; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G17730 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G17730
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionAnkyrin repeat protein
Genome locationChr7:15965611..15966234
RNA-Seq ExpressionCSPI07G17730
SyntenyCSPI07G17730
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046649.1 Ankyrin repeat protein [Cucumis melo var. makuwa]7.4e-3243.66Show/hide
Query:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIG--TPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVG-IAPVGLETMINKEDKVQS
        M   +GFKLF TL L+F+W+ CC +VGATF D TG++  G+NH++SF AFG   +G  +  V    +S V  +  A+AP   I P G E  +  ++   S
Subjt:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIG--TPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVG-IAPVGLETMINKEDKVQS

Query:  YDLDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIA-----FSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVS
        +D +         A +S DH+ +  SG +IA      S GGK+ VKS  + A S     +G++    N K LSFG+EI+K++ A+LGLKAH  KV+VGVS
Subjt:  YDLDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIA-----FSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVS

Query:  HGGNISMNKRGSI
        HGGNIS+ KRGSI
Subjt:  HGGNISMNKRGSI

KAA0048674.1 Ankyrin repeat protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-9284.95Show/hide
Query:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDL
        M M RGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATF+D TGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTP+VDG+ITSTVKKQI AEAP GIAPVGL+T+INKE K QSYDL
Subjt:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDL

Query:  DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMN
        DIIKQIKGGGA +S+DHESNLN+GENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGG ING    I+N KGLSFGV+IKKDH A+LGLK H+GKVNVGVS+GGNIS+N
Subjt:  DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMN

Query:  KRGSIV
        KRGS+V
Subjt:  KRGSIV

KAA0048677.1 Ankyrin repeat protein [Cucumis melo var. makuwa]8.9e-8680.91Show/hide
Query:  MEMARG-FKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYD
        M M RG FKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSD TGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTP+VDGSI STVKKQI AEAPVGIAPVGLET INK+DKVQS +
Subjt:  MEMARG-FKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYD

Query:  LDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLS--FGVEIKKDHGATL-----------GLKAHKGK
         DIIKQIKGGGA VS+DHES LNSGENIAFS+ GKVSVKSK SVAGSSGG ING+  KI+N KGLS  FGVEIKKDH A+L           G+KAHKGK
Subjt:  LDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLS--FGVEIKKDHGATL-----------GLKAHKGK

Query:  VNVGVSHGGNISMNKRGSIV
        VNVGVSHGGNIS+NKRGS+V
Subjt:  VNVGVSHGGNISMNKRGSIV

KAE8646351.1 hypothetical protein Csa_023818, partial [Cucumis sativus]9.0e-5463.54Show/hide
Query:  ATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDLDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENI
        ATF+D TGVVN  LNH FSFR FGWP IGTP+ DGS+ STV    HAEAP GIAPVGL+T INK DKV ++ L+IIKQI+  G VVS DHE NL SG NI
Subjt:  ATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDLDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENI

Query:  AFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRK-------------IHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMNKRGSIV
        A SHGGK+S+K KG V+ S  G   G+K                 N KGLSFGVEIKKDH A+LGLKA KGK+N GVSHGGNIS+ KRGSIV
Subjt:  AFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRK-------------IHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMNKRGSIV

KAE8646352.1 hypothetical protein Csa_015951, partial [Cucumis sativus]1.2e-9595.16Show/hide
Query:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDL
        M MARGF LFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTP+VDGSITSTV+KQI AEAP GIAPVGLETMINKEDKVQSYDL
Subjt:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDL

Query:  DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGK
        DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGG ING+KRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGA LGLKAHKGK
Subjt:  DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5J0 Uncharacterized protein6.1e-6464.52Show/hide
Query:  MARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDLDI
        MARGFKLFQTL LVFAW++ C +V ATF+D TGVVN  LNH FSFR FGWP IGTP+ DGS+ STV    HAEAP GIAPVGL+T INK DKV ++ L+I
Subjt:  MARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDLDI

Query:  IKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRK-------------IHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNV
        IKQI+  G VVS DHE NL SG NIA SHGGK+S+K KG V+ S  G   G+K                 N KGLSFGVEIKKDH A+LGLKA KGK+N 
Subjt:  IKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRK-------------IHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNV

Query:  GVSHGGNISMNKRGSIV
        GVSHGGNIS+ KRGSIV
Subjt:  GVSHGGNISMNKRGSIV

A0A0A0K7W7 Uncharacterized protein2.3e-11198.07Show/hide
Query:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDL
        MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAP GIAPVGLETMINKEDKVQSYDL
Subjt:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDL

Query:  DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMN
        DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGG ING+KRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNIS+N
Subjt:  DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMN

Query:  KRGSIVI
        KRGSIVI
Subjt:  KRGSIVI

A0A0A0KAZ8 Uncharacterized protein5.8e-9195.56Show/hide
Query:  ATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDLDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENI
        ATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTP+VDGSITSTV+KQI AEAP GIAPVGLETMINKEDKVQSYDLDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENI
Subjt:  ATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDLDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENI

