; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G04890 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G04890
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionEthylene-responsive transcription factor
Genome locationChr7:3625389..3626787
RNA-Seq ExpressionCSPI07G04890
SyntenyCSPI07G04890
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001471 - AP2/ERF domain
IPR016177 - DNA-binding domain superfamily
IPR036955 - AP2/ERF domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031547.1 ethylene-responsive transcription factor 4 [Cucumis melo var. makuwa]2.9e-10087.85Show/hide
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KAG7011984.1 Ethylene-responsive transcription factor 9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.6e-8576.02Show/hide
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        SS+ EKTPSPEIAR+Y    GVGRT PF+QPQFLH             GG VRP+LF D +GR EFVAHGYPIRFDPATVDLT+RF+GG  +D++SSS+V
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XP_004136839.1 ethylene-responsive transcription factor 4 [Cucumis sativus]2.1e-114100Show/hide
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XP_008455284.2 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: ethylene-responsive transcription factor 4 [Cucumis melo]1.4e-9987.38Show/hide
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XP_038886999.1 ethylene-responsive transcription factor 4-like [Benincasa hispida]1.2e-9079.37Show/hide
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        MV+ +KS    LPSLS  NNN K+LHFRGVRKRPWGRYAAEIRDP KKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFP P++ IDVSP   NQSP
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        SP+ST++SSSSS+ EKTPSPEIARSYGVGRTFPFIQPQFLH        G G VRP+LF D +GR EFVAHGYP+RFDPATVDLT+RF GGIQ+D++SSS
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        LVD RPAKEILNLDLNLAPPVDA
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K742 Ethylene-responsive element-binding protein1.0e-114100Show/hide
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A0A1S3C1T3 LOW QUALITY PROTEIN: ethylene-responsive transcription factor 46.9e-10087.38Show/hide
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        MVA +KS     PSLSNNN KDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDP KKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFP PD+ IDVSPH  NQSPSP
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A0A5A7SPZ4 Ethylene-responsive transcription factor 41.4e-10087.85Show/hide
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A0A6J1GM68 ethylene-responsive transcription factor 4-like1.2e-8374.77Show/hide
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        KSLPSL NN  AK+LHFRGVRKRPWGRYAAEIRDP KKSRVWLGTFDTAEEAARAYD+AARQFRGAKAKTNFPL ++ IDVSP   NQSPSP+ST++SSS
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        SS+ EKTPSPEIAR+Y    GVGRT PF+QPQFLH              GG VRP+LF D + R EFVAHGYPIRFDPATVDLT+RF+GG  +D++SSS+
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        VD RP KEILNLDLNLAPPVDA
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A0A6J1HZF1 ethylene-responsive transcription factor 9-like3.1e-8474.56Show/hide
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        MVA +KS    LPSL NN  AK+LHFRGVRKRPWGRYAAEIRDP KKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPL ++ IDVSP   NQSPS
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Query:  PTSTLDSSSSSTHEKTPSPEIARSY----GVGRTFPFIQPQFLHGGGT----------VRPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTD
        P+ST++SSSSS+ EKTPSPEIAR+Y    GVGRT PF+QPQFLH  G           VRP+LF D +GR EFVAHGYPIRFDPATVDLT+RF+GG  +D
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Query:  TNSSSLVDFRPAKEILNLDLNLAPPVDA
        ++SSS+VD RP KEILNLDLNLAPPVDA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80340 Ethylene-responsive transcription factor 48.6e-3948.13Show/hide
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        ++NNAK++ +RGVRKRPWGRYAAEIRDP KK+RVWLGTFDTAEEAARAYDTAAR FRGAKAKTNFP    F+++S    P    +SPS +STLD +S   
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            P   +  S   G   P ++     GGG         RP+ F D+ G    V  G P      F    V + ++   G Q+D++SSS+VDF    E 
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Query:  ---ILNLDLNLAPP
           +L+LDLNL PP
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Q40477 Ethylene-responsive transcription factor 45.4e-3343.38Show/hide
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        ++  +  K++H+RGVRKRPWGRYAAEIRDP KKSRVWLGTFDTAEEAA+AYDTAAR+FRG KAKTNFP P +         NQSPS +ST++SSS  +  
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Query:  HEKTPSP---EIARSYG---------VGRTFPFIQPQFLHGGGTV------RPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVD
        H    +P   ++ R  G           R+     P F H   TV      +P+L  D   RA  V    P    P   +  +   G   +D++S+   +
Subjt:  HEKTPSP---EIARSYG---------VGRTFPFIQPQFLHGGGTV------RPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVD

