; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC02G036730 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC02G036730
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionBHLH domain-containing protein
Genome locationCiama_Chr02:22053572..22057127
RNA-Seq ExpressionCaUC02G036730
SyntenyCaUC02G036730
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0055072 - iron ion homeostasis (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily
IPR044579 - Transcription factor bHLH11/121


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038902535.1 transcription factor bHLH121 [Benincasa hispida]1.4e-13773.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPK4 BHLH domain-containing protein8.4e-13672.92Show/hide
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A0A1S3C6M9 transcription factor bHLH121 isoform X16.8e-13873.82Show/hide
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A0A1S3C798 transcription factor bHLH121 isoform X22.2e-10485.1Show/hide
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A0A6J1CXG2 transcription factor bHLH121-like isoform X27.4e-10063.24Show/hide
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A0A6J1CXY9 transcription factor bHLH121-like isoform X18.4e-11264.58Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10KL8 Protein IRON-RELATED TRANSCRIPTION FACTOR 33.1e-1839.39Show/hide
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        RKV K++REKL+RG LN+ F ELGN+L+ DR  N KA IL DT ++L+DL SQV  L+ E++TL  ES+ +  E+++L++E   L S+I +L  + + + 
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Q69V10 Transcription factor BHLH0622.4e-1533.96Show/hide
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        D  A +++ K++REKL+R + N+ F ELGN+L+PDR  N KA +L +T ++LKDL SQV  L+ E+++L  ESH +A E+++L ++ ++L ++I  L  +
Subjt:  DSAAARKVQKADREKLRRGRLNEQFVELGNILDPDRPKNDKATILMDTIQLLKDLTSQVNKLKTEHATLIEESHELAQEKSDLREEKALLTSDIENLNAQ

Query:  YQQKLRATYPWA-VMDHSVVMAPAPFPFPVPMQMPPGPFPLHPPLQPYTFFGNPDPRVI
         + ++     W+ V     +  P P     P+Q  P     H P+     F    P +I
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Q8W2F2 Transcription factor bHLH114.0e-2639.71Show/hide
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         PW                 VP       +  H P              I    S+F+PY    N LTEQQ+         S + +D   +Q+S+ K   
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             +     + +   ++V   LELK   SS + QD S     GK +K +  +  SSS+  S S ++ D+S
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Q9FH37 Transcription factor ILR32.5e-1236.16Show/hide
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                  + AP P  FP P  MP   F       P    GN    +I+ P      ++PP S+   Q     PP
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Q9LT23 Transcription factor bHLH1211.5e-7359.51Show/hide
