CuGenDBv2

Gene ID	CSPI07G16500
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	classical arabinogalactan protein 26
Genome location	Chr7:15106389..15107142
RNA-Seq Expression	CSPI07G16500
Synteny	CSPI07G16500
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR039346 - Classical arabinogalactan protein 25/26

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6575865.1 hypothetical protein SDJN03_26504, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.5e-49

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XP_022953817.1 classical arabinogalactan protein 26 [Cucurbita moschata]

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XP_023548939.1 classical arabinogalactan protein 26-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

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A0A0A0K510 Uncharacterized protein

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A0A1S3BRG9 classical arabinogalactan protein 26

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A0A5A7UQZ3 Classical arabinogalactan protein 26

9.1e-53

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A0A6J1GPB2 classical arabinogalactan protein 26

2.7e-49

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A0A6J1JX46 classical arabinogalactan protein 26

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SwissProt top hits

e value

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Q94F57 Classical arabinogalactan protein 26

2.6e-04

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Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT2G47930.1 arabinogalactan protein 26

1.8e-05

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTCCATTTTCTCTCTCTACATTCCCATTTTCATGGCCTACACAGCTTCCGTTTTCCCTTTCTCTTTCGCTTCTTATCCCAATTACTTCCCTACCCACCTCATTTC
TTCCATCTCCGCCGCGCCCGAACTTTCTCCGTCACCAGCGCCGGCTTCAGACATTTCTCCACTCTTTCCCACTCCGGGAGACGCTACCCTTCCCCCCTCCTCCTTGCCTA
CCATACCCTCCAGTCCCAGCCCTCCGAACCCCGATTTTATGGACGCTGCGCCGGCGCCGGAGATGCCTCTTTCGCCCTCTCAGTCCTTGCCATTCTCTACAGCTGCTGCT
CTTAACTCCGGTGGGTGGTGTTGTTCGGTCTTTGTAGCTCTTACGACGACTCTCGTTGCAGAGCTACGCCGGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AACACTCTCTCACATCACACTCTCACCCTCTCTTTTCACCTTTAATAATCATAACCCCTTTCTTCTTCCTTCATATTCTTTCTTCTTCCTCTCAATTTCTCTACTTTCTT
TTAGAAACATAAAATCTCTCTCTCATCATTGTAAATGGCTTCCATTTTCTCTCTCTACATTCCCATTTTCATGGCCTACACAGCTTCCGTTTTCCCTTTCTCTTTCGCTT
CTTATCCCAATTACTTCCCTACCCACCTCATTTCTTCCATCTCCGCCGCGCCCGAACTTTCTCCGTCACCAGCGCCGGCTTCAGACATTTCTCCACTCTTTCCCACTCCG
GGAGACGCTACCCTTCCCCCCTCCTCCTTGCCTACCATACCCTCCAGTCCCAGCCCTCCGAACCCCGATTTTATGGACGCTGCGCCGGCGCCGGAGATGCCTCTTTCGCC
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GGGTGCACCGCCATTGCTCGGATTTTAGTGGACATTGGAGTGTAGTTATGTTTTATGGCACGAGTAATTCTCTTATCTTTTACTTTTTGTTTTCTTGTTACTACATATAT
GTATATTTAATTTTTGGATTTGAGTCAATTTTTATTTTTTCAATTCCATAATTTGGGTTTTTTGGGGAAAGAAAATTGAATTATTCTTTGAACG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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LNSGGWCCSVFVALTTTLVAELRR

CSPI07G16500 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome