; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC02G028330 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC02G028330
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Descriptionglycine-rich protein-like
Genome locationCiama_Chr02:2659640..2660212
RNA-Seq ExpressionCaUC02G028330
SyntenyCaUC02G028330
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572253.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-4384.8Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYG R  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYGG     
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----

Query:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
         GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

KAG7011884.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.0e-4384.68Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYG R  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYGG     
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----

Query:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
         GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK

XP_022952570.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X1 [Cucurbita moschata]6.3e-4487.39Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYG R  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG  GGYG GCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_022969295.1 glycine-rich protein-like [Cucurbita maxima]4.1e-4386.67Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY
        MSSKAF+FLGLL AF+LL+SSEVAARDLAETS+ K+ EATVETNGVEDAKYGGYD GYG R  Y G GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYG GCRY
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY

Query:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_023554637.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.5e-4285Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY
        MSSKAF+FLG L A +L++SSEVAARDLAETS+KK+NEATVETNGVEDAKYGGYD GYG R  Y G GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG  GGYG GCRY
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY

Query:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C180 cold and drought-regulated protein CORA-like3.9e-3989.26Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAET SK DNEATVETNGVEDAKY GGYDRGYG    YG GGY GRGGY GRGGYGGRGGY G RGGYG GCR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR

Query:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like7.8e-4090.08Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK DNEATVETNGVEDAKY GGYDRGYG    YG GGY GRGGY GRGGYGGRGGY G RGGYG GCR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR

Query:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1GKL6 glycine-rich protein-like isoform X23.9e-3982.35Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD           GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG  GGYG GCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1GM55 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X13.1e-4487.39Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYG R  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG  GGYG GCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1HZJ5 glycine-rich protein-like2.0e-4386.67Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY
        MSSKAF+FLGLL AF+LL+SSEVAARDLAETS+ K+ EATVETNGVEDAKYGGYD GYG R  Y G GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYG GCRY
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRY

Query:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22612 Dormancy-associated protein 21.7e-0451.4Show/hide
Query:  SSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGY-GGRGGYGDRGGY---GGGC
        S KA + LG LLA VLL+SSEV+AR+L E   +K +E       V DAKYGGY RG G  +  G G + G GGY G GGY  G GGY   GGY   GGG 
Subjt:  SSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGY-GGRGGYGDRGGY---GGGC

Query:  RYGRCGY
          G  GY
Subjt:  RYGRCGY

P11898 Glycine-rich protein HC11.3e-0444.53Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++K +   N       G      GGY  G G  +       G GGY   GGY  G GGY        G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR

Query:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA
        GGY + GGY  GGG  Y  C  RCCS A
Subjt:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA

P23137 Glycine-rich protein2.9e-0747.97Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCR
        M SKAF+FLGL LAF  L+SSEV A +LAETS+  K D E  V+ +G                 R G+   GG G YGG  G GG GGY  R     GCR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCR

Query:  YGRC--GY----RCCSYAGEVVE
        YG C  GY    RCCSYAGE ++
Subjt:  YGRC--GY----RCCSYAGEVVE

P37703 Glycine-rich protein DC9.15.1e-0443.75Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++K +   N       G      GGY  G G  +       G GGY   GGY  G GGY        G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR

Query:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA
        GGY + GG+  GGG  Y  C  RCCS A
Subjt:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05530.1 Glycine-rich protein family2.8e-0543.41Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGG----
        M+SKA V  GL    VLL+ +EVAA              TV++   E  +   Y+ G+G     G+GGY G GGY G GG+ G GGY   GGY GG    
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGG----

Query:  ----CRYGRC--GY----RCCSYAGEVVE
            CRYG C  GY    RCCSYAGE V+
Subjt:  ----CRYGRC--GY----RCCSYAGEVVE

AT2G05540.1 Glycine-rich protein family1.4e-0948.51Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGY-DRGYGDRDRYGHGGYGGR--GGYGGR--------GGYGGR-GGYG
        M+SKA +FL L++  VLL++SEV ARDLAE S+++ N    E    E  ++GG+   GYG    +  GGYGG   GGYG R        GGYG R GGYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGY-DRGYGDRDRYGHGGYGGR--GGYGGR--------GGYGGR-GGYG

Query:  DRGGYGGGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE
        +RG  GG CRYG C  GY     RCC+YAG+ V+
Subjt:  DRGGYGGGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTCCAAAGCTTTTGTTTTCCTCGGTCTTCTTCTCGCCTTTGTTCTCCTCCTCTCTTCGGAGGTGGCCGCGAGAGACCTCGCAGAGACTTCCTCCAAGAAGGATAA
CGAGGCTACTGTGGAGACCAATGGTGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGGTACGATAGAGGCTATGGTGATCGTGATCGTTACGGCCATGGTGGCTATGGCGGTCGTGGTG
GCTACGGAGGCCGTGGTGGCTACGGAGGCCGTGGTGGTTACGGTGACCGTGGTGGCTACGGAGGAGGTTGCCGGTATGGTCGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGCT
GGTGAAGTGGTAGAGGGCGCAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCATCCCATCTCCAAAAATCAATCTCTTACTTAAACAAAAAAAAAAATGAGTTCCAAAGCTTTTGTTTTCCTCGGTCTTCTTCTCGCCTTTGTTCTCCTCCTCTCTTCG
GAGGTGGCCGCGAGAGACCTCGCAGAGACTTCCTCCAAGAAGGATAACGAGGCTACTGTGGAGACCAATGGTGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGGTACGATAGAGGCTA
TGGTGATCGTGATCGTTACGGCCATGGTGGCTATGGCGGTCGTGGTGGCTACGGAGGCCGTGGTGGCTACGGAGGCCGTGGTGGTTACGGTGACCGTGGTGGCTACGGAG
GAGGTTGCCGGTATGGTCGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGCGCAAAACCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGDRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYA
GEVVEGAKP