; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC01G002110 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC01G002110
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionAa_trans domain-containing protein
Genome locationCiama_Chr01:2065346..2065930
RNA-Seq ExpressionCaUC01G002110
SyntenyCaUC01G002110
Gene Ontology termsGO:0006865 - amino acid transport (biological process)
GO:0009734 - auxin-activated signaling pathway (biological process)
GO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0015293 - symporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR013057 - Amino acid transporter, transmembrane domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042692.1 putative GABA transporter 2 [Cucumis melo var. makuwa]6.2e-4990Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        M +LSPP SFSKLS+DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGF+CLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRFFLF
        DVLG+ + L+
Subjt:  DVLGNRFFLF

TYK06096.1 putative GABA transporter 2 [Cucumis melo var. makuwa]4.3e-5094.39Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        M +LSPP SFSKLS+DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGF+CLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRF
        DVLGNRF
Subjt:  DVLGNRF

XP_004143875.1 probable GABA transporter 2 [Cucumis sativus]1.1e-5092.73Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        MA+LSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGF+CLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRFFLF
        DVLG+ + L+
Subjt:  DVLGNRFFLF

XP_008437380.1 PREDICTED: probable GABA transporter 2 [Cucumis melo]6.2e-4990Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        M +LSPP SFSKLS+DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGF+CLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRFFLF
        DVLG+ + L+
Subjt:  DVLGNRFFLF

XP_038906705.1 probable GABA transporter 2 [Benincasa hispida]5.1e-5193.64Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        MA+LSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRFFLF
        DVLG+ + L+
Subjt:  DVLGNRFFLF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KK40 Aa_trans domain-containing protein5.5e-5192.73Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        MA+LSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGF+CLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRFFLF
        DVLG+ + L+
Subjt:  DVLGNRFFLF

A0A1S3ATJ4 probable GABA transporter 23.0e-4990Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        M +LSPP SFSKLS+DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGF+CLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRFFLF
        DVLG+ + L+
Subjt:  DVLGNRFFLF

A0A5A7TH10 Putative GABA transporter 23.0e-4990Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        M +LSPP SFSKLS+DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGF+CLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRFFLF
        DVLG+ + L+
Subjt:  DVLGNRFFLF

A0A5D3C6Y1 Putative GABA transporter 22.1e-5094.39Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        M +LSPP SFSKLS+DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGF+CLTVMAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRF
        DVLGNRF
Subjt:  DVLGNRF

A0A6J1ESG7 probable GABA transporter 27.5e-4888.18Show/hide
Query:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA
        MAEL P +S S+LS DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLT+MAAVTFYSYYLLSKVLEL EKQGRRHIRFRELAA
Subjt:  MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAA

Query:  DVLGNRFFLF
        DVLG+ + L+
Subjt:  DVLGNRFFLF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HW02 GABA transporter 13.2e-2456.52Show/hide
Query:  DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRF
        DAG+ FVL+SKG WWH GFHLTT+IV P +L+LP+AF+ LGW  G  CL   AAVTFYSY LLS  LE     G R++RFR++A  +L  ++
Subjt:  DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRF

O22719 Lysine histidine transporter-like 31.5e-0836.59Show/hide
Query:  WWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRFFLF
        W+++ FH  TAIVG  +L LP+A   LGWG G V L +   +T Y+++ + ++ E+ E  G+R  R+ EL     G +  L+
Subjt:  WWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRFFLF

Q8L4X4 Probable GABA transporter 21.6e-3970.54Show/hide
Query:  MAELSPPDSF--SKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFREL
        M +   PD F  ++L SDAGA FVL+SKG+WWHAGFHLTTAIVGP ILTLP+AFRGLGW +GFVCLT M  VTFY+YYL+SKVL+  EK GRRHIRFREL
Subjt:  MAELSPPDSF--SKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFREL

Query:  AADVLGNRFFLF
        AADVLG+    +
Subjt:  AADVLGNRFFLF

Q9C9J0 Lysine histidine transporter-like 58.6e-0940Show/hide
Query:  KGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREK-QGRRHIRFRELAADVLG
        + +W+++ FH  TA+VG  +L LPFA   LGWG G V + +  A+TFYS   L ++++L E   G+R  R+ EL  +  G
Subjt:  KGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREK-QGRRHIRFRELAADVLG

Q9SR44 Lysine histidine transporter-like 21.1e-0833.73Show/hide
Query:  QWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRFFLF
        +WW++ FH  TA+VG  +L+LP+A   LGWG G   + +   +TFY+ + + ++ E+    G+R  R+ EL     G +  L+
Subjt:  QWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRFFLF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08230.2 Transmembrane amino acid transporter family protein2.3e-2556.52Show/hide
Query:  DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRF
        DAG+ FVL+SKG WWH GFHLTT+IV P +L+LP+AF+ LGW  G  CL   AAVTFYSY LLS  LE     G R++RFR++A  +L  ++
Subjt:  DAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRF

AT1G61270.1 Transmembrane amino acid transporter family protein1.0e-0936.59Show/hide
Query:  WWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRFFLF
        W+++ FH  TAIVG  +L LP+A   LGWG G V L +   +T Y+++ + ++ E+ E  G+R  R+ EL     G +  L+
Subjt:  WWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRFFLF

AT1G67640.1 Transmembrane amino acid transporter family protein8.0e-1033.73Show/hide
Query:  QWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRFFLF
        +WW++ FH  TA+VG  +L+LP+A   LGWG G   + +   +TFY+ + + ++ E+    G+R  R+ EL     G +  L+
Subjt:  QWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGNRFFLF

AT1G71680.1 Transmembrane amino acid transporter family protein6.1e-1040Show/hide
Query:  KGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREK-QGRRHIRFRELAADVLG
        + +W+++ FH  TA+VG  +L LPFA   LGWG G V + +  A+TFYS   L ++++L E   G+R  R+ EL  +  G
Subjt:  KGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREK-QGRRHIRFRELAADVLG

AT5G41800.1 Transmembrane amino acid transporter family protein1.1e-4070.54Show/hide
Query:  MAELSPPDSF--SKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFREL
        M +   PD F  ++L SDAGA FVL+SKG+WWHAGFHLTTAIVGP ILTLP+AFRGLGW +GFVCLT M  VTFY+YYL+SKVL+  EK GRRHIRFREL
Subjt:  MAELSPPDSF--SKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFREL

Query:  AADVLGNRFFLF
        AADVLG+    +
Subjt:  AADVLGNRFFLF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGAGCTTTCTCCGCCGGACTCCTTTTCAAAGCTTTCTTCCGACGCCGGAGCGGCCTTCGTCCTCGAATCCAAAGGGCAGTGGTGGCATGCCGGATTCCAC
TTGACGACGGCCATCGTGGGGCCGCCGATTTTAACTCTGCCGTTTGCGTTTCGAGGATTGGGTTGGGGAGTGGGATTTGTGTGCTTGACGGTCATGGCGGCGGTG
ACTTTCTATTCTTACTACCTCTTGTCTAAGGTGCTGGAGCTCCGTGAGAAACAGGGTCGCCGCCACATCCGCTTCCGGGAACTCGCCGCCGACGTCTTGGGTAAC
CGTTTTTTCCTTTTCAACATGCCGCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCTTAAAATCCCATCAATGTCTCCTCCATTTCCAATACCATTCATTTACTGCATAAACTCCATTTGCTCAAATCCCACTGATTTCCGGCACCACTCTTCAAAAC
CCAAAAGCCCATCATCATCTCTTTCTCAATTCTGTTTCTTTGTTTCCTTAATCCATGGCAGAGCTTTCTCCGCCGGACTCCTTTTCAAAGCTTTCTTCCGACGCC
GGAGCGGCCTTCGTCCTCGAATCCAAAGGGCAGTGGTGGCATGCCGGATTCCACTTGACGACGGCCATCGTGGGGCCGCCGATTTTAACTCTGCCGTTTGCGTTT
CGAGGATTGGGTTGGGGAGTGGGATTTGTGTGCTTGACGGTCATGGCGGCGGTGACTTTCTATTCTTACTACCTCTTGTCTAAGGTGCTGGAGCTCCGTGAGAAA
CAGGGTCGCCGCCACATCCGCTTCCGGGAACTCGCCGCCGACGTCTTGGGTAACCGTTTTTTCCTTTTCAACATGCCGCATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAELSPPDSFSKLSSDAGAAFVLESKGQWWHAGFHLTTAIVGPPILTLPFAFRGLGWGVGFVCLTVMAAVTFYSYYLLSKVLELREKQGRRHIRFRELAADVLGN
RFFLFNMPH