; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G15150 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G15150
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr7:13853258..13858764
RNA-Seq ExpressionCSPI07G15150
SyntenyCSPI07G15150
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593052.1 hypothetical protein SDJN03_12528, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-9980.69Show/hide
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XP_004150338.1 uncharacterized protein LOC101219919 [Cucumis sativus]5.1e-13099.57Show/hide
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XP_022960042.1 uncharacterized protein LOC111460909 [Cucurbita moschata]9.3e-10081.12Show/hide
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XP_038899087.1 uncharacterized protein LOC120086484 [Benincasa hispida]1.0e-10685.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K4R1 Uncharacterized protein2.5e-13099.57Show/hide
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A0A1S4DXB3 uncharacterized protein LOC1034897274.1e-11791.49Show/hide
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A0A6J1DS86 uncharacterized protein LOC1110230521.6e-9779.15Show/hide
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A0A6J1H692 uncharacterized protein LOC1114609094.5e-10081.12Show/hide
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A0A6J1KXA5 uncharacterized protein LOC1114979801.9e-9880.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07440.1 unknown protein4.2e-7468.9Show/hide
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        R  RT+A   RR +K     + K E KSEWW VDGEMHEIGD+VPPRERF IPR+N+PN+RRKQLR+QFMRRTRLVLKESEH+PWCKKYMELY ELRENW
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        ERLYWDEGYSKKLA DHANYESAEE  EDF+PYRNR+S +D+ KEQ F R  QG +WE VSQIRDKFEYDRERRM+++AFAPM+    +  S+   W  Q
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        R    P R+
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AT5G48530.1 unknown protein7.9e-6567.18Show/hide
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        MLS+  R  + + SL + +   R  RT+A +P RR+  P+   + K E KSEWW VDGEMHEIGD+VP RERF IPR+N+PN+RRKQLREQFMRRTRLVL
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        KESEH+PWCKKYMELY E+RENWERLYWDEGYSKK+ARDHANYESAEE  EDF+PYRNR+  +    +EQ F R  QG  +WE VSQIRDKFEYD
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCTCACTCACTCACAGATTTCGGACTCTGTCCTCATCTCTATGTTCCAATTCTCATCCATTTCGATCGTTCCGGACGGATGCCAGACCCTCCAGGCGGCACTCAAA
GCCTGCTCCATTCACAGTAAACAAGCCAGAACACAAGTCCGAGTGGTGGGCTGTTGATGGCGAAATGCATGAAATCGGCGACAATGTACCCCCTCGCGAGCGATTTATCA
TACCCAGAGAAAATCTCCCCAATCGGCGTCGAAAGCAGCTCAGGGAACAGTTCATGCGTCGGACTCGCCTCGTTCTCAAGGAATCAGAGCACGATCCATGGTGCAAAAAG
TACATGGAGCTTTATCAGGAGCTAAGGGAAAACTGGGAGAGATTGTACTGGGATGAGGGTTATTCCAAAAAACTTGCTAGGGATCATGCAAACTATGAGTCTGCTGAGGA
GGAAGACTTTTCTCCTTATAGGAATAGGCAATCCACTGATCGGAATAAGGAACAAGATTTTAGGAGGAACATGCAAGGTGGTCATTGGGAGAATGTCAGCCAGATTAGAG
ATAAGTTTGAATATGATAGAGAGAGAAGAATGAAAGAGAGAGCATTTGCACCTATGCATGGAGATCGAACTTTTCCCTCACAGATTCCTCGATGGCAACGAACAGATGTG
CAGCCACAAAGATACATGTCCGAGAGCGATAGTGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGACTTTGTTCTTTTGCGAACTATACTTCTCTAGACGCTGCTGCCCGGGTGCTGGAAAACCCTATTTGCGAGTTCTCTCCGTCGTATCGGAAAACATCCCTGCACCGGTC
TGAAGCTTCACAAGCTTATGCTCTCACTCACTCACAGATTTCGGACTCTGTCCTCATCTCTATGTTCCAATTCTCATCCATTTCGATCGTTCCGGACGGATGCCAGACCC
TCCAGGCGGCACTCAAAGCCTGCTCCATTCACAGTAAACAAGCCAGAACACAAGTCCGAGTGGTGGGCTGTTGATGGCGAAATGCATGAAATCGGCGACAATGTACCCCC
TCGCGAGCGATTTATCATACCCAGAGAAAATCTCCCCAATCGGCGTCGAAAGCAGCTCAGGGAACAGTTCATGCGTCGGACTCGCCTCGTTCTCAAGGAATCAGAGCACG
ATCCATGGTGCAAAAAGTACATGGAGCTTTATCAGGAGCTAAGGGAAAACTGGGAGAGATTGTACTGGGATGAGGGTTATTCCAAAAAACTTGCTAGGGATCATGCAAAC
TATGAGTCTGCTGAGGAGGAAGACTTTTCTCCTTATAGGAATAGGCAATCCACTGATCGGAATAAGGAACAAGATTTTAGGAGGAACATGCAAGGTGGTCATTGGGAGAA
TGTCAGCCAGATTAGAGATAAGTTTGAATATGATAGAGAGAGAAGAATGAAAGAGAGAGCATTTGCACCTATGCATGGAGATCGAACTTTTCCCTCACAGATTCCTCGAT
GGCAACGAACAGATGTGCAGCCACAAAGATACATGTCCGAGAGCGATAGTGACTGACAAATTGACTAAAACTTTATCTGCGTCTATGTGAAGAAGAGATGGAGAGAAAAG
TGGCGATTGGATGTATGGTGGTCGAAGAGGGTAAGTGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLSLTHRFRTLSSSLCSNSHPFRSFRTDARPSRRHSKPAPFTVNKPEHKSEWWAVDGEMHEIGDNVPPRERFIIPRENLPNRRRKQLREQFMRRTRLVLKESEHDPWCKK
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QPQRYMSESDSD