Query:  FRPAKEILNLDLNLAPPVD
            K  ++LDLNLAPP++
Subjt:  FRPAKEILNLDLNLAPPVD

Q9FE67 Ethylene-responsive transcription factor 91.1e-3347.42Show/hide
Query:  KDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVSPHNTNQSPSPTSTLDSSSSSTHEKTPSPEI
        K++HFRGVRKRPWGRYAAEIRDP KK+RVWLGTFDTAEEAARAYDTAAR+FRG+KAKTNFPLP +   V+    N S    +T+ ++   T ++ P    
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Query:  ARSYGVGRTFPFIQPQFLHGGGTVRPLLFTDVYG---RAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFRPAKEILNLDLNLAPPV
                 F   + + + GG       F        RAE ++   P+RFDP  ++L+     GI+        V   P +E LNLDLNLAPPV
Subjt:  ARSYGVGRTFPFIQPQFLHGGGTVRPLLFTDVYG---RAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFRPAKEILNLDLNLAPPV

Q9LW49 Ethylene-responsive transcription factor 41.1e-3344.8Show/hide
Query:  SLSNNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVSPHNTNQSPSPTSTLDSSSSST--
        ++  N  K++H+RGVRKRPWGRYAAEIRDP KKSRVWLGTFDTAEEAA+AYDTAAR+FRG KAKTNFPLP +         NQS S +ST++SSS  T  
Subjt:  SLSNNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVSPHNTNQSPSPTSTLDSSSSST--

Query:  HEKTPSP---EIARSYG---------VGRTFPFIQPQFLHGGGTV------RPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVD
        H    +P   ++ R  G           R+     P F H   TV      +P+L  D   R   V    P    P  +       G   T ++SSS+V+
Subjt:  HEKTPSP---EIARSYG---------VGRTFPFIQPQFLHGGGTV------RPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVD

Query:  FR--PAKEILNLDLNLAPPVD
              K  ++LDLNLAPP +
Subjt:  FR--PAKEILNLDLNLAPPVD

Q9MAI5 Ethylene-responsive transcription factor 86.2e-2941.67Show/hide
Query:  NNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVSPHNTNQSPSPTSTLDSSSSSTHEKTP
        +N AK++ +RGVRKRPWGRYAAEIRDP KK+RVWLGTFDTA++AARAYD AAR FRG KAKTNF +              SP+ +ST+  S ++    TP
Subjt:  NNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVSPHNTNQSPSPTSTLDSSSSSTHEKTP

Query:  SPEIARSYGVG----RTFPFIQPQFLHGGGTVRPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFR----PAKEILNLDLNLA
         P +  S G G    R  P + P + +   T                   YP              T G+Q+++ +SS+VDF          L+LDLNLA
Subjt:  SPEIARSYGVG----RTFPFIQPQFLHGGGTVRPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFR----PAKEILNLDLNLA

Query:  PPVD
        PP +
Subjt:  PPVD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50640.1 ethylene responsive element binding factor 32.5e-2577.27Show/hide
Query:  NNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPL
        N + K++ FRGVRKRPWGR+AAEIRDP KK+RVWLGTFD+AEEAARAYD+AAR  RG KAKTNFP+
Subjt:  NNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPL

AT1G53170.1 ethylene response factor 84.4e-3041.67Show/hide
Query:  NNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVSPHNTNQSPSPTSTLDSSSSSTHEKTP
        +N AK++ +RGVRKRPWGRYAAEIRDP KK+RVWLGTFDTA++AARAYD AAR FRG KAKTNF +              SP+ +ST+  S ++    TP
Subjt:  NNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVSPHNTNQSPSPTSTLDSSSSSTHEKTP

Query:  SPEIARSYGVG----RTFPFIQPQFLHGGGTVRPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFR----PAKEILNLDLNLA
         P +  S G G    R  P + P + +   T                   YP              T G+Q+++ +SS+VDF          L+LDLNLA
Subjt:  SPEIARSYGVG----RTFPFIQPQFLHGGGTVRPLLFTDVYGRAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFR----PAKEILNLDLNLA

Query:  PPVD
        PP +
Subjt:  PPVD

AT3G15210.1 ethylene responsive element binding factor 46.1e-4048.13Show/hide
Query:  SNNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVS----PHNTNQSPSPTSTLDSSSSST
        ++NNAK++ +RGVRKRPWGRYAAEIRDP KK+RVWLGTFDTAEEAARAYDTAAR FRGAKAKTNFP    F+++S    P    +SPS +STLD +S   
Subjt:  SNNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVS----PHNTNQSPSPTSTLDSSSSST

Query:  HEKTPSPEIARSYGVGRTFPFIQPQFLHGGG-------TVRPLLFTDVYGRAEFVAHGYP----IRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFRPAKE-
            P   +  S   G   P ++     GGG         RP+ F D+ G    V  G P      F    V + ++   G Q+D++SSS+VDF    E 
Subjt:  HEKTPSPEIARSYGVGRTFPFIQPQFLHGGG-------TVRPLLFTDVYGRAEFVAHGYP----IRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFRPAKE-

