; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G09340 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G09340
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionSufE domain-containing protein
Genome locationChr7:7296474..7298245
RNA-Seq ExpressionCSPI07G09340
SyntenyCSPI07G09340
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR002634 - BolA protein
IPR003808 - Fe-S metabolism associated domain, SufE-like
IPR036065 - BolA-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646035.1 hypothetical protein Csa_016708 [Cucumis sativus]2.9e-15899.67Show/hide
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TYJ98710.1 sufE-like protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-17294.2Show/hide
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XP_004139770.1 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis sativus]4.5e-18399.71Show/hide
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XP_008447788.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis melo]7.9e-17293.91Show/hide
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XP_038897655.1 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial [Benincasa hispida]6.0e-16491.23Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8K1 SufE domain-containing protein2.2e-18399.71Show/hide
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A0A1S3BJ54 LOW QUALITY PROTEIN: sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial3.8e-17293.91Show/hide
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A0A5D3BG00 SufE-like protein 11.0e-17294.2Show/hide
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A0A6J1FMC1 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial5.0e-14882.27Show/hide
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A0A6J1J2B6 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial2.3e-14883.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P74523 Uncharacterized SufE-like protein slr14197.5e-3250.35Show/hide
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Q12238 UV-induced protein uvi311.1e-1448.35Show/hide
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        R  RI + L   L   ++ + + SY+H+ H  ++G  +  ETHF L++VS EF G S V RHRLVY LL+DE   GLHAL I S+KTPDE+
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Q3E793 BolA-like protein 11.4e-1458.21Show/hide
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        S++H GHAGV+GN   ETHF +++VSK+FEG  L +RHR+VY+LLQDE+   +G+HAL +S KTP E
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Q682I1 Protein BOLA1, chloroplastic2.9e-2856.9Show/hide
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        K      +SV  S +   GS S   + +R  R++E L++EL PVEL +ED+SYQHAGHAG++G  D ETHFN+K+VSK FEG +LVKRHRLVY+LL++EL
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         +GLHALSI +KTP E
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Q84W65 SufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial2.1e-10360.11Show/hide
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        +S  RL+  + ++ S  H P KT  + P      P  R   ++FQ++ +      S S+S +S   LQPIE+LPPKLQ+IVKLFQSVQ+ +AKYEQLMFY
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        GKNL PL  QFK   NKVEGCVSQVWVRA+ D ++NVVYEADSDSVLTKGLAALLV+GLS RPV EILR++PDF VLLGLQQSL+PSRNNG LNMLKLMQ
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        KKAL L V+ E+ + S  SS  +  S  + K E+N  +  ++SK   + D G++  D          LGSRG RI+E LE+EL+PVEL VED+SYQHAGH
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Query:  AGVR---GNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI
        A VR   G+DGETHFNL++VS  F+GKSLVKRHRL+Y+LLQDEL+SGLHALSI AKTP E+
Subjt:  AGVR---GNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55805.1 BolA-like family protein2.1e-2956.9Show/hide
Query:  KPESNTEKSVVDSKLGDKGSQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRG-NDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDEL
        K      +SV  S +   GS S   + +R  R++E L++EL PVEL +ED+SYQHAGHAG++G  D ETHFN+K+VSK FEG +LVKRHRLVY+LL++EL
Subjt:  KPESNTEKSVVDSKLGDKGSQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRG-NDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDEL

Query:  QSGLHALSISAKTPDE
         +GLHALSI +KTP E
Subjt:  QSGLHALSISAKTPDE

AT1G67810.1 sulfur E22.4e-0926.19Show/hide
Query:  SSSGFRLLTTESSILSHSPKTFFIP-------FNSHNFPFLRSVSFQRLPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLM
        +SS F+ L +   I +  P T   P       F+      +R         K+PS  S+ A+ +   PL    +   KL+ +V  F+S+ +   + ++L+
Subjt:  SSSGFRLLTTESSILSHSPKTFFIP-------FNSHNFPFLRSVSFQRLPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLM

Query:  FYGKNLKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRV-SPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLK
         Y   L PL    + + N+V GC +QVW+   +D    + ++ADSDS ++KG  + L+  L     +E++ V S D   +         SR N + N+L 
Subjt:  FYGKNLKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRV-SPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLK

Query:  LMQKKALALL---VESEKG--------------NGSAVSSSQTDDSAEKVKP
         MQK+ + L+   V  ++G              NGS + SS+  D +  + P
Subjt:  LMQKKALALL---VESEKG--------------NGSAVSSSQTDDSAEKVKP

