| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7022543.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 4.0e-121 | 86.69 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRD+DY+R RSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP------------SPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSP SPRRS SP+RSLSPRRSPSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP------------SPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 3.7e-143 | 99.65 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDY+RRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 1.1e-139 | 97.17 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRD+DY+RRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS+
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR+ESPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 1.4e-121 | 87.03 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRD+DY+R RSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 3.9e-132 | 93.64 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
IHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRR+RDDYRD+DY+RRSRSRSRSRS D++DRDRRGRE+ERER++RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
Query: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRGRSRSVDSGSPGR+SPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR SPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRP DSRSPSPQNSD
Subjt: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 1.8e-143 | 99.65 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDY+RRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 5.4e-140 | 97.17 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRD+DY+RRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS+
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR+ESPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 4.3e-121 | 89.05 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD RD+DY+RRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
Query: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRS+SRG+SRSVDS SPG RRS SPRRSLSP+RSPSPR ESP RNG+G GR+PT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 6.7e-122 | 87.03 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRD+DY+R RSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.1e-119 | 84.62 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+YRD+DY+R RSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------------RSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+ ADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------------RSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.3e-26 | 44.8 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + S Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS R R R R R +SRS R S SK R R + S S S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNG
RSRSR RSRS RSP P S R S S RS SP +SPE G
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-26 | 44.63 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS R R R R R +SRS R S SK R R + S S S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-26 | 44.63 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS R R R R R +SRS R S SK R R + S S S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-26 | 44.63 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS R R R R R +SRS R S SK R R + S S S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 2.0e-70 | 61.71 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR+KDY++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS +E SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 2.3e-13 | 37.73 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSR
+ R R R R +D +RR+ R SRS ++ RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R RSL+ R + RS
Subjt: SRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSR
Query: SVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PREESPERNGNGVGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
S RSP RSPSP+ RS+SPRRS S R SP R+ P SRS SP G D RSPS
Subjt: SVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PREESPERNGNGVGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 3.5e-14 | 36.84 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
+ E SR+R R R+P R + SRSRS RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R R
Subjt: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
Query: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PREESPERNGNGVGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
SL+ R + RS S RSP RSPSP+ RS+SPRRS S R SP R+ P SRS SP G D RSPS
Subjt: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PREESPERNGNGVGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 3.0e-13 | 36.86 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSR
+ + +S R++ R RSP R Y RR R RSRSRS N + R +SRS+SP+ RY+ E RS SR
Subjt: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSR
Query: SRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPS
S SR V SGSPGR R SPRRS+SPR++ S E R+ + V R S + PRG RSPS
Subjt: SRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 1.4e-71 | 61.71 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR+KDY++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS +E SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 1.4e-71 | 61.71 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR+KDY++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDKDYKRRSRSRSRSRSLDKNDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS +E SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPREESPERNGNGVGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
