; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G28130 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G28130
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionSMI1_KNR4 domain-containing protein
Genome locationChr6:24587146..24588534
RNA-Seq ExpressionCSPI06G28130
SyntenyCSPI06G28130
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141914.1 uncharacterized protein LOC101216316 [Cucumis sativus]1.7e-21899.75Show/hide
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XP_023518713.1 uncharacterized protein LOC111782143 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-19989.95Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KFS2 Uncharacterized protein8.1e-21999.75Show/hide
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A0A1S3CSK6 uncharacterized protein LOC1035044692.2e-21698.22Show/hide
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A0A5D3CP02 Uncharacterized protein2.2e-21698.22Show/hide
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A0A6J1HDS6 uncharacterized protein LOC1114632491.6e-19889.45Show/hide
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A0A6J1KSP0 uncharacterized protein LOC1114968935.1e-19789.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22790.1 unknown protein9.4e-2625.94Show/hide
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         + +N FW  SWG RP +  +AL + +  ++ AP+L+P++   Y+P   P+LAGNP+F +D + +     D+  F                    + I  
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Query:  KSAGSSSNFSRRSLDTGARTPRWVEFWSDAVVDRRRRNSSSSSSSSPDRVIEMPRSGIPKWVNEYIEEIGSTLRGGGWSETDITEIVQVSASGFFEGAAM
            +     R       R PR VEFWSD     R      +   + D    +   G+   +++   +    LR  GW+E D+ +              M
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Query:  VLVDNQAVLDALLLKTDRFSDVLRKAGWSSEEVSYALGFDHRAERER
        +++D+           D+ + + ++    S +V YA G +   ER+R
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AT3G50340.1 unknown protein7.2e-15972.17Show/hide
Query:  MVDVDRRMAGLNPAHIAGLRRLSARAAAVTPSHPS-RAGLLSFSSLADNVITHLRNTGVEVQTGLSIADFARAEAEFGFVFPPDLRAVLSAGLPIGPGFP
        MVDVDRRM GL PAH AGLRRLSARAAA  P+ P+ R  L+SFSSLAD VI+HL  + ++VQ GL+ ++FARAEAEF F FPPDLRAVL+AGLP+G GFP
Subjt:  MVDVDRRMAGLNPAHIAGLRRLSARAAAVTPSHPS-RAGLLSFSSLADNVITHLRNTGVEVQTGLSIADFARAEAEFGFVFPPDLRAVLSAGLPIGPGFP

Query:  DWRSSGARQHLRATLDLPIAAISFQIAKNTFWSKSWGPRPLDPEKALRVARNALKRAPLLIPLFNHCYIPCNPSLAGNPIFSVDENRISFSGLDLSDFFE
        DWRS GAR HLRA +DLPIAA+SFQIA+NT WSKSWG RP DPEKALRVARNALKRAPL+IP+F+HCYIPCNPSLAGNP+F +DE RI   G DLSDFFE
Subjt:  DWRSSGARQHLRATLDLPIAAISFQIAKNTFWSKSWGPRPLDPEKALRVARNALKRAPLLIPLFNHCYIPCNPSLAGNPIFSVDENRISFSGLDLSDFFE

Query:  REFLFRSSQSDAHHLKKQRSISEKSAG----SSSNFSRRSLDT----GARTPRWVEFWSDAVVDRRRRNS----SSSSSSSPDRVIEMPRSGIPKWVNEY
        RE +FR S +    L KQRS+SEKSAG    SSSNFSR SLD+    G+ TPRWVEFWSDA VDRRRRNS    SSS SSSP+R +++PRS  PKWV++Y
Subjt:  REFLFRSSQSDAHHLKKQRSISEKSAG----SSSNFSRRSLDT----GARTPRWVEFWSDAVVDRRRRNS----SSSSSSSPDRVIEMPRSGIPKWVNEY

Query:  IEEIGSTLRGGGWSETDITEIVQVSASGFFEGAAMVLVDNQAVLDALLLKTDRFSDVLRKAGWSSEEVSYALGFDHRAERERKPAKKLSPELVERIGKLA
        +  IGS LRGGGWSE+D+ +IV VSASGFFEG  MV++DNQAVLDALLLK  RFS+ LRKAGWSSEEVS ALGFD R E+E+KP KKLSPELV+RIGKLA
Subjt:  IEEIGSTLRGGGWSETDITEIVQVSASGFFEGAAMVLVDNQAVLDALLLKTDRFSDVLRKAGWSSEEVSYALGFDHRAERERKPAKKLSPELVERIGKLA

Query:  ESVTRS
        ESV+RS
Subjt:  ESVTRS

AT5G67020.1 unknown protein2.1e-15070.07Show/hide
Query:  MVDVDRRMAGLNPAHIAGLRRLSARAAAVTPSHPS-RAGLLSFSSLADNVITHLRNTGVEVQTGLSIADFARAEAEFGFVFPPDLRAVLSAGLPIGPGFP
        MVDVDRRM GL PAH AGLRRLSARAAA  PS P+ R  L SFS  AD VI HL+N+G+++Q GLS  +FAR EAEFGF FPPDLR +LSAGL +G GFP
Subjt:  MVDVDRRMAGLNPAHIAGLRRLSARAAAVTPSHPS-RAGLLSFSSLADNVITHLRNTGVEVQTGLSIADFARAEAEFGFVFPPDLRAVLSAGLPIGPGFP

Query:  DWRSSGARQHLRATLDLPIAAISFQIAKNTFWSKSWGPRPLDPEKALRVARNALKRAPLLIPLFNHCYIPCNPSLAGNPIFSVDENRISFSGLDLSDFFE
        DWRS GAR HLRA +DLP+AA+SFQIAKN+ W KSWG +P DPEKALRVARNALKRAPLLIP+F+HCYIPCNPSLAGNP+F +DE RI   G DLS+FFE
Subjt:  DWRSSGARQHLRATLDLPIAAISFQIAKNTFWSKSWGPRPLDPEKALRVARNALKRAPLLIPLFNHCYIPCNPSLAGNPIFSVDENRISFSGLDLSDFFE

Query:  REFLFRSSQSDAHHLKKQRSISEKSAGSSSNFSRRSLD----TGARTPRWVEFWSDAVVDRRRRNS---SSSSSSSPDRVIEMPRSGIPKWVNEYIEEIG
        RE  FRSS+     L KQRS+SEKSAGSSSNFSRRSLD     GA   RWVEFWSDA VDR RRNS   SSSSSSSPD    +P++  PKWVN+Y+  IG
Subjt:  REFLFRSSQSDAHHLKKQRSISEKSAGSSSNFSRRSLD----TGARTPRWVEFWSDAVVDRRRRNS---SSSSSSSPDRVIEMPRSGIPKWVNEYIEEIG

Query:  STLRGGGWSETDITEIVQVSASGFFEGAAMVLVDNQAVLDALLLKTDRFSDVLRKAGWSSEEVSYALGFDHRAERERKPAKKLSPELVERIGKLAESVTR
        S LR GGWSE+DI EI+ VSASGFFEG  MV++DNQ VLD LLLK  R S+ LRK+GWSSEEVS ALGFD R E+ERKP KKLSP LVE+  KLAE V++
Subjt:  STLRGGGWSETDITEIVQVSASGFFEGAAMVLVDNQAVLDALLLKTDRFSDVLRKAGWSSEEVSYALGFDHRAERERKPAKKLSPELVERIGKLAESVTR

