; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G17020 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G17020
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionProtein no-on-transient A-like
Genome locationChr7:15522770..15524703
RNA-Seq ExpressionCSPI07G17020
SyntenyCSPI07G17020
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0068047.1 protein no-on-transient A-like [Cucumis melo var. makuwa]6.4e-3581.65Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTG-TGTRNSAANRSRVDSFGLGF
        MAAIKSL+ ISLLALLFFSESLSTSAA+CRGASNSVT MLRRN+LQTATHEIADSEGKMNV IK+GG GR RP+ AGTG TG R SAA+RS+V SFGLGF
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTG-TGTRNSAANRSRVDSFGLGF

Query:  LLFFFGLVL
        LLFF  L L
Subjt:  LLFFFGLVL

KAG6575859.1 hypothetical protein SDJN03_26498, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.4e-1957.02Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADS------EGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDS
        MAA+KSL+S++LLALL FSESL+ SA +  G SNS+T MLRRN+LQTA H+IAD+      E KMNV IK+    R RP+     TGTR+SAANRSR+ S
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADS------EGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDS

Query:  FGLGFLLFFFGLVL
         G+G +L   GL L
Subjt:  FGLGFLLFFFGLVL

KAG6593163.1 hypothetical protein SDJN03_12639, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-1050.47Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFL
        MAAIK+L+SI+L+ALL F ESL TSAA  RGAS S+  +LRRNI+QT       +E K NV IK+    R RP+  G     + SAANRSR    G+G +
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFL

Query:  LFFFGLV
        L  F L+
Subjt:  LFFFGLV

KGN44886.1 hypothetical protein Csa_015765 [Cucumis sativus]7.3e-4799.07Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFL
        MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTR+SAANRSRVDSFGLGFL
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFL

Query:  LFFFGLVL
        LFFFGLVL
Subjt:  LFFFGLVL

XP_008451666.1 PREDICTED: protein no-on-transient A-like [Cucumis melo]1.6e-0947.55Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGA-SNSVTAMLRRNILQTATHEIA------DSEGKM-NVRIK----------------------KGGLGR
        MAAIK+ I ISLLALLFF E L       RGA SNSVT +L R ILQTA H+ A       SE KM NV +K                       GG GR
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGA-SNSVTAMLRRNILQTATHEIA------DSEGKM-NVRIK----------------------KGGLGR

Query:  FRP-----IGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFLLFFFGLVL
         R      +G G GTG   SAANRS V SFG+GFLLF  GL +
Subjt:  FRP-----IGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFLLFFFGLVL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAQ7 Uncharacterized protein3.5e-4799.07Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFL
        MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTR+SAANRSRVDSFGLGFL
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFL

Query:  LFFFGLVL
        LFFFGLVL
Subjt:  LFFFGLVL

A0A1S3BRF6 protein no-on-transient A-like7.7e-1047.55Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGA-SNSVTAMLRRNILQTATHEIA------DSEGKM-NVRIK----------------------KGGLGR
        MAAIK+ I ISLLALLFF E L       RGA SNSVT +L R ILQTA H+ A       SE KM NV +K                       GG GR
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGA-SNSVTAMLRRNILQTATHEIA------DSEGKM-NVRIK----------------------KGGLGR

Query:  FRP-----IGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFLLFFFGLVL
         R      +G G GTG   SAANRS V SFG+GFLLF  GL +
Subjt:  FRP-----IGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFLLFFFGLVL

A0A1S3BT53 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like1.3e-0444.55Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGL-----GRFRPIGAGTGTGTRN-SAANRSRVDS
        MAAI+ L+SI+LLALLFFSESL T        S+S+T +  RNIL T  H I +   + + + K   L      R RPI      G  + SA NRSRV S
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGL-----GRFRPIGAGTGTGTRN-SAANRSRVDS

Query:  F
        F
Subjt:  F

A0A5A7VLE5 Protein no-on-transient A-like3.1e-3581.65Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTG-TGTRNSAANRSRVDSFGLGF
        MAAIKSL+ ISLLALLFFSESLSTSAA+CRGASNSVT MLRRN+LQTATHEIADSEGKMNV IK+GG GR RP+ AGTG TG R SAA+RS+V SFGLGF
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTG-TGTRNSAANRSRVDSFGLGF

Query:  LLFFFGLVL
        LLFF  L L
Subjt:  LLFFFGLVL

A0A5D3D3Y6 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like1.2e-0543.59Show/hide
Query:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGL-----GRFRPIGAGTGTGTRN-SAANRSRVDS
        MAAI+ L+SI+LLALLFFSESL T        S+S+T +  RNIL T  H I +   + + + K   L      R RPI      G  + SA NRSRV S
Subjt:  MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGL-----GRFRPIGAGTGTGTRN-SAANRSRVDS

Query:  FGLGFLL---FFFGLVL
        F +G +L    F GL L
Subjt:  FGLGFLL---FFFGLVL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCCATCAAATCCCTAATTTCCATATCTCTTCTCGCCCTTCTTTTCTTCTCCGAATCCCTATCCACTTCTGCCGCCAATTGCCGCGGCGCTTCCAATTCTGTTAC
CGCAATGCTCCGCCGTAACATCCTTCAGACGGCGACTCATGAAATTGCAGATTCGGAAGGGAAGATGAATGTTCGTATCAAAAAAGGTGGACTGGGGCGGTTTCGACCCA
TAGGGGCTGGCACTGGAACTGGGACCCGTAATTCAGCAGCGAATCGGAGCCGAGTCGATTCTTTTGGCCTCGGATTTCTCCTCTTCTTCTTCGGGTTGGTCTTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACTCACGCTCACCTTCCTCGTTTTCTCTATTCATATATAAATTTCAATTTTCAACCAATTATCTCCACTTCCTTCTTTTCTCTTCTCTATCCCGCAAAAACCTCTAAAA
ATGGCTGCCATCAAATCCCTAATTTCCATATCTCTTCTCGCCCTTCTTTTCTTCTCCGAATCCCTATCCACTTCTGCCGCCAATTGCCGCGGCGCTTCCAATTCTGTTAC
CGCAATGCTCCGCCGTAACATCCTTCAGACGGCGACTCATGAAATTGCAGATTCGGAAGGGAAGATGAATGTTCGTATCAAAAAAGGTGGACTGGGGCGGTTTCGACCCA
TAGGGGCTGGCACTGGAACTGGGACCCGTAATTCAGCAGCGAATCGGAGCCGAGTCGATTCTTTTGGCCTCGGATTTCTCCTCTTCTTCTTCGGGTTGGTCTTGTAAAAT
CTGATTGATTTTGTTCGTTTCTGTAAAGAAAAACTGAGATTTATTTGGGATTTTATTAATTCATTTCGTTCTTTCTTATTTGATGATGAAAGATTGATGTGTGTGTCACT
GTGCTGTGTATGTTTATCTAAATATACGTATATATATAAACCCTTCCTCACGTCAAAATTTCAATTCAACAACTCTTCTTTTAACTTTGAATTCACCTCCCCTTCCCATT
AATATTTTATTCACCCCTCTTTATTAATTTTTAATTCAACACCCCCTCCTTCCAAATTCTAATTCAATCTTAAGCTCCTTTTACTTTTCAATTCAACTATTCTAATCCCC
TCCTAAAACACAATTTAATTCAAAATCGTATTCCTATAAAAAAAAACTAATTCAAAAACCAAATTTCTAATTCAAAACATAATTCTAATTTAAATCATAATTTCTCATCT
AAATAAAAAATAAATTACATCAAACAAATATAAAATAACCTTATTTACTGGTATGGGACAACAAACGACGGAAGACGACGACTAAATGACGGCAAGCGGCAAGCACCAAC
AATGAGGTGAGATCTCCTCTTCTTCTTTTCTGTCTCCCTCTCTCTCTCGTTTTTCTTTCACTTTTCTCTTTCGATTCTGTAGAACAAAAGGAGAATTCCTAACGCTGCTT
GAAAACGTCGAGATAGTCACCCTAATCCTGATGCCATTAGTGATGTGTCAGTATTAGGTACCATTTTCCCAACATTTCAAACGTGGTGTTGGAGGAAGGCAAAATGGTAC
AGTTAATGATTTGCCTCTGATTCGACGTCCACATCGGAAAAATCCTAATATTTCTGAGGCATCATTTATGGCATGGGAAAACATATCTTTTTTGTCGACATTTATGATGT
CGTGTTAGATGATATTTAACGGTATAATTATTTATTCTGAGTAGTTCCGACAGGGTTCACATGCGTCGGGGAAGAGAACCTCCATCGACGTTACATTGGTGCTTCGGTAG
AAACCACCTTCTACCGATGTTCGATTTCCTGATAATTTTTTGTGCGTTGGAAAAATCCTAATTTCTTGTAGTGCTTTTCGGTGACTCAATCATAGGAACTTCAAAGCATG
CTTAAAGAAGTACTCGTGTTCGTTTGTGAGGAGAACTTTCACTCTAATAAGTCTTTAAGACAATAAGGACGATGGTGTTGCCAGGTCGCAGAGGATGCAGGGGAATGTCA
AGGATCTGAAATTCCAAATCTTAGGCCTATGGCGTTACACTGGTCATCTCCATTGGATTCAAATACAATTCAAGGTGGTCATCTTCATTAGATTCAAATACAATTAAGGG
GAGTTTGATTATAACTAAAAAAAGTACTAGATCTAGAGAAAGTGTCTTCTAGATTGTTAAAGTGTTATACTTGTTCGAATCTTAATAAAATCTAGCGAGTTCACCGACCG
AACTGGATTAACAAAGTAGTGGGTTCACCGACCAAATTGAATTAACAAAAGTTTTTTGTATTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIKSLISISLLALLFFSESLSTSAANCRGASNSVTAMLRRNILQTATHEIADSEGKMNVRIKKGGLGRFRPIGAGTGTGTRNSAANRSRVDSFGLGFLLFFFGLVL