; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G06170 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G06170
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionABC transporter C family member 8
Genome locationChr7:4587577..4588132
RNA-Seq ExpressionCSPI07G06170
SyntenyCSPI07G06170
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TYK03884.1 ABC transporter C family member 8 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-2468.69Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2Q3 Uncharacterized protein9.8e-2796.92Show/hide
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A0A0A0K7I7 Uncharacterized protein1.7e-58100Show/hide
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A0A0A0KCQ4 Uncharacterized protein5.4e-2568.69Show/hide
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A0A5A7UWE8 ABC transporter C family member 89.2e-2568.69Show/hide
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A0A5D3BXZ8 ABC transporter C family member 89.2e-2568.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XCD4 ABC transporter C family member 134.9e-1546.46Show/hide
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A7KVC2 ABC transporter C family MRP46.3e-1546.46Show/hide
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Q10RX7 ABC transporter C family member 134.9e-1546.46Show/hide
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Q8LGU1 ABC transporter C family member 81.5e-2465.31Show/hide
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Q9LYS2 ABC transporter C family member 103.7e-1550Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04120.1 multidrug resistance-associated protein 54.5e-1646.46Show/hide
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AT1G04120.2 multidrug resistance-associated protein 54.5e-1646.46Show/hide
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AT3G21250.1 multidrug resistance-associated protein 61.1e-2565.31Show/hide
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AT3G21250.2 multidrug resistance-associated protein 61.1e-2565.31Show/hide
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AT3G59140.1 multidrug resistance-associated protein 142.6e-1650Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TATTTCTCCAAACTTGTAAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTAAGTCTAGTTTCTCTTGAACTTTCACCCCTCGACCTGATTTTCTCCTCCCCTCCACTCTTCCCCTTGGCCTTTACTTTGATGATGATGAGATATGGAAGGCATTA
GAGAGGTGTCAGCTGAAGGCCACTGTCAGCAGTCTACCAAATCAGCTCGACTCATCTGTGGAAACTGGAGTGTGGGAAAACGCCAACTCTTCCGTCTCGGTCGAGTGCTA
CTCATACGACATAAAATTCTCGTTCTCGATGAGGCTACCACTTCAATCGACTCGGCAACTGACACCATTTTACAAAGAATTATAAGGGAAGGAGTTTTCAGAATGCACTA
TTGTAACAGTAGCTCACAGAGTTCTACCGTCTTTGACAATGACTTTGGTCATTTAGTTGAATATGAAGAACCCTCAAAGCTGATGGAAACCAACTCTTATTTCTCCAAAC
TTGTAAGCTGATCAATACTGGGCTAGCTGTCGGAGAGACTCTTCTCATTACTAAACACAACGTCTTGAAAACAAAGTATTGCTCTTTTTTTGGTACAATTGTAGAGATAA
GAACCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGIREVSAEGHCQQSTKSARLICGNWSVGKRQLFRLGRVLLIRHKILVLDEATTSIDSATDTILQRIIREGVFRMHYCNSSSQSSTVFDNDFGHLVEYEEPSKLMETNS
YFSKLVS