AT4G26500.1 chloroplast sulfur E1.5e-10460.11Show/hide
Query:  SSGFRLLTTESSILS--HSP-KTFFI-PFNSHNFPFLRS--VSFQRLPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLMFY
        +S  RL+  + ++ S  H P KT  + P      P  R   ++FQ++ +      S S+S +S   LQPIE+LPPKLQ+IVKLFQSVQ+ +AKYEQLMFY
Subjt:  SSGFRLLTTESSILS--HSP-KTFFI-PFNSHNFPFLRS--VSFQRLPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLMFY

Query:  GKNLKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKLMQ
        GKNL PL  QFK   NKVEGCVSQVWVRA+ D ++NVVYEADSDSVLTKGLAALLV+GLS RPV EILR++PDF VLLGLQQSL+PSRNNG LNMLKLMQ
Subjt:  GKNLKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKLMQ

Query:  KKALALLVESEKGNGSAVSSSQTDDSAEKVKPESNTEKSVVDSK---LGDKGSQSSD---------VLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGH
        KKAL L V+ E+ + S  SS  +  S  + K E+N  +  ++SK   + D G++  D          LGSRG RI+E LE+EL+PVEL VED+SYQHAGH
Subjt:  KKALALLVESEKGNGSAVSSSQTDDSAEKVKPESNTEKSVVDSK---LGDKGSQSSD---------VLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGH

Query:  AGVR---GNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI
        A VR   G+DGETHFNL++VS  F+GKSLVKRHRL+Y+LLQDEL+SGLHALSI AKTP E+
Subjt:  AGVR---GNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEI

AT5G17560.1 BolA-like family protein3.8e-0734.86Show/hide
Query:  SVVDSKLGDKGSQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHAL-S
        S   S++ D GS    ++ S   +IKE    +LN   + V D+S            DG  H  + VVS  FEG+S V R R+VY  + +ELQ+ +HA+  
Subjt:  SVVDSKLGDKGSQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLHAL-S

Query:  ISAKTPDEI
        ++ KTP E+
Subjt:  ISAKTPDEI

AT5G50210.1 quinolinate synthase1.3e-1532.86Show/hide
Query:  SSILSHSP------KTFFIPFNSHN-----FPFLRSVSFQRLPSK--SPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLMFYGKN
        SS+LS +P      +T  + F S        P LRS    +  S+  + S  S+SA A+SS   Q  E +P KLQ +VK F+S+ +   + + ++ Y   
Subjt:  SSILSHSP------KTFFIPFNSHN-----FPFLRSVSFQRLPSK--SPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLMFYGKN

Query:  LKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPD-----FVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKL
        L  +    K  SN+V GC ++VW+ A L  D  + + ADSDS ++KG+ + L+Q L      E++ +  +      V LLG ++    SR N + N+L  
Subjt:  LKPLHPQFKNNSNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPD-----FVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKL

Query:  MQKKALALLVESE
        MQKK   L+ E E
Subjt:  MQKKALALLVESE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCATCTAGTGGCTTCCGATTGCTCACTACAGAATCCTCAATTCTTTCCCATTCTCCCAAAACTTTCTTCATCCCCTTCAATTCCCACAATTTCCCTTTTCTTCGATC
CGTTTCTTTCCAAAGATTACCCTCCAAATCCCCCTCTTCACTCTCCGTCTCTGCTTCCGCCGCCTCCTCCAAGCCTCTGCAACCCATTGAACAACTCCCTCCCAAGCTTC
AAGATATCGTCAAGCTCTTCCAATCGGTTCAGGATTCCAGGGCCAAGTACGAGCAGCTCATGTTCTATGGCAAAAACCTCAAACCCCTTCACCCCCAATTCAAAAACAAC
TCCAACAAGGTCGAGGGTTGCGTTTCTCAGGTCTGGGTCAGAGCTTATTTGGATTCCGATAAGAACGTTGTTTACGAGGCCGATTCCGACTCTGTTCTAACCAAGGGCCT
TGCCGCTCTGCTCGTTCAAGGTCTTTCCAATCGTCCTGTGGATGAGATTCTTAGGGTTTCTCCTGATTTCGTTGTTCTTCTTGGCCTTCAACAGAGCCTTACGCCTTCTA
GGAATAATGGGTTTCTGAATATGTTGAAGTTGATGCAGAAGAAGGCGCTTGCGTTGCTTGTGGAATCTGAAAAAGGTAATGGCAGTGCGGTTTCATCGTCACAAACAGAT
GATTCTGCTGAGAAAGTAAAACCAGAATCTAATACTGAGAAATCTGTTGTGGATTCGAAGTTGGGGGATAAAGGAAGTCAAAGTTCTGATGTATTAGGAAGTAGAGGGAA
GAGAATAAAGGAGATATTGGAGAGAGAGCTAAATCCGGTGGAATTGTATGTTGAAGACATCTCTTATCAACATGCAGGGCATGCTGGGGTAAGGGGTAATGATGGAGAAA
CTCACTTTAATTTGAAGGTTGTCTCAAAGGAGTTTGAAGGGAAAAGTTTAGTGAAGAGGCACAGGCTCGTTTATAATCTGTTGCAAGATGAGTTGCAGAGTGGACTCCAC
GCCTTATCCATCTCAGCAAAGACACCTGATGAAATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGTTATTTACTTTCTCAAATAAGAGAAAGGAAAAAACAAATCTTCCTTCTCCCACCATTTCTCGAAAACGTTCTTCTCCGAAGCAGAGTGTGCGAGTGGCTCAAGAGCTT
GAAGAATTTGAAGCCATGTCATCTAGTGGCTTCCGATTGCTCACTACAGAATCCTCAATTCTTTCCCATTCTCCCAAAACTTTCTTCATCCCCTTCAATTCCCACAATTT
CCCTTTTCTTCGATCCGTTTCTTTCCAAAGATTACCCTCCAAATCCCCCTCTTCACTCTCCGTCTCTGCTTCCGCCGCCTCCTCCAAGCCTCTGCAACCCATTGAACAAC
TCCCTCCCAAGCTTCAAGATATCGTCAAGCTCTTCCAATCGGTTCAGGATTCCAGGGCCAAGTACGAGCAGCTCATGTTCTATGGCAAAAACCTCAAACCCCTTCACCCC
CAATTCAAAAACAACTCCAACAAGGTCGAGGGTTGCGTTTCTCAGGTCTGGGTCAGAGCTTATTTGGATTCCGATAAGAACGTTGTTTACGAGGCCGATTCCGACTCTGT
TCTAACCAAGGGCCTTGCCGCTCTGCTCGTTCAAGGTCTTTCCAATCGTCCTGTGGATGAGATTCTTAGGGTTTCTCCTGATTTCGTTGTTCTTCTTGGCCTTCAACAGA
GCCTTACGCCTTCTAGGAATAATGGGTTTCTGAATATGTTGAAGTTGATGCAGAAGAAGGCGCTTGCGTTGCTTGTGGAATCTGAAAAAGGTAATGGCAGTGCGGTTTCA
TCGTCACAAACAGATGATTCTGCTGAGAAAGTAAAACCAGAATCTAATACTGAGAAATCTGTTGTGGATTCGAAGTTGGGGGATAAAGGAAGTCAAAGTTCTGATGTATT
AGGAAGTAGAGGGAAGAGAATAAAGGAGATATTGGAGAGAGAGCTAAATCCGGTGGAATTGTATGTTGAAGACATCTCTTATCAACATGCAGGGCATGCTGGGGTAAGGG
GTAATGATGGAGAAACTCACTTTAATTTGAAGGTTGTCTCAAAGGAGTTTGAAGGGAAAAGTTTAGTGAAGAGGCACAGGCTCGTTTATAATCTGTTGCAAGATGAGTTG
CAGAGTGGACTCCACGCCTTATCCATCTCAGCAAAGACACCTGATGAAATCTGAAGCCAATCTGTCATATCTCACTTCAAAGAGGTTTTCCTTCAATTTTATCTGTTCTT
AAGTTCTATTTTGTGGCTGAGGAGTATTTATGTTACCATTGTCATAATGTTCGGCTTAGATCTTGAAGTTTTAGTGTTAATGGATCTGTAAAATATTCTTGTTTTATGGA
TTATCATTATGATAGAAAAAGAAAGATAAAGATCTGAGGGCCTTTTGTAATATGAAGAACAAAACACATAATTTACCAATGAAATTTGTGATTGACTCATTTCATAGGCA
CAAAACTAATATAATGTATTCGTCTATCAGTCGTGTGGGTTTTGATTAACAACTTCTGCTAAACTGTCTTAAGAATTAATTCGATTTTTTTGTCTTACTAGTCTCCAAGC
TTGTAGATGTTTCTTTCTTAACAGGAACTCTGGTAAAGTCTCAAATGGATTTTTTTACCAAACTGCACCAAACTCTTAAGATTATGGACCACTCTAATTTCTAGCCATTG
AATTTGGAGTTTCTTCTCAGTCTAGTGGAACCTCTTAAAGTTGTGCACAATGGATTGATTGTGATAAATTGATGGATTGGGTTAGATGTGTACTTAAATAGACAGACCAT
TACAAAATAAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSSGFRLLTTESSILSHSPKTFFIPFNSHNFPFLRSVSFQRLPSKSPSSLSVSASAASSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKYEQLMFYGKNLKPLHPQFKNN
SNKVEGCVSQVWVRAYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKLMQKKALALLVESEKGNGSAVSSSQTD
DSAEKVKPESNTEKSVVDSKLGDKGSQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGNDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLVYNLLQDELQSGLH
ALSISAKTPDEI