CuGenDBv2

Gene ID	CSPI07G16900
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	R3H-assoc domain-containing protein
Genome location	Chr7:15452882..15456698
RNA-Seq Expression	CSPI07G16900
Synteny	CSPI07G16900
Gene Ontology terms	GO:0009058 - biosynthetic process (biological process) GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function) GO:0003824 - catalytic activity (molecular function)
InterPro domains	IPR025952 - R3H-associated N-terminal domain IPR036867 - R3H domain superfamily IPR039629 - R3H domain-containing protein 4

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

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XP_023515083.1 R3H domain-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038896192.1 R3H domain-containing protein 4 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0K5V5 R3H-assoc domain-containing protein

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A0A1S3BS51 uncharacterized protein LOC103492685

3.3e-133

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A0A6J1DA21 uncharacterized protein LOC111018421 isoform X1

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A0A6J1HB10 R3H domain-containing protein 4-like

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A0A6J1KSN3 R3H domain-containing protein 4-like

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SwissProt top hits

e value

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Alignment

Q2KIL7 R3H domain-containing protein 4

4.8e-04

27.32

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        L  K   RKS +R  N + L+ L+    A      G  APP           + T  E W+ F +   +++ +++   E+   S A+R+G    +     
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Query:  --AFL--NAWRRIECRTREALRRS-FRVELVEGYEECIRSFISDTCKEDVLIMRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVTV-LESK
          A+     ++RI  R R  L+RS   +E +E +EE +  F S    + V    + + F RLLLH +C++ +L S +  LE K
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Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT1G03250.1 unknown protein

1.3e-84

62.4

Show/hide

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        MA+T+V+ R+      S L DP  GDT  SRG+S+EKKIE LESL G+V+NR+SRRWLNDR+LMELVPRL+A+EIRGLFAPPPWGDDV P+ FS+TN  +
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        WDKFR+IDMDKEA I+     SS ++KG +D DK+A LNAWRRI+CRTR+ALRRSF  EL+EGYE CI  FI +  + DVL ++VQDPFHRLLLHGVCE+
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        +NL S T  E     +MK T I  KK     E P+I+L HFL+MSKEG W
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AT1G03250.2 unknown protein

