; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G36930 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G36930
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionGermin-like protein
Genome locationChr6:29754225..29755034
RNA-Seq ExpressionCSPI06G36930
SyntenyCSPI06G36930
Gene Ontology termsGO:0048046 - apoplast (cellular component)
GO:0030145 - manganese ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001929 - Germin
IPR006045 - Cupin 1
IPR011051 - RmlC-like cupin domain superfamily
IPR014710 - RmlC-like jelly roll fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN49469.1 hypothetical protein Csa_003117 [Cucumis sativus]1.5e-11599.08Show/hide
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XP_008439540.1 PREDICTED: putative germin-like protein 2-1 [Cucumis melo]1.0e-9279.07Show/hide
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XP_031742920.1 putative germin-like protein 2-1 [Cucumis sativus]6.9e-11393.89Show/hide
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XP_038877837.1 LOW QUALITY PROTEIN: putative germin-like protein 2-1 [Benincasa hispida]1.6e-9381.73Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KIX1 Germin-like protein4.2e-9278.6Show/hide
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A0A0A0KKW4 Germin-like protein7.2e-11699.08Show/hide
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A0A0A0KKX1 Germin-like protein1.0e-9077.21Show/hide
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A0A1S3AYK9 Germin-like protein5.0e-9379.07Show/hide
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A0A5D3CN45 Germin-like protein5.0e-9379.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6K5P8 Putative germin-like protein 2-33.1e-6860.95Show/hide
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        + LAL CS     +ASDPS LQD CVAD  + V++NG+ CKD + V A+DFF SGLH+ G+T N  GS +T  ++ Q+PGLNTLGISLAR+D+A + +  
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        PHTHPRATEILT+LEG+L VGFVTSNPEN+L TK +NKGDVFVFP GL+HF  N     AVAIVA SSQNPG++T+ N+VFGSKP I  +ILAKAFQ   
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Q6K5P9 Putative germin-like protein 2-25.4e-6860.09Show/hide
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        Q+ +++ LAL CS G +ASDP  LQDFCV D  + V++NG  CKD K V A DFF SGLH+ G+T N  GS +T  ++ QIPGLNT+G+SL R+D+APN 
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Q6K5Q0 Putative germin-like protein 2-11.8e-6859.81Show/hide
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        ST   +L+ LA++ S   ASDPS LQDFCVAD  + V +NG  CKDP  +  +DFF SGLH+ G+T+N  GS +T  ++ QI GLNTLGISLAR+D+AP 
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         +  PH HPRATEILT+LEG+L VGFVTSNPEN+L TK LNKGDVFVFP GLIHF  N   +  +A+ A SSQNPG++TI N+VFGSKP I  +ILAKAF
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        Q    I+  IQ++F
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Q6YZA9 Germin-like protein 8-21.1e-6861.97Show/hide
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        +L+ + L L     +ASDPSPLQDFCVAD N+PV++NG VCK+P    A DFF +  L  P DTNN  GS +T  +++Q+PGLNTLGIS+ARLDFAP  +
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          PHTHPRATEI T+LEGTL VGFVTSNP+NRL++K LNKGDVFVFP GLIHF  N   H+PAVAI A SSQNPG++TI N+VFGS P I  +IL KAFQ
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         +  II  +Q++F
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Q9LEA7 Germin-like protein subfamily 1 member 82.8e-6458.29Show/hide
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        LS  ALT  + +ASDPSPLQDFCV    P + V +NG  CKDP++V A DFF S L+ PG+TNN+ GS +T  ++  + GLNTLGISL R+D+APN    
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        PHTHPRATEIL + +GTLLVGF++SN + NRL  KTLN GDVFVFP GLIHF  N+   PAVAI A SSQN G++TI N++FGSKPD+  N+LA+AFQ +
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           + N+Q++F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G14630.1 germin-like protein 92.0e-6558.29Show/hide
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        LS  ALT  + +ASDPSPLQDFCV    P + V +NG  CKDP++V A DFF S L+ PG+TNN+ GS +T  ++  + GLNTLGISL R+D+APN    
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        PHTHPRATEIL + +GTLLVGF++SN + NRL  KTLN GDVFVFP GLIHF  N+   PAVAI A SSQN G++TI N++FGSKPD+  N+LA+AFQ +
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           + N+Q++F
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AT5G38940.1 RmlC-like cupins superfamily protein3.3e-6559.24Show/hide
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        +LS LALT  + +ASDPS LQDFCV+     N V +NG  CKDPKLV A DFF SGL       +  GS +T  ++  + GLNTLGISL R+D+A N   
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         PHTHPRATEIL + +GTLLVGFVTSNP+NRL +K LN+GDVFVFP GLIHF  NI   PAVA  A SSQNPG++TI N+VFG+ P I   ILAKAFQ N
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        P ++ ++Q+KF
Subjt:  PAIIANIQSKF

AT5G39120.1 RmlC-like cupins superfamily protein1.1e-6356.82Show/hide
Query:  MVISTQVLILSFLALTCSIGLASDPSPLQDFCVA--DPNNPVKLNGIVCKDPKLVEAKDFFTSGLHVPGDTNNSAGSQITPASIVQIPGLNTLGISLARL
        M +S  +++++F AL  +I  A DPSPLQDFCVA  DP N V +NG  CKDPK  +A+DFF+SGL+  G TNN   S +T  ++ QIPGLNTLGISL R+
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        D+AP     PHTHPRATEIL L+EGTL VGFV+SN + NRL  K LN GDVFVFPIG+IHF  NI   PAVA    SSQN G++TI ++VFGS P I  +
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        ILA+AFQ +  ++ ++++KF
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AT5G39160.1 RmlC-like cupins superfamily protein8.2e-6455.71Show/hide
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        M +S  ++  + +AL  S   A DPSPLQDFCVA D    V +NG  CKDPK V+AKDFF SGL++PG+TNN  GS +T  ++ QIPGLNT+GISL R+D
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        +AP+    PHTHPR +EIL L+EGTL VGFV+SN + NRL  K L+ GDVFVFPIG+IHF  N+   PAVA    SSQN G++TI N+VFGS P I   +
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        LA+AFQ + +++  +Q+KF
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AT5G39190.1 germin-like protein 23.7e-6456.16Show/hide
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        LA+AFQ + +++  +Q+KF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGATCAGTACTCAAGTTTTGATTCTCAGCTTCCTTGCACTAACTTGTTCCATTGGATTGGCATCGGATCCTAGTCCACTTCAAGATTTCTGTGTTGCAGATCCAAA
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GCTCTCAAATAACTCCAGCCAGTATTGTCCAAATCCCAGGACTCAACACTCTCGGCATCTCCCTTGCTCGCCTTGACTTTGCCCCAAACAGTATCGTTACTCCCCATACT
CACCCTCGCGCCACTGAAATATTGACCCTTCTGGAAGGCACACTCTTGGTGGGCTTCGTCACCTCCAACCCTGAAAACCGTCTCATTACTAAGACATTGAACAAGGGCGA
CGTCTTTGTCTTTCCCATTGGACTAATTCACTTTCATCAAAACATTGCTCATCGTCCAGCTGTTGCCATTGTAGCTTTTAGCAGCCAAAACCCGGGTATTGTTACCATTG
AAAATTCTGTTTTTGGATCAAAGCCTGACATCCCAACCAACATTCTTGCGAAGGCTTTTCAAACCAATCCTGCTATTATAGCCAACATTCAGTCCAAGTTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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