Query:  AFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMNKRGSIVI
        AFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGG ING+KRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGA LGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMNKRGSI I
Subjt:  AFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMNKRGSIVI

A0A5A7U057 Ankyrin repeat protein8.1e-9384.95Show/hide
Query:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDL
        M M RGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATF+D TGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTP+VDG+ITSTVKKQI AEAP GIAPVGL+T+INKE K QSYDL
Subjt:  MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDL

Query:  DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMN
        DIIKQIKGGGA +S+DHESNLN+GENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGG ING    I+N KGLSFGV+IKKDH A+LGLK H+GKVNVGVS+GGNIS+N
Subjt:  DIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMN

Query:  KRGSIV
        KRGS+V
Subjt:  KRGSIV

A0A5A7U318 Ankyrin repeat protein4.3e-8680.91Show/hide
Query:  MEMARG-FKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYD
        M M RG FKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSD TGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTP+VDGSI STVKKQI AEAPVGIAPVGLET INK+DKVQS +
Subjt:  MEMARG-FKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYD

Query:  LDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLS--FGVEIKKDHGATL-----------GLKAHKGK
         DIIKQIKGGGA VS+DHES LNSGENIAFS+ GKVSVKSK SVAGSSGG ING+  KI+N KGLS  FGVEIKKDH A+L           G+KAHKGK
Subjt:  LDIIKQIKGGGAVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLS--FGVEIKKDHGATL-----------GLKAHKGK

Query:  VNVGVSHGGNISMNKRGSIV
        VNVGVSHGGNIS+NKRGS+V
Subjt:  VNVGVSHGGNISMNKRGSIV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATGGCTAGAGGCTTTAAGCTCTTTCAAACTCTTTGCTTGGTGTTTGCTTGGAAATATTGTTGTGCACAAGTAGGTGCCACTTTTAGCGATGCTACCGGTGTCGT
AAATGCCGGCCTCAATCATCAATTTTCATTTCGTGCATTTGGATGGCCTCATATTGGAACTCCGGATGTCGATGGTAGCATCACATCAACCGTAAAAAAACAAATACATG
CAGAAGCACCAGTAGGCATTGCTCCTGTTGGGCTTGAAACTATGATCAACAAAGAGGACAAAGTTCAATCTTATGATCTTGATATTATTAAGCAGATCAAAGGTGGCGGC
GCCGTTGTTTCTCATGATCATGAAAGTAATTTGAACAGTGGTGAGAATATTGCATTTTCTCATGGTGGAAAAGTTAGTGTAAAGAGCAAAGGTAGTGTTGCTGGTTCAAG
TGGTGGTACAATTAATGGTATGAAGAGGAAGATTCATAATTACAAAGGTTTGTCTTTTGGTGTTGAAATTAAAAAGGACCATGGTGCAACTCTTGGTCTCAAAGCTCACA
AGGGAAAGGTTAATGTTGGTGTTTCTCATGGTGGTAACATTAGTATGAACAAGAGAGGTAGTATTGTCATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAATGGCTAGAGGCTTTAAGCTCTTTCAAACTCTTTGCTTGGTGTTTGCTTGGAAATATTGTTGTGCACAAGTAGGTGCCACTTTTAGCGATGCTACCGGTGTCGT
AAATGCCGGCCTCAATCATCAATTTTCATTTCGTGCATTTGGATGGCCTCATATTGGAACTCCGGATGTCGATGGTAGCATCACATCAACCGTAAAAAAACAAATACATG
CAGAAGCACCAGTAGGCATTGCTCCTGTTGGGCTTGAAACTATGATCAACAAAGAGGACAAAGTTCAATCTTATGATCTTGATATTATTAAGCAGATCAAAGGTGGCGGC
GCCGTTGTTTCTCATGATCATGAAAGTAATTTGAACAGTGGTGAGAATATTGCATTTTCTCATGGTGGAAAAGTTAGTGTAAAGAGCAAAGGTAGTGTTGCTGGTTCAAG
TGGTGGTACAATTAATGGTATGAAGAGGAAGATTCATAATTACAAAGGTTTGTCTTTTGGTGTTGAAATTAAAAAGGACCATGGTGCAACTCTTGGTCTCAAAGCTCACA
AGGGAAAGGTTAATGTTGGTGTTTCTCATGGTGGTAACATTAGTATGAACAAGAGAGGTAGTATTGTCATCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEMARGFKLFQTLCLVFAWKYCCAQVGATFSDATGVVNAGLNHQFSFRAFGWPHIGTPDVDGSITSTVKKQIHAEAPVGIAPVGLETMINKEDKVQSYDLDIIKQIKGGG
AVVSHDHESNLNSGENIAFSHGGKVSVKSKGSVAGSSGGTINGMKRKIHNYKGLSFGVEIKKDHGATLGLKAHKGKVNVGVSHGGNISMNKRGSIVI