARFTD
Subjt:  RRGCIAITGCARFTD

A0A0A0KHU4 Uncharacterized protein1.0e-5799.11Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

A0A1S3B2H7 protein RALF-like 193.5e-5089.29Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRS KL LFLL+IAVVAAPLCLA SDDWT +YA  P+YDFT +NEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKR+KANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

A0A5A7SVY5 Protein RALF-like 44.2e-3571.79Show/hide
Query:  KLCL-FLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKAN
        KLCL  LLL+A  AA L +AL  DWTR++ + P+Y F         N  +DSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCR RG SYYDC KR+KAN
Subjt:  KLCL-FLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKAN

Query:  PYRRGCIAITGCARFTD
        PYRRGCIAITGCARFTD
Subjt:  PYRRGCIAITGCARFTD

A0A5D3DPV5 Protein RALF-like 193.5e-5089.29Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRS KL LFLL+IAVVAAPLCLA SDDWT +YA  P+YDFT +NEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKR+KANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NME6 Protein RALF-like 196.7e-1444.35Show/hide
Query:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADV---------PDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANP
        L L LL +AVVA     + +  WT + + V          + D+   +E +RR L          +  Y+ Y ALRKNN PC  RGRSYYDCKKRK+ANP
Subjt:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADV---------PDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANP

Query:  YRRGCIAITGCARFT
        YRRGC  IT C R T
Subjt:  YRRGCIAITGCARFT

Q8L9P8 Protein RALF-like 337.7e-1045.07Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F   +E +RR+L            KY+ Y ALR+N  PC  RG SYY+C++  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR

Q945T0 Rapid alkalinization factor1.3e-0946.38Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGC
        +F   +E +RR+L            KY+ Y AL+KN+ PC  RG SYY+CK   +ANPY RGC AIT C
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGC

Q9FZA0 Protein RALF-like 46.1e-1572.34Show/hide
Query:  KYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF
        +Y+GYDAL+KNN PC  RGRSYYDCKKR++ NPYRRGC AIT C R+
Subjt:  KYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.7e-0943.66Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F   +E +RR+L            +Y+ Y ALR+N  PC  RG SYY+C++  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28270.1 ralf-like 44.3e-1672.34Show/hide
Query:  KYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF
        +Y+GYDAL+KNN PC  RGRSYYDCKKR++ NPYRRGC AIT C R+
Subjt:  KYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF

AT2G33775.1 ralf-like 194.8e-1544.35Show/hide
Query:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADV---------PDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANP
        L L LL +AVVA     + +  WT + + V          + D+   +E +RR L          +  Y+ Y ALRKNN PC  RGRSYYDCKKRK+ANP
Subjt:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADV---------PDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANP

Query:  YRRGCIAITGCARFT
        YRRGC  IT C R T
Subjt:  YRRGCIAITGCARFT

AT3G05490.1 ralf-like 222.7e-1047.62Show/hide
Query:  SRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        SRR+L Q          KY+ Y A+R+N+ PC  RG SYY+C++  +ANPY RGC  IT C R
Subjt:  SRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.2e-1043.66Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F   +E +RR+L            +Y+ Y ALR+N  PC  RG SYY+C++  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR

AT4G15800.1 ralf-like 335.5e-1145.07Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F   +E +RR+L            KY+ Y ALR+N  PC  RG SYY+C++  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGATCAACGAAGCTCTGCCTATTTCTCCTCCTCATTGCAGTCGTCGCCGCTCCACTTTGCCTTGCCTTATCCGACGACTGGACTCGCTCCTACGCTGATGTCCCCGA
TTATGACTTTACGAACAGCAATGAAGACAGCCGAAGGTTACTTTTTCAATATGGATTTGCTTATAAATATCCAAAAAATAAGTATTTGGGCTATGATGCACTTAGGAAGA
ATAATTCCCCCTGCCGCCATCGTGGTAGATCTTACTATGACTGTAAGAAGCGTAAGAAGGCCAACCCTTATCGTCGTGGCTGCATTGCCATCACCGGCTGCGCTCGTTTC
ACCGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAACCCCAACCACTTAAATACTTCAACAGCTTAATCTTCACAAACCCTTCATTCCTTCTCCATTTATAAATCTCCCCATCCTTCTCATCTTCATCAGGAAAAAAAAGGCA
GAGCAAAACAAATAACAAACACCACAACAAATTAAACCCCCCACCTCCCCATTTATTCCCTTCAACATCTCATCACACCACACCACTAGCTCCAAAATGAGATCAACGAA
GCTCTGCCTATTTCTCCTCCTCATTGCAGTCGTCGCCGCTCCACTTTGCCTTGCCTTATCCGACGACTGGACTCGCTCCTACGCTGATGTCCCCGATTATGACTTTACGA
ACAGCAATGAAGACAGCCGAAGGTTACTTTTTCAATATGGATTTGCTTATAAATATCCAAAAAATAAGTATTTGGGCTATGATGCACTTAGGAAGAATAATTCCCCCTGC
CGCCATCGTGGTAGATCTTACTATGACTGTAAGAAGCGTAAGAAGGCCAACCCTTATCGTCGTGGCTGCATTGCCATCACCGGCTGCGCTCGTTTCACCGATTAAATTGT
TTTTTTAAAAAATAATCTGTATTGAGATTGTTTTTTGATTTATTGTGGGATCGGTTTGAATGTTTTCTCCCTATTTTATTTTTTGTGAAATTTTAATTTTGTTTTATATT
ATTTTAAAGTTTTCCGTCCATTCGGAATGTAAGGATCGATCATATAATGACCTCTATAAAATGGTTAAAATATAATTTTCATTCACTCAACTTTTTTCAACGTGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNSPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF
TD