Query:  S
        S
Subjt:  S


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGGACGTCGACCGCAGAATGGCCGGTCTCAATCCGGCCCACATCGCTGGACTCCGCCGCCTCTCCGCTCGTGCCGCTGCTGTCACTCCTTCTCACCCCTCACGCGC
CGGTCTTCTCTCCTTCTCTTCTCTCGCTGACAACGTCATCACCCATTTGCGCAACACCGGCGTAGAGGTTCAAACCGGTCTCTCCATCGCCGACTTCGCCCGAGCTGAGG
CCGAGTTTGGCTTCGTTTTCCCTCCGGATCTCCGAGCCGTACTCTCTGCTGGTTTACCCATCGGTCCTGGCTTCCCCGATTGGCGTTCTTCCGGGGCCAGACAACATCTT
AGAGCCACGCTCGATCTTCCAATTGCGGCTATTAGTTTTCAAATCGCCAAGAATACGTTCTGGTCAAAGTCTTGGGGTCCAAGGCCCTTAGACCCTGAAAAGGCCTTACG
GGTCGCTAGAAACGCTCTGAAGAGAGCGCCTCTTTTGATTCCCCTCTTCAATCATTGCTACATTCCCTGCAACCCTTCTCTGGCGGGGAACCCAATCTTCTCCGTTGATG
AGAATCGGATCTCCTTCTCTGGTTTGGATCTATCCGATTTCTTCGAGCGGGAATTCCTTTTTCGGAGCTCCCAATCCGATGCCCACCATCTTAAAAAGCAAAGGTCCATC
AGTGAAAAATCTGCTGGGTCTTCCTCTAACTTCTCTCGACGGAGCCTGGACACGGGAGCAAGAACGCCGAGGTGGGTGGAGTTTTGGAGCGACGCCGTGGTGGACCGGCG
GCGCAGAAACTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCATCGCCGGACAGAGTAATCGAGATGCCGAGGTCGGGAATACCGAAATGGGTAAACGAATACATAGAAGAAATAGGATCGA
CTTTAAGAGGAGGAGGATGGAGTGAAACGGACATCACAGAGATAGTACAGGTGTCAGCCTCGGGATTCTTCGAAGGAGCGGCGATGGTATTAGTGGACAACCAAGCGGTT
CTGGACGCGTTGCTTCTAAAAACAGATCGGTTTTCGGACGTTCTCCGGAAAGCCGGATGGAGCTCGGAAGAAGTGTCGTACGCACTGGGGTTTGATCATCGAGCCGAAAG
GGAACGAAAACCGGCAAAGAAGCTATCCCCAGAACTAGTGGAAAGAATCGGGAAACTGGCGGAGTCGGTTACTCGGTCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACCTTCCTTCTTTTTCCGAATTCTTCCCTTCACTTCTACACACCCTTCCTCAACACTTCCTTCTTTTTCTTCTTCTATTTATCACTGCTCTATCCCTTTCCTTCTCGCC
TCCAATGGTGGACGTCGACCGCAGAATGGCCGGTCTCAATCCGGCCCACATCGCTGGACTCCGCCGCCTCTCCGCTCGTGCCGCTGCTGTCACTCCTTCTCACCCCTCAC
GCGCCGGTCTTCTCTCCTTCTCTTCTCTCGCTGACAACGTCATCACCCATTTGCGCAACACCGGCGTAGAGGTTCAAACCGGTCTCTCCATCGCCGACTTCGCCCGAGCT
GAGGCCGAGTTTGGCTTCGTTTTCCCTCCGGATCTCCGAGCCGTACTCTCTGCTGGTTTACCCATCGGTCCTGGCTTCCCCGATTGGCGTTCTTCCGGGGCCAGACAACA
TCTTAGAGCCACGCTCGATCTTCCAATTGCGGCTATTAGTTTTCAAATCGCCAAGAATACGTTCTGGTCAAAGTCTTGGGGTCCAAGGCCCTTAGACCCTGAAAAGGCCT
TACGGGTCGCTAGAAACGCTCTGAAGAGAGCGCCTCTTTTGATTCCCCTCTTCAATCATTGCTACATTCCCTGCAACCCTTCTCTGGCGGGGAACCCAATCTTCTCCGTT
GATGAGAATCGGATCTCCTTCTCTGGTTTGGATCTATCCGATTTCTTCGAGCGGGAATTCCTTTTTCGGAGCTCCCAATCCGATGCCCACCATCTTAAAAAGCAAAGGTC
CATCAGTGAAAAATCTGCTGGGTCTTCCTCTAACTTCTCTCGACGGAGCCTGGACACGGGAGCAAGAACGCCGAGGTGGGTGGAGTTTTGGAGCGACGCCGTGGTGGACC
GGCGGCGCAGAAACTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCATCGCCGGACAGAGTAATCGAGATGCCGAGGTCGGGAATACCGAAATGGGTAAACGAATACATAGAAGAAATAGGA
TCGACTTTAAGAGGAGGAGGATGGAGTGAAACGGACATCACAGAGATAGTACAGGTGTCAGCCTCGGGATTCTTCGAAGGAGCGGCGATGGTATTAGTGGACAACCAAGC
GGTTCTGGACGCGTTGCTTCTAAAAACAGATCGGTTTTCGGACGTTCTCCGGAAAGCCGGATGGAGCTCGGAAGAAGTGTCGTACGCACTGGGGTTTGATCATCGAGCCG
AAAGGGAACGAAAACCGGCAAAGAAGCTATCCCCAGAACTAGTGGAAAGAATCGGGAAACTGGCGGAGTCGGTTACTCGGTCATAGTACGGGCATCACATCTCCCCAGAT
TCCTCAGTTTGCTTTCTTTTTTAAAATTTCAAGGGTCTTGGGTATGCCATATTTTTCTGCCCTCCAGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVDVDRRMAGLNPAHIAGLRRLSARAAAVTPSHPSRAGLLSFSSLADNVITHLRNTGVEVQTGLSIADFARAEAEFGFVFPPDLRAVLSAGLPIGPGFPDWRSSGARQHL
RATLDLPIAAISFQIAKNTFWSKSWGPRPLDPEKALRVARNALKRAPLLIPLFNHCYIPCNPSLAGNPIFSVDENRISFSGLDLSDFFEREFLFRSSQSDAHHLKKQRSI
SEKSAGSSSNFSRRSLDTGARTPRWVEFWSDAVVDRRRRNSSSSSSSSPDRVIEMPRSGIPKWVNEYIEEIGSTLRGGGWSETDITEIVQVSASGFFEGAAMVLVDNQAV
LDALLLKTDRFSDVLRKAGWSSEEVSYALGFDHRAERERKPAKKLSPELVERIGKLAESVTRS