; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC01G013580 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC01G013580
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionSerine/threonine-protein kinase fray2
Genome locationCiama_Chr01:26550246..26560890
RNA-Seq ExpressionCaUC01G013580
SyntenyCaUC01G013580
Gene Ontology termsGO:0000380 - alternative mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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InterPro domainsIPR010530 - NADH-ubiquinone reductase complex 1 MLRQ subunit
IPR034604 - Serine/Arginine-related protein 53


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055199.1 serine/threonine-protein kinase fray2 [Cucumis melo var. makuwa]2.5e-15593.16Show/hide
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XP_038895539.1 serine/threonine-protein kinase fray2 isoform X1 [Benincasa hispida]1.5e-15588.06Show/hide
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XP_038895540.1 serine/threonine-protein kinase fray2 isoform X2 [Benincasa hispida]3.7e-15493.97Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LTD9 Uncharacterized protein4.7e-15593.45Show/hide
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A0A1S3AV81 serine/threonine-protein kinase fray24.2e-15693.45Show/hide
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A0A5A7UP09 Serine/threonine-protein kinase fray21.2e-15593.16Show/hide
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A0A5D3BJE5 Serine/threonine-protein kinase fray24.2e-15693.45Show/hide
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A0A6J1E8B9 serine/threonine-protein kinase fray28.5e-14989.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G29970.1 B12D protein1.3e-2150.6Show/hide
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AT3G48120.1 unknown protein1.0e-6152.12Show/hide
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        EQ+KAAHDEAMFG P GQ    +T DD  E+ N K  E   +  A +LLSEK+
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AT3G48140.1 B12D protein1.3e-3581.18Show/hide
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        SRWLRPEVYPLFAA GVAVGIC F L+RNI  NPEVR TKENRAAG+LDN AEGEKY E+FLRKFVRNK PEIMP +N FFTDP+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGAATCGAAAGCAGCGGCGTACTACGATGAGCTCACTCGTAAAGGAGAAGGGGCAGCAAGGTTCAAGCGAGGTCTCGGTTTTTCCGCCTCCGACTCCAAC
AGTGACGTGGTCTCCGCGTCCAAGGGCTCCGCTCTGCCTTCGTCGTCTTCCTTCCTCAGTTCTTTTGTTAAAGCCTCAAGCCCTTCCAAGGCCTCCGAGTTCGAA
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