; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC02G033470 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC02G033470
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionProtein Ycf2
Genome locationCiama_Chr02:9653656..9654094
RNA-Seq ExpressionCaUC02G033470
SyntenyCaUC02G033470
Gene Ontology termsGO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008543 - Uncharacterised protein family Ycf2
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QIT04093.1 Ycf2 protein [Luffa aegyptiaca]1.4e-4495.83Show/hide
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QZL38725.1 Ycf2 protein [Citrullus ecirrhosus]9.9e-4697.92Show/hide
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YP_009326033.1 Ycf2 [Citrullus lanatus]9.9e-4697.92Show/hide
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YP_009420838.1 Ycf2 [Citrullus colocynthis]9.9e-4697.92Show/hide
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YP_009468904.1 hypothetical chloroplast RF2 [Gynostemma compressum]1.4e-4495.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1P8LF93 Protein Ycf24.8e-4697.92Show/hide
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A0A249RXF2 Protein Ycf24.8e-4697.92Show/hide
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A0A343A8H4 Protein Ycf24.8e-4697.92Show/hide
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A0A343F2F1 Protein Ycf24.8e-4697.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4GYV4 Protein Ycf27.9e-4692.71Show/hide
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B1NWJ3 Protein Ycf22.5e-4489.58Show/hide
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P08973 Protein Ycf24.3e-4480.91Show/hide
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Q09WV7 Protein Ycf23.0e-4592.71Show/hide
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Q14F97 Protein Ycf27.9e-4692.71Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00860.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core7.6e-4487Show/hide
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ATCG01280.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core7.6e-4487Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATCTTCCTTTCATTACAGTATTTCTGAACACGTTCCTGGATAACAAGCCTGAGGGTTTT
CTTATTGATGATAGTGACGATATTGATGATATGACGATATCGACCGTGACCTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTCGATACCGAAGGCATCCTTGGGGTGATCTCGTACTTCCTACGGGGTGGAGACGATGGGGTCGGTCCAGAAACACGGACATTCCTTGCTCATTATCAGATAATCAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVDTEGILGVISYFLRGGDDGVGPETRTFLAHYQIITYSQTSCGANSFHFPSHGKPFSLRLALSPSRGILVIGSIGTGRSYLVKYLATNSYLPFITVFLNTFLDNKPEGF
LIDDSDDIDDMTISTVTLIRSWSF