Query:  ---ILNLDLNLAPP
           +L+LDLNL PP
Subjt:  ---ILNLDLNLAPP

AT3G20310.1 ethylene response factor 79.5e-2565.12Show/hide
Query:  SLPSLSNNNAKDLHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPTKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDTAARQFRGAKAKTNFPLPDDFIDVSPHNTNQ
        +LP  +  + K+  +RGVRKRPWGR+AAEIRDP KKSRVWLGTFD+A +AARAYDTAAR  RG KAKTNFP     ID SP +  Q
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AT5G44210.1 erf domain protein 97.7e-3547.42Show/hide
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        K++HFRGVRKRPWGRYAAEIRDP KK+RVWLGTFDTAEEAARAYDTAAR+FRG+KAKTNFPLP +   V+    N S    +T+ ++   T ++ P    
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Query:  ARSYGVGRTFPFIQPQFLHGGGTVRPLLFTDVYG---RAEFVAHGYPIRFDPATVDLTSRFTGGIQTDTNSSSLVDFRPAKEILNLDLNLAPPV
                 F   + + + GG       F        RAE ++   P+RFDP  ++L+     GI+        V   P +E LNLDLNLAPPV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTGCCAACCAAAAATCCCTTCCTTCTCTTTCCAACAACAATGCTAAGGATCTCCATTTCCGTGGCGTTCGTAAGAGGCCTTGGGGTCGATACGCTGCCGAGATCCG
TGATCCCACCAAGAAAAGCCGCGTTTGGCTCGGTACCTTCGACACCGCCGAGGAGGCTGCACGTGCTTACGACACTGCCGCCCGTCAGTTTCGTGGCGCCAAGGCTAAAA
CCAACTTTCCCCTTCCTGACGACTTCATCGACGTTTCTCCTCACAACACCAACCAAAGTCCTAGTCCTACCAGCACCCTCGACTCCTCTTCCTCCTCCACCCATGAGAAA
ACCCCCTCTCCGGAGATCGCCCGAAGCTACGGCGTTGGAAGAACTTTTCCATTCATTCAACCTCAGTTTTTACATGGGGGCGGCACCGTTCGTCCACTTTTGTTCACGGA
CGTTTATGGTAGAGCAGAATTCGTAGCTCATGGTTATCCTATACGGTTCGATCCGGCTACGGTGGATTTGACGTCGAGGTTCACCGGCGGGATCCAGACCGATACGAACT
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AAAGAAAAGAGAAGAAAAAAACATGATCCATCCGTAGGGCCCACCTCCATCCTGATGGCGCTACTATAAAACATAACTCCAGCACACCTAATTCTATCCCCAAATCAGTG
TAATCAAAACAACCTACACATCTCCTTCAACCACTCCTTTTTCGTTTAACAACCGCCATGGTTGCCAACCAAAAATCCCTTCCTTCTCTTTCCAACAACAATGCTAAGGA
TCTCCATTTCCGTGGCGTTCGTAAGAGGCCTTGGGGTCGATACGCTGCCGAGATCCGTGATCCCACCAAGAAAAGCCGCGTTTGGCTCGGTACCTTCGACACCGCCGAGG
AGGCTGCACGTGCTTACGACACTGCCGCCCGTCAGTTTCGTGGCGCCAAGGCTAAAACCAACTTTCCCCTTCCTGACGACTTCATCGACGTTTCTCCTCACAACACCAAC
CAAAGTCCTAGTCCTACCAGCACCCTCGACTCCTCTTCCTCCTCCACCCATGAGAAAACCCCCTCTCCGGAGATCGCCCGAAGCTACGGCGTTGGAAGAACTTTTCCATT
CATTCAACCTCAGTTTTTACATGGGGGCGGCACCGTTCGTCCACTTTTGTTCACGGACGTTTATGGTAGAGCAGAATTCGTAGCTCATGGTTATCCTATACGGTTCGATC
CGGCTACGGTGGATTTGACGTCGAGGTTCACCGGCGGGATCCAGACCGATACGAACTCATCGTCGTTGGTTGACTTCCGACCGGCGAAGGAAATTCTGAATCTCGATCTT
AATCTGGCTCCGCCGGTTGATGCTTAATTTCTCCGCTAATTTAGTCTTTTTCAATTAATTTTTTTGGGATTTAATTTTGTTAGAGATTTAGAAAGGGGAAAAAAAATTAA
CATGCTGGAAATAGGGTACTCTTTATTTCTCTCTCTCTTTTTTCTTTTTTTTGTCTTTTTTTGTGGCAGCTTGAGAGATGTTGTAATTCAATGTTGAATCTCGTAAGTGC
TATTGTAAAAATGCTGTAAGAAAAGAAGTGTAACCTTCAATTTTAAAGTTGGAACTAATAGAAAAAATGTTCCTTATCAACCAATTAACTCCGAATTTAGTCCTTCATAT
TTCTACATTTACTAGATCGTCACTACTTAATTATTAAATCTAAGTGGAAGTAATTTTCCCCGATTGGGCAGTATTATTATTGTTCTAAAAAATTCCTCCGTAAAATCTAG
CGGTGGAGAGAATTAAAGTAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGAAGAAAGTACTGGATTTTTTATTTAAACGGTGACCGACACGTGTAGGTTAGCGAGCATAATGAGA
GCCGCCCGACGCGACGCCGACGTGAGAAAATGAATTGATTAATTATTATTATTATTTTGTTAAAGAAAGAGGGGGTGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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