1.2e-82

60.94

Show/hide

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        MA+T+V+ R+      S L DP  GDT  SRG+S+EKKIE LESL G+V+NR+SRRWLNDR+LMELVPRL+A+EIRGLFAPPPWGDDV P+ FS+TN  +
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Query:  WDKFRSIDMDKE------AKIIGVFENSSAKRKGHIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFRVELVEGYEECIRSFISDTCKEDVLIMRVQDPFHRLLL
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Query:  HGVCEFYNLDSVTVLESKNSGSMKMTRITRKKKA-MVEVPNITLTHFLKMSKEGTW
        HGVCE++NL S T  E     +MK T I  KK     E P+I+L HFL+MSKEG W
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTCCACTGATGTTCTTGAACGAGAAGGGAATCGTTTCCCCTTTTCCCCTCTTAACGATCCACTCAATGGTGATACGGATTCTCGGGGTATGTCAATCGAGAAGAA
GATAGAATTCTTGGAGAGCTTGACTGGGAAGGTTACCAATAGGAAGTCTCGCAGATGGTTAAACGATCGTCTTTTGATGGAACTTGTTCCTCGTTTGAATGCTGAGGAAA
TTAGAGGGCTGTTTGCTCCACCACCTTGGGGTGATGATGTACGGCCCACAACGTTCTCCATGACTAATGCAGAAGACTGGGACAAGTTCAGGAGTATTGACATGGATAAA
GAGGCTAAGATCATTGGAGTCTTCGAGAACTCATCTGCTAAGAGAAAGGGTCATATTGATGCAGATAAAATGGCTTTCTTGAATGCTTGGCGTAGAATTGAATGTCGAAC
AAGGGAGGCTCTTCGCCGTAGTTTTCGTGTGGAGCTTGTTGAAGGTTATGAGGAGTGCATAAGATCTTTTATTTCAGACACTTGTAAAGAAGATGTCTTAATCATGCGAG
TTCAAGATCCATTCCACAGATTATTGCTACATGGAGTTTGTGAGTTCTACAATTTGGACTCTGTGACCGTTCTCGAGTCGAAGAACAGTGGCTCTATGAAAATGACTCGG
ATAACAAGGAAGAAGAAGGCCATGGTTGAGGTCCCAAATATAACTCTGACCCATTTCCTTAAAATGTCCAAAGAAGGAACATGGTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CGGCGGAGAAAGACGTCGTCTTCTCAATCTCATCTGAAACAGAATATTCTTCCGAATCTAATCCTTCCCTCTGTTTCTCTTCCCAATTTCTAAGGCTCTGTTTCTTCCTT
CTTTTTTCAATCCTTGGATTCGATTTTGCCCTAATTTTCCCATCTCCATCTCCCTCAACTTCATCTTTCGCCGATTCTCCCCTTTCCGTCTTCTCATCCAACCTCAAAAA
ATCACCTTCCCTACAAGATTTTCAATCCCATCCACAACAGGGGAAAACCACCGCTTGGGCTTCAATCGGATTCTTAGTTTTCCTCTCTAATCATGGCTTCCACTGATGTT
CTTGAACGAGAAGGGAATCGTTTCCCCTTTTCCCCTCTTAACGATCCACTCAATGGTGATACGGATTCTCGGGGTATGTCAATCGAGAAGAAGATAGAATTCTTGGAGAG
CTTGACTGGGAAGGTTACCAATAGGAAGTCTCGCAGATGGTTAAACGATCGTCTTTTGATGGAACTTGTTCCTCGTTTGAATGCTGAGGAAATTAGAGGGCTGTTTGCTC
CACCACCTTGGGGTGATGATGTACGGCCCACAACGTTCTCCATGACTAATGCAGAAGACTGGGACAAGTTCAGGAGTATTGACATGGATAAAGAGGCTAAGATCATTGGA
GTCTTCGAGAACTCATCTGCTAAGAGAAAGGGTCATATTGATGCAGATAAAATGGCTTTCTTGAATGCTTGGCGTAGAATTGAATGTCGAACAAGGGAGGCTCTTCGCCG
TAGTTTTCGTGTGGAGCTTGTTGAAGGTTATGAGGAGTGCATAAGATCTTTTATTTCAGACACTTGTAAAGAAGATGTCTTAATCATGCGAGTTCAAGATCCATTCCACA
GATTATTGCTACATGGAGTTTGTGAGTTCTACAATTTGGACTCTGTGACCGTTCTCGAGTCGAAGAACAGTGGCTCTATGAAAATGACTCGGATAACAAGGAAGAAGAAG
GCCATGGTTGAGGTCCCAAATATAACTCTGACCCATTTCCTTAAAATGTCCAAAGAAGGAACATGGTAGTTTCAATTGATTAGATGAAGAAACTTGATAGGACCTTATTA
TTGCATTGATGTTTGTGACAATAATATTAAAGATTCAATGTTAGGGTACATTATTTAGACTTCAGGTTCGTACTGTACAGTTGTTGTAGCTATATATCCTGCTGCTGGAC
CAATGTGTACTGTAAATTATTCTCTCTTTCTCTTGTGGTACCAATTCATATCATTTGAACAAGGAAATGCCTTGCTTCCTTTATTCACAACACATTTCTTCCTTTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASTDVLEREGNRFPFSPLNDPLNGDTDSRGMSIEKKIEFLESLTGKVTNRKSRRWLNDRLLMELVPRLNAEEIRGLFAPPPWGDDVRPTTFSMTNAEDWDKFRSIDMDK
EAKIIGVFENSSAKRKGHIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFRVELVEGYEECIRSFISDTCKEDVLIMRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVTVLESKNSGSMKMTR
ITRKKKAMVEVPNITLTHFLKMSKEGTW

CSPI07G16900 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome