; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G36770 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G36770
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr6:29620547..29621086
RNA-Seq ExpressionCSPI06G36770
SyntenyCSPI06G36770
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052498.1 hypothetical protein E6C27_scaffold120G00980 [Cucumis melo var. makuwa]4.5e-1273.77Show/hide
Query:  NSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGA------ESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAP
        NSIIALFI PV+V IST PMGLG AELVLNGA      + WGG GRIFSPF ERA GNVAP
Subjt:  NSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGA------ESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAP
KGN49452.1 hypothetical protein Csa_002799 [Cucumis sativus]5.4e-7498.58Show/hide
Query:  MEVIHFRQIDTKLMCDLMSNCLCFLAFFLTEWSNSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGAESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAPDSYHYLSYKGVG
        MEVIHFRQIDTKL+ DLMSNCLCFLAFFLTEWSNSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGAESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAPDSYHYLSYKGVG
Subjt:  MEVIHFRQIDTKLMCDLMSNCLCFLAFFLTEWSNSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGAESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAPDSYHYLSYKGVG

Query:  CYDSKRDVHLLKPFRRFKASCLSLVIVLAQGALGGNTAANH
        CYDSKRDVHLLKPFRRFKASCLSLVIVLAQGALGGNTAANH
Subjt:  CYDSKRDVHLLKPFRRFKASCLSLVIVLAQGALGGNTAANH
TYK13326.1 hypothetical protein E5676_scaffold255G009500 [Cucumis melo var. makuwa]4.5e-1273.77Show/hide
Query:  NSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGA------ESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAP
        NSIIALFI PV+V IST PMGLG AELVLNGA      + WGG GRIFSPF ERA GNVAP
Subjt:  NSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGA------ESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAP
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KM53 Uncharacterized protein2.6e-7498.58Show/hide
Query:  MEVIHFRQIDTKLMCDLMSNCLCFLAFFLTEWSNSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGAESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAPDSYHYLSYKGVG
        MEVIHFRQIDTKL+ DLMSNCLCFLAFFLTEWSNSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGAESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAPDSYHYLSYKGVG
Subjt:  MEVIHFRQIDTKLMCDLMSNCLCFLAFFLTEWSNSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGAESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAPDSYHYLSYKGVG

Query:  CYDSKRDVHLLKPFRRFKASCLSLVIVLAQGALGGNTAANH
        CYDSKRDVHLLKPFRRFKASCLSLVIVLAQGALGGNTAANH
Subjt:  CYDSKRDVHLLKPFRRFKASCLSLVIVLAQGALGGNTAANH
A0A5A7UBC9 Uncharacterized protein2.2e-1273.77Show/hide
Query:  NSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGA------ESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAP
        NSIIALFI PV+V IST PMGLG AELVLNGA      + WGG GRIFSPF ERA GNVAP
Subjt:  NSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGA------ESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAP
A0A5D3CSE9 Uncharacterized protein2.2e-1273.77Show/hide
Query:  NSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGA------ESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAP
        NSIIALFI PV+V IST PMGLG AELVLNGA      + WGG GRIFSPF ERA GNVAP
Subjt:  NSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGA------ESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAP
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTCATCCATTTTCGACAGATTGACACAAAGCTGATGTGCGATCTGATGTCTAATTGCCTCTGTTTCTTGGCTTTCTTCCTTACTGAATGGTCTAACTCTATTAT
AGCGTTATTTATTGTTCCGGTAATCGTTCGAATTTCCACTTACCCCATGGGATTAGGCCCTGCAGAACTTGTCCTAAACGGGGCCGAGAGCTGGGGAGGAAGAGGGAGAA
TTTTCTCTCCATTCGGTGAACGGGCATGGGGAAATGTTGCCCCCGACTCATACCACTATCTTTCATATAAGGGAGTAGGATGCTATGACTCCAAACGAGATGTTCACCTA
CTAAAGCCTTTCAGGCGGTTTAAGGCCAGCTGCTTATCCCTTGTTATCGTGCTTGCCCAGGGAGCTCTTGGAGGGAACACTGCAGCTAATCACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGTCATCCATTTTCGACAGATTGACACAAAGCTGATGTGCGATCTGATGTCTAATTGCCTCTGTTTCTTGGCTTTCTTCCTTACTGAATGGTCTAACTCTATTAT
AGCGTTATTTATTGTTCCGGTAATCGTTCGAATTTCCACTTACCCCATGGGATTAGGCCCTGCAGAACTTGTCCTAAACGGGGCCGAGAGCTGGGGAGGAAGAGGGAGAA
TTTTCTCTCCATTCGGTGAACGGGCATGGGGAAATGTTGCCCCCGACTCATACCACTATCTTTCATATAAGGGAGTAGGATGCTATGACTCCAAACGAGATGTTCACCTA
CTAAAGCCTTTCAGGCGGTTTAAGGCCAGCTGCTTATCCCTTGTTATCGTGCTTGCCCAGGGAGCTCTTGGAGGGAACACTGCAGCTAATCACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEVIHFRQIDTKLMCDLMSNCLCFLAFFLTEWSNSIIALFIVPVIVRISTYPMGLGPAELVLNGAESWGGRGRIFSPFGERAWGNVAPDSYHYLSYKGVGCYDSKRDVHL
LKPFRRFKASCLSLVIVLAQGALGGNTAANH