; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G12750 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G12750
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionExtensin like
Genome locationChr7:11031455..11032183
RNA-Seq ExpressionCSPI07G12750
SyntenyCSPI07G12750
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0068050.1 hypothetical protein E6C27_scaffold4741G00020 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-1872.22Show/hide
Query:  PPS-----PPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPP---KKSPPPPPKKSPPPPPKKS-PPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY
        PPS     PPPPP KRKSPPPPPPKR+EYLSPPPPP     K  PPPPPK+  PP P+KS PPPPP+K DNKSPPPPPP+K +++ S PPPPPKK  HEY
Subjt:  PPS-----PPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPP---KKSPPPPPKKSPPPPPKKS-PPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY

Query:  SS-PPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN
         S PPPPPP+KHKDKS LHHDPLTIN
Subjt:  SS-PPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN

KAB2635235.1 extensin-3-like [Pyrus ussuriensis x Pyrus communis]1.2e-0762.4Show/hide
Query:  PPSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK------SPPPPPKK------SPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSPPP
        PP PP  P+  KSPPPPPPK+  +   PPPPPPKK      SPPPPPKK       PPPPPK     KSPPPPPKK  + KSPPPPPPKK  H  S PPP
Subjt:  PPSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK------SPPPPPKK------SPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSPPP

Query:  PPKKDEHEYSSPPPPPPKK-HKDKS
        PPKK  H Y SPPPPPPKK H  KS
Subjt:  PPKKDEHEYSSPPPPPPKK-HKDKS

XP_011659754.2 extensin-3-like [Cucumis sativus]5.5e-4089.06Show/hide
Query:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYS--------------SPPPPPKKDE
        SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYS              SPPPPPKKDE
Subjt:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYS--------------SPPPPPKKDE

Query:  HEYSSPPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN
        HEYSSPPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN
Subjt:  HEYSSPPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN

XP_021978126.2 extensin-3 [Helianthus annuus]9.5e-0860.32Show/hide
Query:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPKKSPPPPPK-----KSPPPPPKKQD--NKSPPPPPPKKD-------EHEYSSPPPPP
        SPPPPP K KSPPPPP     Y SPPPPPP +    KSPPPPPKKSPPPPPK     KSPPPPP K+    KSPPPPPPKK         + Y SPPPPP
Subjt:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPKKSPPPPPK-----KSPPPPPKKQD--NKSPPPPPPKKD-------EHEYSSPPPPP

Query:  KKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH
         K+ + Y SPPPPPPKK       HH
Subjt:  KKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH

XP_022039692.1 extensin-3-like [Helianthus annuus]6.6e-0965.57Show/hide
Query:  SPPPPP----YKRKSPPPPPPKRD-EYLSPPPPPPPK----KSPPPPPKK------SPPPPPK-----KSPPPPPKK--QDNKSPPPPPPKKDEHEYSSP
        SPPPPP    YK KSPPPPPPK+  EY SPPPPPP      KSPPPPPKK       PPPPPK     KSPPPPP K     KSPPPPPPKK  +EY SP
Subjt:  SPPPPP----YKRKSPPPPPPKRD-EYLSPPPPPPPK----KSPPPPPKK------SPPPPPK-----KSPPPPPKK--QDNKSPPPPPPKKDEHEYSSP

Query:  PPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH
        PPPP K  +EY SPPPPPPKKH
Subjt:  PPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251U7B1 Putative extensin 34.6e-0860.32Show/hide
Query:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPKKSPPPPPK-----KSPPPPPKKQD--NKSPPPPPPKKD-------EHEYSSPPPPP
        SPPPPP K KSPPPPP     Y SPPPPPP +    KSPPPPPKKSPPPPPK     KSPPPPP K+    KSPPPPPPKK         + Y SPPPPP
Subjt:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPKKSPPPPPK-----KSPPPPPKKQD--NKSPPPPPPKKD-------EHEYSSPPPPP

Query:  KKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH
         K+ + Y SPPPPPPKK       HH
Subjt:  KKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH

A0A2P5CD94 Uncharacterized protein3.0e-0761.54Show/hide
Query:  PSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKK--------------SPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPK
        P PPPPPY   SPPPPPPK   Y SPPPPP   KSPPPPP +              SPPPPP   KSPPPPP K D KSPPPPPP KD+++Y SPPPPP 
Subjt:  PSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKK--------------SPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPK

Query:  KDEHEYSSPPPPPPKKH
        KD+++Y SPPPPPP  H
Subjt:  KDEHEYSSPPPPPPKKH

A0A2P5EUH3 Uncharacterized protein3.9e-0759.84Show/hide
Query:  PSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPK----KSPPPPPK-------------KSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPP
        P PPPPPY   SPPPPPPK   Y SPPPPP   KSPPPPP     KSPPPPPK             KSPPPPP K   KSPPPPPP KD+++Y SPPPPP
Subjt:  PSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPK----KSPPPPPK-------------KSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPP

Query:  KKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKS
         KD+++Y SPPPPP   +  KS
Subjt:  KKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKS

A0A5A7VLF0 Uncharacterized protein5.8e-1972.22Show/hide
Query:  PPS-----PPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPP---KKSPPPPPKKSPPPPPKKS-PPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY
        PPS     PPPPP KRKSPPPPPPKR+EYLSPPPPP     K  PPPPPK+  PP P+KS PPPPP+K DNKSPPPPPP+K +++ S PPPPPKK  HEY
Subjt:  PPS-----PPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPP---KKSPPPPPKKSPPPPPKKS-PPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY

Query:  SS-PPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN
         S PPPPPP+KHKDKS LHHDPLTIN
Subjt:  SS-PPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN

A0A5N5I4V5 Extensin-3-like6.0e-0862.4Show/hide
Query:  PPSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK------SPPPPPKK------SPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSPPP
        PP PP  P+  KSPPPPPPK+  +   PPPPPPKK      SPPPPPKK       PPPPPK     KSPPPPPKK  + KSPPPPPPKK  H  S PPP
Subjt:  PPSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK------SPPPPPKK------SPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSPPP

Query:  PPKKDEHEYSSPPPPPPKK-HKDKS
        PPKK  H Y SPPPPPPKK H  KS
Subjt:  PPKKDEHEYSSPPPPPPKK-HKDKS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTCCTCCTTCTCCACCCCCACCTCCATACAAAAGGAAATCCCCCCCTCCACCACCACCAAAGAGAGACGAATATCTCTCACCTCCACCACCTCCACCACCAAAAAA
GTCTCCTCCTCCACCGCCAAAAAAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCACCACCACCGCCAAAAAAGCAAGATAACAAGTCACCACCTCCACCGCCACCAAAGA
AAGACGAACATGAGTACTCCTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGACGAGCATGAGTACTCCTCTCCTCCACCACCACCGCCAAAGAAGCATAAGGACAAGTCAGCCCTC
CACCACGATCCCCTCACGATTAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTCCTCCTTCTCCACCCCCACCTCCATACAAAAGGAAATCCCCCCCTCCACCACCACCAAAGAGAGACGAATATCTCTCACCTCCACCACCTCCACCACCAAAAAA
GTCTCCTCCTCCACCGCCAAAAAAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCACCACCACCGCCAAAAAAGCAAGATAACAAGTCACCACCTCCACCGCCACCAAAGA
AAGACGAACATGAGTACTCCTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGACGAGCATGAGTACTCCTCTCCTCCACCACCACCGCCAAAGAAGCATAAGGACAAGTCAGCCCTC
CACCACGATCCCCTCACGATTAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGPPSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSAL
HHDPLTIN