; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G03070 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G03070
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionGlycine rich protein
Genome locationChr7:2484717..2485382
RNA-Seq ExpressionCSPI07G03070
SyntenyCSPI07G03070
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CEG62450.1 Glycine rich protein [Cucumis sativus]1.6e-4891.34Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        MSSKAFVFLGL LAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR        GGYDRGYGGG+DRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        YGRGCRYGRCG+KCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

KAA0059138.1 cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-4389.76Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYG       GGGY RG G GRGGYGRG YGGRGGYGGGRGG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        YGRGCRYGRCGY+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

KAE8645725.1 hypothetical protein Csa_020407 [Cucumis sativus]9.5e-5492.59Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR--------GGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNE TVETNGVEDAKYGR        GGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR--------GGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRG

Query:  GYGGGRGGYGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        GYGGGRGGYGRGCRYGRCG+KCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GYGGGRGGYGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

KGN43456.1 hypothetical protein Csa_020456 [Cucumis sativus]5.4e-4992.13Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR        GGYDRGYGGG+DRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        YGRGCRYGRCG+KCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

NP_001267708.1 glycine-rich protein-like precursor [Cucumis sativus]5.4e-4992.13Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR        GGYDRGYGGG+DRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        YGRGCRYGRCG+KCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K1B1 Cell wall glycine-rich protein2.8e-5178.62Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR--------------------------------GGYDRGYGGGYDRGY
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNE TVETNGVEDAKYGR                                GGYDRGYGGGYDRGY
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR--------------------------------GGYDRGYGGGYDRGY

Query:  GGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        GGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCG+KCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

A0A0A0K6L7 Uncharacterized protein2.6e-4992.13Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR        GGYDRGYGGG+DRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        YGRGCRYGRCG+KCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

A0A0A1IXP4 Glycine rich protein7.6e-4991.34Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        MSSKAFVFLGL LAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR        GGYDRGYGGG+DRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        YGRGCRYGRCG+KCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like7.3e-4489.76Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYG       GGGY RG G GRGGYGRG YGGRGGYGGGRGG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        YGRGCRYGRCGY+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

A0P8W6 Cell wall glycine-rich protein2.6e-4992.13Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGR        GGYDRGYGGG+DRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP
        YGRGCRYGRCG+KCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P11898 Glycine-rich protein HC17.6e-0649.62Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRG-----YGGGYDR--GYGGGRGGY--GRGHYG
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++KT+  N      NG      G GGY  G GGGY+ G      GGGY+   GY  G GGY  G GH+ 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRG-----YGGGYDR--GYGGGRGGY--GRGHYG

Query:  GRGGYGGGRGGY--GRGCRYGRCGYKCCSYA
        G GGY  G GGY  G G  Y  C  +CCS A
Subjt:  GRGGYGGGRGGY--GRGCRYGRCGYKCCSYA

P23137 Glycine-rich protein7.4e-0947.73Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGR
        M SKAF+FLGL LAF  L+SSEV A +LAETS+  K D E  V+ +       GRGGY+   G GY           YGGGR         GRGG     
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGR

Query:  GGY-GRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE
        GGY  RGCRYG C  GY    +CCSYAGE ++
Subjt:  GGY-GRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE

P37703 Glycine-rich protein DC9.15.8e-0649.62Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRG-----YGGGYDR--GYGGGRGGY--GRGHYG
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++KT+  N      NG      G GGY  G GGGY+ G      GGGY+   GY  G GGY  G GH+ 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRG-----YGGGYDR--GYGGGRGGY--GRGHYG

Query:  GRGGY--GGGRGGYGRGCRYGRCGYKCCSYA
        G GGY  GGG  G G  C Y  C  +CCS A
Subjt:  GRGGY--GGGRGGYGRGCRYGRCGYKCCSYA

Q07202 Cold and drought-regulated protein CORA5.5e-0446.09Show/hide
Query:  SSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRG---------YGGGYDRG------YGGGYDRGYGGGRGGYGRG
        S KA + L LL   + L+SS ++ARDL ETS+    E   +TN V DAKYG GGY+ G         +GGGY+ G       GGGY+ G GG  GG G G
Subjt:  SSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRG---------YGGGYDRG------YGGGYDRGYGGGRGGYGRG

Query:  HYGGRGGY--GGGRGGYGRGCRYGRCGY
         +GG GGY  GGG GG+G G   G  G+
Subjt:  HYGGRGGY--GGGRGGYGRGCRYGRCGY

Q09134 Abscisic acid and environmental stress-inducible protein1.3e-0541.67Show/hide
Query:  VLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG------------------------RGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGG---GRGGY---GR
        VLL+SSEV+ARDL ET+S    E   +TN V DAKYG                         GGY+ G GGGY+ G GGGY+ G GG   G GGY   G 
Subjt:  VLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG------------------------RGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGG---GRGGY---GR

Query:  GHYGGRGGYGGGRGGY---------------GRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAK
        G+  G GGY  G GGY               G GC+Y  C  +CCS+A  V   AK
Subjt:  GHYGGRGGYGGGRGGY---------------GRGCRYGRCGYKCCSYAGEVVEGAK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05520.1 glycine-rich protein 39.6e-0442.96Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVED--AKYGRGGYDRGYGGGYD------RGYGGGYDRG---YGGGRGGY--GRGH
        M+SKA V LGL    VLL+ SEVAA   A  +S++      +  G  D    Y  GG  +G GG Y       +G GG Y  G   Y GG G Y  G G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVED--AKYGRGGYDRGYGGGYD------RGYGGGYDRG---YGGGRGGY--GRGH

Query:  YGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE
        Y G GG  GG G  G  CR+G C  GY    +CCSYAGE V+
Subjt:  YGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE

AT2G05520.2 glycine-rich protein 32.5e-0444.85Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVED--AKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRG---YGGGRGGY--GRGHYGGRGG
        M+SKA V LGL    VLL+ SEVAA   A  +S++      +  G  D    Y  GG  +G GG Y +G GG Y  G   Y GG G Y  G G Y G GG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVED--AKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRG---YGGGRGGY--GRGHYGGRGG

Query:  YGGGRGGYGRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE
          GG G  G  CR+G C  GY    +CCSYAGE V+
Subjt:  YGGGRGGYGRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE

AT2G05520.3 glycine-rich protein 33.3e-0446.51Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        M+SKA V LGL    VLL+ SEVAA      SS T N  + ET   +   YG  G +   GGG  +G GG Y    GGGR   G G Y G GG  GG G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE
         G  CR+G C  GY    +CCSYAGE V+
Subjt:  YGRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE

AT2G05520.4 glycine-rich protein 31.5e-0447.29Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        M+SKA V LGL    VLL+ SEVAA      SS T N  + ET   +   YG  G +   GGGY +G GG Y    GGGR   G G Y G GG  GG G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE
         G  CR+G C  GY    +CCSYAGE V+
Subjt:  YGRGCRYGRC--GY----KCCSYAGEVVE

AT2G05540.1 Glycine-rich protein family3.2e-0747.33Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG
        M+SKA +FL L++  VLL++SEV ARDLAE S++  N    E    E      GG   GYGG    GYGG    GYG   GGY R   GG G  GGG G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGG

Query:  YGRG-CRYGRC--GY-----KCCSYAGEVVE
         G G CRYG C  GY     +CC+YAG+ V+
Subjt:  YGRG-CRYGRC--GY-----KCCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTCCAAAGCCTTTGTTTTCCTTGGCCTTCTTCTCGCCTTCGTTCTTCTCCTCTCGTCTGAAGTGGCTGCAAGGGACCTTGCGGAGACCTCCTCCAAGACTGACAA
CGAGGCCACAGTGGAAACCAATGGCGTAGAGGATGCCAAGTATGGAAGAGGTGGGTACGACAGAGGCTATGGTGGAGGGTACGACAGAGGCTATGGCGGTGGGTACGACA
GAGGCTATGGCGGTGGTCGTGGTGGGTATGGTCGTGGTCATTACGGTGGCCGTGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGCTACGGCAGAGGTTGCCGATATGGTCGATGT
GGGTACAAGTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGTGCAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTTCCAAAGCCTTTGTTTTCCTTGGCCTTCTTCTCGCCTTCGTTCTTCTCCTCTCGTCTGAAGTGGCTGCAAGGGACCTTGCGGAGACCTCCTCCAAGACTGACAA
CGAGGCCACAGTGGAAACCAATGGCGTAGAGGATGCCAAGTATGGAAGAGGTGGGTACGACAGAGGCTATGGTGGAGGGTACGACAGAGGCTATGGCGGTGGGTACGACA
GAGGCTATGGCGGTGGTCGTGGTGGGTATGGTCGTGGTCATTACGGTGGCCGTGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGCTACGGCAGAGGTTGCCGATATGGTCGATGT
GGGTACAAGTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGTGCAAAACCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGYDRGYGGGYDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRC
GYKCCSYAGEVVEGAKP