; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G29060 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G29060
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationChr6:25267489..25268201
RNA-Seq ExpressionCSPI06G29060
SyntenyCSPI06G29060
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039610 - VQ motif-containing protein 29


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604115.1 VQ motif-containing protein 29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-6581.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJR2 VQ domain-containing protein2.7e-8698.21Show/hide
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A0A6J1GE45 uncharacterized protein LOC1114533303.8e-6480.47Show/hide
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A0A6J1HHA9 uncharacterized protein LOC1114634793.0e-5372.02Show/hide
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A0A6J1IPH4 uncharacterized protein LOC1114776401.1e-5876.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9SZG3 VQ motif-containing protein 297.0e-0753.06Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22880.1 VQ motif-containing protein1.0e-0843.55Show/hide
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AT4G37710.1 VQ motif-containing protein5.0e-0853.06Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTATTCTAATAACAATATTCATTGTGTTCGGAAGCCGATGGCGAAGCCGTGGAAGAAACCAGCGATTGCGCCACTGCCACCTACTCGGCCCAGGGTTTACAAAGTCGACC
CAATTAACTTCCGGGGTTTGGTTCAGAAGCTTACCGGTTTGGCTGAACTCCGATCTCCACGGCTTCAAAAAATGGCGCCACCACCGCTTGATATTTCCCGACGCCAAGAC
TCTTGCTCTGCCGTCGTGGAAGACACGGTGTTTAAGGCTTCGTCGCTTTTGAAGGTGGAGAATGAGGCGGTGGACGGTGGGGGCTTTCTTGAGCTCAATTTGTCGCCCTT
CAACAAGAATTGGTGCTCTTTCCCTGCATTGAGTCCTGAGACTTTGGCCATTTTGGATGCAATTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGTTATAATTTCACTTGGATTTGAGTTTGTTTTAAAAGAAAGGAGGATATGGATGCGTTTTGTGCTTATACTTCTTCATCCTCTTCCTCTTCTTCCAGCTTTTTGGCTA
AAAAAAACGACCAATCTGAGCATCAAAGTGTGAAGAGGGAATTTTCGAGTTATTCTAATAACAATATTCATTGTGTTCGGAAGCCGATGGCGAAGCCGTGGAAGAAACCA
GCGATTGCGCCACTGCCACCTACTCGGCCCAGGGTTTACAAAGTCGACCCAATTAACTTCCGGGGTTTGGTTCAGAAGCTTACCGGTTTGGCTGAACTCCGATCTCCACG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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