; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G11290 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G11290
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationChr7:9505606..9508897
RNA-Seq ExpressionCSPI07G11290
SyntenyCSPI07G11290
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036519.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo var. makuwa]3.5e-10498.91Show/hide
Query:  TMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        TMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
Subjt:  TMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_004148299.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 isoform X2 [Cucumis sativus]2.0e-104100Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_008447054.1 PREDICTED: NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo]1.7e-10398.91Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_031744189.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 isoform X1 [Cucumis sativus]4.5e-128100Show/hide
Query:  MYWGTDVVGEYEEISLDKFGVSLDFILLQPIVGATCRTMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFE
        MYWGTDVVGEYEEISLDKFGVSLDFILLQPIVGATCRTMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFE
Subjt:  MYWGTDVVGEYEEISLDKFGVSLDFILLQPIVGATCRTMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFE

Query:  VTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE
        VTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE
Subjt:  VTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE

Query:  FNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        FNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  FNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]7.3e-10297.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K481 UBC core domain-containing protein9.9e-105100Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like8.4e-10498.91Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.7e-10498.91Show/hide
Query:  TMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        TMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
Subjt:  TMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like3.9e-10196.72Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NANG PPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPK+FE NVRRAMAGGYVGQT+FTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.6e-9995.08Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NA+G PPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVG T+FTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc123.3e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +        KK SA +LR+QKDI+ELNLPKTC+ISF +  DDL+NF++ I PDEG+Y  G F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.5e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +        KK SA +LR+QKDI+ELNLPKTC I F +  DDL+NF++ I PDEG+Y GG F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.5e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +        KK SA +LR+QKDI+ELNLPKTC I F +  DDL+NF++ I PDEG+Y GG F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.8e-8884.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQSAGELRL KDISELNLP +C+ISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.5e-8682.7Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAA--NANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT
        MI LFKVKEKQRE +   N  G   VKKQSAGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F+FSFQVS +YPHE PKVKCKT
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAA--NANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT

Query:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN+EDPLNH+AAAVLRDNPK FE+NVRRAM GG VGQT F RCM
Subjt:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein1.1e-8782.7Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAA--NANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT
        MI LFKVKEKQRE +   N  G   VKKQSAGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F+FSFQVS +YPHE PKVKCKT
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAA--NANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT

Query:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN+EDPLNH+AAAVLRDNPK FE+NVRRAM GG VGQT F RCM
Subjt:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 112.9e-2438.52Show/hide
Query:  RLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY
        R+ K++ +L      N S     +D+ +++ TI  P E  Y GG FL S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
Subjt:  RLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY

Query:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVR
         +  L T PN +DPL  + A + + +   +E   R
Subjt:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVR

AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 112.9e-2438.52Show/hide
Query:  RLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY
        R+ K++ +L      N S     +D+ +++ TI  P E  Y GG FL S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
Subjt:  RLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY

Query:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVR
         +  L T PN +DPL  + A + + +   +E   R
Subjt:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVR

AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 12.0e-8984.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQSAGELRL KDISELNLP +C+ISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 12.0e-8984.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQSAGELRL KDISELNLP +C+ISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACTGGGGAACAGATGTGGTTGGGGAATATGAGGAGATTTCTCTAGACAAGTTTGGGGTCTCATTGGATTTTATTTTATTACAGCCAATTGTTGGTGCAACCTGTAG
AACGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGCTAATGCCAATGGAGTACCTCCTGTCAAGAAGCAAAGTGCTGGAGAATTGCGTCTTCAAA
AAGATATCAGTGAATTGAACCTACCAAAAACGTGTAATATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTAT
CTAGGCGGTACGTTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACCAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGG
AAATGTTTGTCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCC
TGAACCACGATGCTGCAGCTGTTTTAAGGGATAACCCGAAGATGTTTGAATTCAACGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGTTATGTGGGACAAACTTACTTCACACGTTGC
ATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTCATTCACTGATCCAAGATTATTGATTTTGTGTTTGATGAATCTTATCTTGATTGCCCACTTGCATCTTATGTGTTCAACTCCCTTTTCCTGAGATCCTTATTGC
TTCGGTTCTTATTTTTATTATTATTTTCATCTTTTTATGCTTCTTTTGATCCAACCAGTTAATTATTGATTGAATGATTATGTAAACGTATACACGATGTACTGGGGAAC
AGATGTGGTTGGGGAATATGAGGAGATTTCTCTAGACAAGTTTGGGGTCTCATTGGATTTTATTTTATTACAGCCAATTGTTGGTGCAACCTGTAGAACGATGATTAAGC
TTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGCTAATGCCAATGGAGTACCTCCTGTCAAGAAGCAAAGTGCTGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAA
TTGAACCTACCAAAAACGTGTAATATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGCGGTACGTT
TCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACCAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAATGTTTGTCTCA
ATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCCTGAACCACGATGCT
GCAGCTGTTTTAAGGGATAACCCGAAGATGTTTGAATTCAACGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGTTATGTGGGACAAACTTACTTCACACGTTGCATGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYWGTDVVGEYEEISLDKFGVSLDFILLQPIVGATCRTMIKLFKVKEKQREIAANANGVPPVKKQSAGELRLQKDISELNLPKTCNISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYY
LGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFEFNVRRAMAGGYVGQTYFTRC
M