CuGenDBv2

Gene ID	CSPI07G05500
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Tropomyosin-like
Genome location	Chr7:4095400..4099638
RNA-Seq Expression	CSPI07G05500
Synteny	CSPI07G05500
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004136872.1 uncharacterized protein LOC101218756 isoform X1 [Cucumis sativus]

1.1e-69

100

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

XP_008455213.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495430 [Cucumis melo]

1.2e-68

98.65

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]

4.3e-66

93.24

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

XP_022967634.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1 [Cucurbita maxima]

8.1e-65

91.89

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG++
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]

7.4e-66

93.92

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEM SNL+SLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQRAAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K2J2 Uncharacterized protein

5.3e-70

100

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

A0A1S3C1M4 uncharacterized protein LOC103495430

5.9e-69

98.65

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2

8.8e-65

93.79

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG

A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1

2.1e-66

93.24

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1

3.9e-65

91.89

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG++
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G64180.1 unknown protein

1.1e-54

75.84

Show/hide

Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHV
        ME++  G+D RW G++ N+TEM SNLDSLQKLLLKKAV+V+++TF+RASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAIT+AAHARSEKRQAE++Q+AAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHV

Query:  QEVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        Q+VTKELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I+KRD +IKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  QEVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGCGCCGTTGCCAATCTCACAGAGATGACCTCCAACCTCGACTCACTCCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGT
CTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTCGATGCTG
CTATCACCTCTGCGGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAAGCAGAGGCAGCTCAAAGAGCTGCTGAAGTACATGTACAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTACGCGCAAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTTTTGGAGGCAATAATTCAAACTCTTGGTGGGAG
AGAATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TAAGAACAAACGATAACGCGGTAAAGTTGAGTGCTAAACATGATCGTCGGGTGGGTTCTTAGCTCCCTCGCTAAGTCTCTACACGGATCATGAAGTTCAACCATAATTGA
TTTGTGAATTTGCAAAACTGCAAGCCTCAGGGAAGATTCGGATCATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGCGCCGTTGCCAATCTCACAGAGATGACC
TCCAACCTCGACTCACTCCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGTCTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAAGCAAGGACGATCAAGGT
TCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTCGATGCTGCTATCACCTCTGCGGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAAGCAGAGGCAGCTCAAAGAGCTGCTG
AAGTACATGTACAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACAAAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTACGCGCAAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAAG
GATATTAAGCTTTTGGAGGCAATAATTCAAACTCTTGGTGGGAGAGAATAAAGTCTGCAAATATATTCTTAATGGTGTAAGGTTCTAAATGCAAATTCTTCCATTGCTTC
CATGCAAAAATGTCAAGAGGCCAACCTATTTGAGAGGATGTCATAAGTCCACCACTAAGCTATGGGTTTCAGTTGAGAAACAAACCATTGTTGATCAATTGGACTTTGCT
TGGGGCAGATAAAAAGATTAGTTCAACTCATAGTATTTCTCTATCCCATGGCTCAAGCAGCATGGGGCATTGTATAAAATTGTAGAAAGAAATTTCACCTGAATTAAAAC
TTCTAAAAGGATTTCGTTGTCATCACAATTATTACTATCATCTATGGGATTGATTTATACTGTAAATATTTTATCTTCAATATAGTAACAGCT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQEVTKELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

CSPI07G05500 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome