; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC02G034850 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC02G034850
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationCiama_Chr02:13015656..13016537
RNA-Seq ExpressionCaUC02G034850
SyntenyCaUC02G034850
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR000782 - FAS1 domain
IPR036378 - FAS1 domain superfamily
IPR045003 - Fasciclin-like arabinogalactan protein, group A


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0053284.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-11991.57Show/hide
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TYK11877.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-11890.76Show/hide
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XP_004138608.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis sativus]3.6e-12591.6Show/hide
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XP_038900968.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Benincasa hispida]1.0e-12793.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQV6 FAS1 domain-containing protein1.8e-12591.6Show/hide
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A0A1S3C2T8 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.5e-12490.46Show/hide
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A0A5A7UDG5 Fasciclin-like arabinogalactan protein 71.1e-11991.57Show/hide
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A0A5D3CIW8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 79.3e-11990.76Show/hide
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A0A6J1CEN1 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.7e-11284.79Show/hide
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        TD PP PAPVPSP++APAAD+PSAETEG   PSS  SPSSSFRI+ G L SQLVLA+S G+LL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 125.2e-2637.25Show/hide
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          P  PAP P+P +     + S + +     SS +SP+ +    R V
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 111.0e-2135.92Show/hide
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        APAP P+    N+  +L  AG F  F+  L+ST+  +    Q N  S  G+T+F P D AF+SLK  +L++L+  Q   L+ FH LP   T+  F ++S 
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Query:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPTPAPVPSPDIAPAADTPSAETEGSVSPSSTE
         +P+ T AG+    ++ LN T +   V+I++G  +  V++SV S   +AVYQVD VLLP A+FG+   P PAP     ++    + S   +G  S  S++
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Query:  SPSSSF
        +  + F
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 69.2e-2336.97Show/hide
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        I +   APAP      +NL  +L     F   +  L +T+V      Q N S++G+TIF P D AF+ LK  +L++LT  Q   L+L+H +P YY+L+D 
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Query:  NSLSEKSPITTFA----GEQYTLNFTD--ASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPTPAPVPSPDIAPA-ADTPSAETEG
          L   +P+ T A    G  + LNFT    S  V++S+G   T++++++    P+AVY VD VLLPE +FGT   PT AP P    + + AD+P+A+ E 
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Query:  SVSPSSTESPS
          + SS +  S
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 72.9e-6956.98Show/hide
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        K+ + +   +  +++CS+ A+    A PPA    P   P PAPAPA ++VNL +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QAN++EEGITIFVPKD AF 
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Query:  SLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNSLSEKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQ+K L+LFH LPHYY+L++F +LS+  P++TFAG QY+L FTD SGTV I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
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         PP PAP P+P ++  +D+PS A++EG+ SP S+   S      + +L + + + ISG
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 91.3e-2135.71Show/hide
Query:  APKPAPAPAPAAKHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNS
        A   APAP PA   +NL  +L   G F  F+  L  T+V      Q N S EG+T+F P D AF +LK  +L+ L+ D    L+L+H  P YY++ D   
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Query:  LSEKSPITTFAGEQ----YTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPTPAPVPSPDIAPAADTPSAETEGSVSPS
        LS  +P+ T A  +    Y LNFT  +  +++S+G+  T++S+S+    P+AVY VD VLLP  +FG       AP P        D  S  T+ + SPS
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Query:  STESPSSSFRIARGVLWSQLVLAI
          +S S   ++  G     +VL +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 72.1e-7056.98Show/hide
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        K+ + +   +  +++CS+ A+    A PPA    P   P PAPAPA ++VNL +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QAN++EEGITIFVPKD AF 
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         PP PAP P+P ++  +D+PS A++EG+ SP S+   S      + +L + + + ISG
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AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 72.1e-7056.98Show/hide
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        K+ + +   +  +++CS+ A+    A PPA    P   P PAPAPA ++VNL +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QAN++EEGITIFVPKD AF 
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Query:  SLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNSLSEKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQ+K L+LFH LPHYY+L++F +LS+  P++TFAG QY+L FTD SGTV I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
Subjt:  SLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNSLSEKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD

Query:  FPPTPAPVPSPDIAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRIARGVLWSQLVLAISG
         PP PAP P+P ++  +D+PS A++EG+ SP S+   S      + +L + + + ISG
Subjt:  FPPTPAPVPSPDIAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRIARGVLWSQLVLAISG

AT2G20520.1 FASCICLIN-like arabinogalactan 66.6e-2436.97Show/hide
Query:  IPAPKPAPAPAPAAKHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADF
        I +   APAP      +NL  +L     F   +  L +T+V      Q N S++G+TIF P D AF+ LK  +L++LT  Q   L+L+H +P YY+L+D 
Subjt:  IPAPKPAPAPAPAAKHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADF

Query:  NSLSEKSPITTFA----GEQYTLNFTD--ASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPTPAPVPSPDIAPA-ADTPSAETEG
          L   +P+ T A    G  + LNFT    S  V++S+G   T++++++    P+AVY VD VLLPE +FGT   PT AP P    + + AD+P+A+ E 
Subjt:  NSLSEKSPITTFA----GEQYTLNFTD--ASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPTPAPVPSPDIAPA-ADTPSAETEG

Query:  SVSPSSTESPS
          + SS +  S
Subjt:  SVSPSSTESPS

AT5G03170.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 117.2e-2335.92Show/hide
Query:  APAPAPAAKHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQAN-DSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNSLSE
        APAP P+    N+  +L  AG F  F+  L+ST+  +    Q N  S  G+T+F P D AF+SLK  +L++L+  Q   L+ FH LP   T+  F ++S 
Subjt:  APAPAPAAKHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQAN-DSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNSLSE

Query:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPTPAPVPSPDIAPAADTPSAETEGSVSPSSTE
         +P+ T AG+    ++ LN T +   V+I++G  +  V++SV S   +AVYQVD VLLP A+FG+   P PAP     ++    + S   +G  S  S++
Subjt:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPTPAPVPSPDIAPAADTPSAETEGSVSPSSTE

Query:  SPSSSF
        +  + F
Subjt:  SPSSSF

AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 123.7e-2737.25Show/hide
Query:  MILLFGIWLMLLCSSPARARTAAKPPALSPIPAPKPAPAPAPAAKHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFSSLK
        +ILLF + L+LL ++P              +  P PA APAP     N+  +L  AG F  F+  L+ST V      Q N+S+ GITIF P D++F+ LK
Subjt:  MILLFGIWLMLLCSSPARARTAAKPPALSPIPAPKPAPAPAPAAKHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFSSLK

Query:  KPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNSLSEKSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGT
          +L++LT +Q   L+ FH +P Y + ++F ++S  +P+ T AG+     + LN T +  TV+I+SG TNT VS +V S   +AVYQVD VLLP+ +F  
Subjt:  KPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNSLSEKSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGT

Query:  DFPPTPAPVPSPDIAPAADTPSAETEGSVSPSSTESPSSSFRIARGV
          P  PAP P+P +     + S + +     SS +SP+ +    R V
Subjt:  DFPPTPAPVPSPDIAPAADTPSAETEGSVSPSSTESPSSSFRIARGV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTATTTCTTCTTTCTTTCTGCTTGAATTGGTTTATTCCTCTGAAGTAACTAATTTGATGGCATTTGTGAATTTCAGGGACAAAAACATGAAACTTTACATG
ATTCTCTTGTTTGGTATTTGGCTGATGCTCCTGTGCTCTTCACCGGCACGTGCTCGAACTGCTGCTAAGCCTCCTGCACTTAGCCCGATTCCTGCACCGAAACCA
GCCCCAGCACCGGCACCAGCTGCCAAACATGTCAACCTCGCTGATCTGCTCACAGTAGCTGGTCCCTTCCACAAGTTCCTTGGCTACCTTGAATCCACCAAAGTC
ATTGAGACATTCCAAAAGCAAGCCAACGATTCTGAAGAGGGAATTACCATATTTGTACCAAAAGATACTGCATTTTCATCCCTCAAGAAGCCTTCTCTGTCAAAT
CTCACCAAGGACCAGATCAAGTCCCTGCTACTCTTTCATGGCTTACCACATTACTATACTCTAGCTGATTTCAACAGCCTTAGCGAAAAGAGTCCCATTACAACA
TTTGCAGGTGAGCAGTACACTTTGAATTTTACTGATGCATCTGGCACCGTCCACATCAGCTCAGGCTGGACCAACACAAAAGTGAGTAGTAGTGTGCTTTCAACT
GATCCCGTTGCAGTTTACCAAGTCGATCATGTACTCCTTCCGGAGGCGATCTTTGGTACTGATTTCCCTCCCACCCCAGCTCCAGTACCAAGCCCTGACATTGCT
CCGGCTGCTGATACTCCATCTGCTGAAACTGAGGGCAGCGTTTCTCCATCATCGACGGAGTCACCATCTTCTTCCTTTAGGATTGCTAGAGGGGTACTCTGGAGC
CAGTTGGTTTTAGCAATTTCAGGTGGACTGCTCCTACTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTATTTCTTCTTTCTTTCTGCTTGAATTGGTTTATTCCTCTGAAGTAACTAATTTGATGGCATTTGTGAATTTCAGGGACAAAAACATGAAACTTTACATG
ATTCTCTTGTTTGGTATTTGGCTGATGCTCCTGTGCTCTTCACCGGCACGTGCTCGAACTGCTGCTAAGCCTCCTGCACTTAGCCCGATTCCTGCACCGAAACCA
GCCCCAGCACCGGCACCAGCTGCCAAACATGTCAACCTCGCTGATCTGCTCACAGTAGCTGGTCCCTTCCACAAGTTCCTTGGCTACCTTGAATCCACCAAAGTC
ATTGAGACATTCCAAAAGCAAGCCAACGATTCTGAAGAGGGAATTACCATATTTGTACCAAAAGATACTGCATTTTCATCCCTCAAGAAGCCTTCTCTGTCAAAT
CTCACCAAGGACCAGATCAAGTCCCTGCTACTCTTTCATGGCTTACCACATTACTATACTCTAGCTGATTTCAACAGCCTTAGCGAAAAGAGTCCCATTACAACA
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CCGGCTGCTGATACTCCATCTGCTGAAACTGAGGGCAGCGTTTCTCCATCATCGACGGAGTCACCATCTTCTTCCTTTAGGATTGCTAGAGGGGTACTCTGGAGC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFISSFFLLELVYSSEVTNLMAFVNFRDKNMKLYMILLFGIWLMLLCSSPARARTAAKPPALSPIPAPKPAPAPAPAAKHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKV
IETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQIKSLLLFHGLPHYYTLADFNSLSEKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTVHISSGWTNTKVSSSVLST
DPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPTPAPVPSPDIAPAADTPSAETEGSVSPSSTESPSSSFRIARGVLWSQLVLAISGGLLLL