; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G17290 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G17290
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationChr7:15715130..15716181
RNA-Seq ExpressionCSPI07G17290
SyntenyCSPI07G17290
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008451660.1 PREDICTED: rapid alkalinization factor-like [Cucumis melo]1.0e-5193.75Show/hide
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XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]6.8e-56100Show/hide
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XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]5.1e-4377.12Show/hide
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XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]9.6e-4276.27Show/hide
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XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]1.2e-4784.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein3.3e-56100Show/hide
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A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like4.9e-5293.75Show/hide
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A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like4.9e-5293.75Show/hide
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A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 332.5e-4377.12Show/hide
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A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like4.6e-4276.27Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.3e-2553.7Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor5.9e-2655.05Show/hide
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        L + +L+    +S  A   S    WV+   +   C GS+ EC+ E+ EF++DSE NRRILA   YISY AL+ NSVPCSR+GASYYNC+PGA+ANPY RG
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        C+AI+RCRS
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.5e-2145.97Show/hide
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        +  I L++A+    + VSS +   +         C G++AEC +        D+         EF+MDSEINRRILA   YISY AL+ N++PCSR+GAS
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        YYNC+ GA+ANPY RGC+AI+RCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.2e-2466.22Show/hide
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        C GS+AEC+ E+ E + DS+I+RRILA   YISY A++ NSVPCSR+GASYYNCQ GA+ANPY RGC+ I+RCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 13.8e-2553.91Show/hide
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        +FL + IL V   +  P            +W   G + + CHGS+AEC+  + E +MDSEINRRILA   YISY +LK NSVPCSR+GASYYNCQ GA+A
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        NPY RGC+ I+RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 12.7e-2653.91Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 199.6e-1642.06Show/hide
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        + I L++ +LT++  A++   +W L  +     G    C+ ED  +++ MDSE NRR + A  +YISY AL+ N+VPCSR+G SYY+C+    ANPY RG
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        C+ I+ C
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AT3G05490.1 ralf-like 222.3e-2566.22Show/hide
Query:  CHGSMAECMMEDIEFQMDSEINRRILADLNYISYDALKANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRGCNAISRCR
        C GS+AEC+ E+ E + DS+I+RRILA   YISY A++ NSVPCSR+GASYYNCQ GA+ANPY RGC+ I+RCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.8e-2245.97Show/hide
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        +  I L++A+    + VSS +   +         C G++AEC +        D+         EF+MDSEINRRILA   YISY AL+ N++PCSR+GAS
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Query:  YYNCQPGAEANPYDRGCNAISRCR
        YYNC+ GA+ANPY RGC+AI+RCR
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AT4G15800.1 ralf-like 339.3e-2753.7Show/hide
Query:  PIFLLVAILTV----SSTAKTPSWVLDGAHARCHGSMAECMME--DIEFQMDSEINRRILADLNYISYDALKANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRG
        P+ +++AILTV    ++     S       ++C+G++AEC +   + EF+MDSEINRRILA   YISY AL+ N+VPCSR+GASYYNC+ GA+ANPY RG
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Query:  CNAISRCR
        C+AI+RCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACCACGGTTTCTTTTCTTCTTCCAATTTTCTTACTAGTTGCTATCCTGACGGTCTCCTCCACCGCCAAGACCCCAAGCTGGGTCCTAGATGGAGCTCATGCTCG
TTGTCACGGATCCATGGCAGAGTGCATGATGGAAGATATTGAGTTTCAGATGGACTCTGAGATCAACAGACGCATATTGGCAGATTTAAACTACATAAGCTATGACGCAC
TCAAGGCCAACTCAGTGCCATGCTCACGCAAAGGAGCATCTTACTACAACTGTCAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTATGACCGTGGCTGTAATGCTATTTCTCGTTGT
CGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATATAACAAATCAAAAAAAATAAAAATAGAAGTAGCTACCAGCTCCTGTTTACCAATTCCAAGTAACCTGCTTGTATTTCAATATAAAAGATTAAAGTGGATTGTATAGA
TGACATACCAGGAAGAGCAAGAGAGAAAGTAACAATGGCCACCACGGTTTCTTTTCTTCTTCCAATTTTCTTACTAGTTGCTATCCTGACGGTCTCCTCCACCGCCAAGA
CCCCAAGCTGGGTCCTAGATGGAGCTCATGCTCGTTGTCACGGATCCATGGCAGAGTGCATGATGGAAGATATTGAGTTTCAGATGGACTCTGAGATCAACAGACGCATA
TTGGCAGATTTAAACTACATAAGCTATGACGCACTCAAGGCCAACTCAGTGCCATGCTCACGCAAAGGAGCATCTTACTACAACTGTCAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCC
CTATGACCGTGGCTGTAATGCTATTTCTCGTTGTCGAAGCTAACGAGTTATGTTTACTGTTTCACCAGATATGGGCAGTAGTAGTTGTATGAAGTCATCATAGAGTATAA
TCATCACTATATTATCAATAAGAAATCATGCAGAAACAGCAAGTCCAAGCCTATATCATATTTTGCTCTTTTCTGTTTCATTCTAAGCATTGGTTTCAACTTCACAAAGG
CAATAGCAAAAAGAGAATATTGCAACAAACTCATCAATAAAGTGAACAATCTCAACTATTTCTAGGCAGAACCTTCATCTTTCTTCACTTCATCTGCAACTGATTTTGAT
GGAGGTAGTGGCGACGGAGAGCCCTCGACACCCATCTCGGCCTTTAGGTCATTGATGCTCTGCTCCAATTCATTTATGCGGCTCCCCATCTCATCGAGTATATTCAAGTT
AAAGAAAGCTTATTTACTATAAGTTAACTTATTACAACAAAGCTATCCTACAATCTACTTCTCTTCCAATGTATCTGAAACCCAAAGTTGTATTAGAAAGTCAAAACATT
CTAATTAGCAGTCAAGGTGAATTATATAGAGGATCTCAGATTGTAATGGATTCAAATATCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATTVSFLLPIFLLVAILTVSSTAKTPSWVLDGAHARCHGSMAECMMEDIEFQMDSEINRRILADLNYISYDALKANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRGCNAISRC
RS