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        +LR+  PW A MDH+V+MAP P FP+P+P+ MPPG  P+HP +  YT+FGN +P +I  PC T++PY+PPN++ EQQS   PQN       GNRS     
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        +  R+K S ES+ EK+ DSNEVAT LELKTPGS+SD+D+       K  K NN    + E S SS+CSSS S+ D+SSSS+  G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G19860.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.1e-7459.51Show/hide
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AT3G19860.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.1e-7459.51Show/hide
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        +  R+K S ES+ EK+ DSNEVAT LELKTPGS+SD+D+       K  K NN    + E S SS+CSSS S+ D+SSSS+  G
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AT4G36060.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.8e-2739.71Show/hide
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             +     + +   ++V   LELK   SS + QD S     GK +K +  +  SSS+  S S ++ D+S
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AT4G36060.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.8e-2739.71Show/hide
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             +     + +   ++V   LELK   SS + QD S     GK +K +  +  SSS+  S S ++ D+S
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AT5G54680.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.8e-1336.16Show/hide
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        KA REK RR RLN++F+ELG IL+P + PK DKA IL+D ++++  L  +  KLK  +++L ++  EL  EK++LR+EK  L ++ E L    +Q+L+A 
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Query:  YPWAVMDHSVVMAPAPFPFPVPMQMPPGPFPLHPPLQPYTFFGNPDPRVIANPCSTFVPYIPPNSLTEQQSPQNAPP
                  + AP P  FP P  MP   F       P    GN    +I+ P      ++PP S+   Q     PP
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCCAAGTCTGTACAAGTATCCGCCATTTCAATCTGGTTTTGTTTTCCGGTGTTGTTAATTCCTTGTTTAAGAACGATTTTGTTTCTCTGTGAAACTATGGCAATGGCTT
TTATTCCGAAAATTTGGACTTTAGAGGAAAACTTACTGGCTTCGTATGGATTATATGTTTTCCGCTGCCAAAGGTTTGATGGGGAATTCAAGGATTCTGCAGCTGCTAGA
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CATTTTAATGGATACAATTCAATTGCTGAAGGATCTGACATCTCAAGTGAACAAATTGAAAACTGAACATGCCACTTTGATAGAAGAATCACACGAGCTAGCCCAGGAAA
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TCGGTTGTCATGGCCCCTGCCCCCTTTCCATTTCCAGTGCCAATGCAAATGCCTCCAGGGCCATTTCCCTTGCATCCACCCTTGCAACCTTATACATTCTTTGGAAATCC
GGATCCCAGGGTAATTGCAAACCCTTGTTCCACCTTCGTCCCATACATACCTCCAAATTCCTTGACCGAGCAACAGTCCCCCCAAAATGCACCACCTTTCATTCAGTCAG
GCAATCGGTCTGATAACTTCAGTGAGCAAAATTCCAGGAGCAAGTTCTCAGTTGAAAGCAAGATTGAGAAAAGTGTAGATTCCAATGAAGTTGCAACTTACCTGGAGTTG
AAAACTCCTGGATCTTCCTCAGATCAGGATTCATCGTTTGAATGTTCAAACGGTAAGAACAGAAAGGAAAATAATCTATCAGAAGAGAGTTCTTCAAGTAGATGTTCTTC
