; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G14550 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G14550
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr7:13056561..13057115
RNA-Seq ExpressionCSPI07G14550
SyntenyCSPI07G14550
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ADN34145.1 hypothetical protein [Cucumis melo subsp. melo]7.6e-5978.53Show/hide
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KAA0026217.1 hypothetical protein E6C27_scaffold19G001920 [Cucumis melo var. makuwa]6.5e-5876.51Show/hide
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        PTTYSQ +TPDKRFVPR +IK YFQK ++VYD  IE EYQSLTLEE VSKIFP++FNFLP+DL  I
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KAA0043136.1 putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]6.9e-6079.75Show/hide
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KAA0053156.1 hypothetical protein E6C27_scaffold1248G00100 [Cucumis melo var. makuwa]2.5e-4972.26Show/hide
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KAE8646253.1 hypothetical protein Csa_023844, partial [Cucumis sativus]1.1e-7397.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TM80 Putative Retrotransposon protein3.3e-6079.75Show/hide
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A0A5A7UFZ9 Uncharacterized protein1.2e-4972.26Show/hide
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A0A5D3BM67 Uncharacterized protein3.5e-4978.68Show/hide
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         IIEPEYQS+TLE+TVSKIF DNFN LP+DL    N
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A0A5D3E4J4 Uncharacterized protein3.1e-5876.51Show/hide
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E5GCE6 Uncharacterized protein3.7e-5978.53Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTTAGAAAGAGGAAACGCTAGAGGAAGAGCGACTTCTACCTCTTCAAGGGGCAATCGCCCATCTTCTTCTTCTAATTCTGCACCCTCACCAATGAGTGCAGATCA
ATATGCCATGGATTTAGGGTTTACCACAGTAACCCGATCCAGAGCAAGATCATCTCGCATACAGATTGGATCTCCCACGAAGTCATCAACTCCACCAAGGACTTCGGCCA
ATCTCATTCGTCCTTCAAGTGAAGTCGTTCAGATGAGGCCTCTTGCCTCTCCTTTATCTAATAGGGAGTCTTCTACTCCTCCTACTACTTATTCTCAAGTTATCACTCCT
GATAAAAGATTTGTACCTAGACTCGAAATCAAATCTTATTTTCAAAAACCAGTCATTGTTTATGATTCTATCATAGAACCCGAATATCAAAGTCTCACTCTAGAAGAGAC
AGTGTCAAAGATTTTTCCTGATAACTTTAATTTCCTTCCCGATGACCTGTGGTCAATCAATAACCCGTCGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCCAAAACTCTCTCTCCTTTCTAATAACATTCTCAAGAGTTAATGAGTTTAGAAAGAGGAAACGCTAGAGGAAGAGCGACTTCTACCTCTTCAAGGGGCAATCGCCCATC
TTCTTCTTCTAATTCTGCACCCTCACCAATGAGTGCAGATCAATATGCCATGGATTTAGGGTTTACCACAGTAACCCGATCCAGAGCAAGATCATCTCGCATACAGATTG
GATCTCCCACGAAGTCATCAACTCCACCAAGGACTTCGGCCAATCTCATTCGTCCTTCAAGTGAAGTCGTTCAGATGAGGCCTCTTGCCTCTCCTTTATCTAATAGGGAG
TCTTCTACTCCTCCTACTACTTATTCTCAAGTTATCACTCCTGATAAAAGATTTGTACCTAGACTCGAAATCAAATCTTATTTTCAAAAACCAGTCATTGTTTATGATTC
TATCATAGAACCCGAATATCAAAGTCTCACTCTAGAAGAGACAGTGTCAAAGATTTTTCCTGATAACTTTAATTTCCTTCCCGATGACCTGTGGTCAATCAATAACCCGT
CGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSLERGNARGRATSTSSRGNRPSSSSNSAPSPMSADQYAMDLGFTTVTRSRARSSRIQIGSPTKSSTPPRTSANLIRPSSEVVQMRPLASPLSNRESSTPPTTYSQVITP
DKRFVPRLEIKSYFQKPVIVYDSIIEPEYQSLTLEETVSKIFPDNFNFLPDDLWSINNPS