; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI07G19360 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI07G19360
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionarabinogalactan peptide 23-like
Genome locationChr7:17058634..17059937
RNA-Seq ExpressionCSPI07G19360
SyntenyCSPI07G19360
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044702 - Arabinogalactan protein 23/40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7025661.1 Arabinogalactan peptide 23, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.1e-0975.76Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA ++A VA+DESL    SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
KGN45143.1 hypothetical protein Csa_016530 [Cucumis sativus]5.7e-19100Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
XP_008461276.1 PREDICTED: arabinogalactan peptide 23-like [Cucumis melo]6.5e-1590.62Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+SAAVAADES+    SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
XP_023004714.1 arabinogalactan peptide 23-like [Cucurbita maxima]4.1e-0975.76Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA ++A VA+DESL    SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
XP_038899473.1 arabinogalactan protein 23-like [Benincasa hispida]3.7e-1079.41Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+S+AVAADESL    SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+V+FV AYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYFLN
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L5 Uncharacterized protein2.8e-19100Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
A0A1S3CDX5 arabinogalactan peptide 23-like3.2e-1590.62Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+SAAVAADES+    SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
A0A6J1F3F5 arabinogalactan peptide 23-like2.9e-0872.73Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA ++A VA+DESL    SPAAAPGPSSAASA LP L    GAS+VS VA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
A0A6J1H8I1 arabinogalactan peptide 23-like2.6e-0975.76Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA ++A VA+DESL    SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
A0A6J1KX42 arabinogalactan peptide 23-like2.0e-0975.76Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA ++A VA+DESL    SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8S2W4 Arabinogalactan protein 234.9e-0556.92Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY
        MEMKKIAC  LFAAA+++A +AA+E  +P      APGP+SAASAALP L    GAS+VS  + Y
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G57690.1 arabinogalactan protein 233.5e-0656.92Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY
        MEMKKIAC  LFAAA+++A +AA+E  +P      APGP+SAASAALP L    GAS+VS  + Y
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAATAGTAGAGGGTCTTTTCCACCCACCACATTCTTCTACTCCTCTGGCAGCAATCCATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAAAGGCTTCTTCGGTTCGATC
GCTCTCATCTCCACCGGAAGTGAGTTTTCTGCCGAAGAAAGCCAATTCGCTCAACCCCATCCCATCATCCTCAATGGAAATGAAGAAGATCGCCTGCGCTGCTCTTTTCG
CCGCCGCTGCCATCAGCGCCGCCGTGGCTGCCGATGAGTCTCTCTCTCCCGGCGCTTCTCCCGCCGCTGCCCCGGGGCCGAGCAGTGCCGCCTCCGCCGCTCTCCCCGTT
CTCGGTGCCTCAGTTGTTTCCTTTGTTGCTGCTTACTTCTTGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGAATAGTAGAGGGTCTTTTCCACCCACCACATTCTTCTACTCCTCTGGCAGCAATCCATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAAAGGCTTCTTCGGTTCGATC
GCTCTCATCTCCACCGGAAGTGAGTTTTCTGCCGAAGAAAGCCAATTCGCTCAACCCCATCCCATCATCCTCAATGGAAATGAAGAAGATCGCCTGCGCTGCTCTTTTCG
CCGCCGCTGCCATCAGCGCCGCCGTGGCTGCCGATGAGTCTCTCTCTCCCGGCGCTTCTCCCGCCGCTGCCCCGGGGCCGAGCAGTGCCGCCTCCGCCGCTCTCCCCGTT
CTCGGTGCCTCAGTTGTTTCCTTTGTTGCTGCTTACTTCTTGAACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGNSRGSFPPTTFFYSSGSNPSINQSINQSKASSVRSLSSPPEVSFLPKKANSLNPIPSSSMEMKKIACAALFAAAAISAAVAADESLSPGASPAAAPGPSSAASAALPV
LGASVVSFVAAYFLN