ATCTTGTAGTTTAGGGGATAATTCGTCTAGTAGCACGCCAAATGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATCAACTAATTCAACGCGACGATCTTGTTCAGAATCCGGCCACACCCTCCACCTCCATTGTACCATGCATTGAACTTCCAGGCCACCCAATTCGTTCTCAATCCAA
CTCCAAGTCTGTACAAGTATCCGCCATTTCAATCTGGTTTTGTTTTCCGGTGTTGTTAATTCCTTGTTTAAGAACGATTTTGTTTCTCTGTGAAACTATGGCAATGGCTT
TTATTCCGAAAATTTGGACTTTAGAGGAAAACTTACTGGCTTCGTATGGATTATATGTTTTCCGCTGCCAAAGGTTTGATGGGGAATTCAAGGATTCTGCAGCTGCTAGA
AAAGTTCAGAAGGCTGACAGAGAGAAATTAAGAAGGGGTCGTTTGAATGAACAATTTGTCGAGCTGGGAAATATTTTAGATCCCGATAGGCCCAAAAATGACAAAGCAAC
CATTTTAATGGATACAATTCAATTGCTGAAGGATCTGACATCTCAAGTGAACAAATTGAAAACTGAACATGCCACTTTGATAGAAGAATCACACGAGCTAGCCCAGGAAA
AGAGTGATCTGAGAGAAGAGAAGGCGTTGCTTACATCTGATATTGAGAATCTTAATGCTCAGTATCAGCAGAAACTCAGGGCTACATACCCTTGGGCTGTCATGGATCAC
TCGGTTGTCATGGCCCCTGCCCCCTTTCCATTTCCAGTGCCAATGCAAATGCCTCCAGGGCCATTTCCCTTGCATCCACCCTTGCAACCTTATACATTCTTTGGAAATCC
GGATCCCAGGGTAATTGCAAACCCTTGTTCCACCTTCGTCCCATACATACCTCCAAATTCCTTGACCGAGCAACAGTCCCCCCAAAATGCACCACCTTTCATTCAGTCAG
GCAATCGGTCTGATAACTTCAGTGAGCAAAATTCCAGGAGCAAGTTCTCAGTTGAAAGCAAGATTGAGAAAAGTGTAGATTCCAATGAAGTTGCAACTTACCTGGAGTTG
AAAACTCCTGGATCTTCCTCAGATCAGGATTCATCGTTTGAATGTTCAAACGGTAAGAACAGAAAGGAAAATAATCTATCAGAAGAGAGTTCTTCAAGTAGATGTTCTTC
ATCTTGTAGTTTAGGGGATAATTCGTCTAGTAGCACGCCAAATGGATGAAAATCTACTGATATATGTGCAAACCCATAAAAGTTGCAGATTCACCTAAATTGGTCCCTGA
ATTTTATTTTTGATGGTCTATAACTTTCTCAAAAACTTCTTAGTGCTTATCTAGTTGTCTGCAACTGAGGTGGATCATCTTCAATGCAACGTAAAGGGCCGTCACAAAAT
TAATGGTATTTTGAGATTGTGAACTAGTATTTTTACCTTACCTCCTTTGTGAAGCCTTTAAAGTTGCGGCAACTATTTAATCCATCTCCATCTTATCTACCTGGACATGG
CTGTGCAAGTGCAATGCAAGCAATAAGGTTTTGGGCCTAGGGTTGTTTTGCTGCAAAAATCCCACACTGAGAAATTAGCTAAAGCATTCTACAGATGGTTGGTCCATTCC
TTTAAATACTTTTCGTTTCCTTATGCTAAATCTCCAGGTTATGTCATTGTTGATGTCTGACAGACGATGTGACAGATATTTTCGTTTAAAAAATAATGTGGAAATGACTC
TGAGAGCATGTAGATGTGAAGTATAGATACATGATATTTTGAGAAATTATGTTGAAATTTTGAATCAAGAGACGCTACTTGTCGGTCTCATGCCTGATCGAAATGGGAGC
AATCGCATCATCATTGGCAGTAAGACCAAGAAGGTGAAATGATTATGAGGAACGAACGCAAGGTCTTGAATGCTGAAAGAGATGGTGGGGGAGAGGCCATTAATGCTGAT
ATTATCCAGAAAAAGGTCTTGAATGAAAGGTGGAAAAGCATCCATATTATGAGTGCCCCAAAAACAGATTGCTTTCCCTGCTGCTTGGGAAAATCTAGATATGTTTAAAC
TTGTTCACATGACATTGGTGAAGTAGAAAAGTGCAAGAGAGTTGAGCCCTCTACTTGATGGTCTTCAAATCTTTTAACTTTTAGAGAAGGTCGTGCCAATTACGATTGAA
CCAAATTTACTTTGACTTCTTAGTCTAATGCACTTGGAGCAATCCACTTATTTATTTATTTGTTTCTTTATTTTTTGTATGAAAATTCAGACTTCTCTTACTTAATAAAG
TAATAGATGTTTTATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDQLIQRDDLVQNPATPSTSIVPCIELPGHPIRSQSNSKSVQVSAISIWFCFPVLLIPCLRTILFLCETMAMAFIPKIWTLEENLLASYGLYVFRCQRFDGEFKDSAAAR
KVQKADREKLRRGRLNEQFVELGNILDPDRPKNDKATILMDTIQLLKDLTSQVNKLKTEHATLIEESHELAQEKSDLREEKALLTSDIENLNAQYQQKLRATYPWAVMDH
SVVMAPAPFPFPVPMQMPPGPFPLHPPLQPYTFFGNPDPRVIANPCSTFVPYIPPNSLTEQQSPQNAPPFIQSGNRSDNFSEQNSRSKFSVESKIEKSVDSNEVATYLEL
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