; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC02G045250 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC02G045250
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog A2B
Genome locationCiama_Chr02:33113646..33116596
RNA-Seq ExpressionCaUC02G045250
SyntenyCaUC02G045250
Gene Ontology termsGO:0006468 - protein phosphorylation (biological process)
GO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0004672 - protein kinase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605436.1 Ras-related protein Rab11C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.3e-11796.04Show/hide
Query:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL
        LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTL+VEGKTVK+QIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL
Subjt:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL

Query:  VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS
        VYDLTKRQTF+NVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDL+HLR+VSEDDGQ MAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS
Subjt:  VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS

Query:  VTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS
        V HPGQGTTINV++TSGDSNRRGCCSS
Subjt:  VTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS

KAG7035384.1 Ras-related protein Rab11C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.3e-11796.04Show/hide
Query:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL
        LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTL+VEGKTVK+QIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL
Subjt:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL

Query:  VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS
        VYDLTKRQTF+NVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDL+HLR+VSEDDGQ MAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS
Subjt:  VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS

Query:  VTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS
        V HPGQGTTINV++TSGDSNRRGCCSS
Subjt:  VTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS

KGN47145.2 hypothetical protein Csa_020843 [Cucumis sativus]1.9e-11690.73Show/hide
Query:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQ---------------------VEGKTVKAQIWDTA
        LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TLQ                     VEGKTVKAQIWDTA
Subjt:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQ---------------------VEGKTVKAQIWDTA

Query:  GQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTI
        GQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTI
Subjt:  GQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTI

Query:  LTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS
        LTEIYHIISKKALAAQEAAAS+THPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS
Subjt:  LTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS

TYK15391.1 ras-related protein Rab2BV [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-12099.12Show/hide
Query:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL
        LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL
Subjt:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL

Query:  VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS
        VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS
Subjt:  VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS

Query:  VTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS
        +THPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS
Subjt:  VTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS

XP_004143134.1 ras-related protein Rab11C [Cucumis sativus]2.3e-11499.08Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS+THPGQGTTI
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        NVSDTSGDSNRRGCCSS
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KE61 Uncharacterized protein1.1e-11499.08Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS+THPGQGTTI
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        NVSDTSGDSNRRGCCSS
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

A0A1S3CKN1 ras-related protein Rab11C1.1e-11499.08Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS+THPGQGTTI
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        NVSDTSGDSNRRGCCSS
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

A0A5A7V7L9 Ras-related protein Rab2BV1.1e-11499.08Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS+THPGQGTTI
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        NVSDTSGDSNRRGCCSS
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

A0A5D3CU43 Ras-related protein Rab2BV1.7e-12099.12Show/hide
Query:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL
        LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL
Subjt:  LFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL

Query:  VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS
        VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS
Subjt:  VYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS

Query:  VTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS
        +THPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS
Subjt:  VTHPGQGTTINVSDTSGDSNRRGCCSS

A0A6J1G4Z7 ras-related protein Rab11C2.5e-11195.85Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        +NVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDL+HLR+VSEDDGQ MAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE+AASV HPGQGTTI
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        NV++TSGDSNRRGCCSS
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39434 Ras-related protein Rab2BV1.1e-10086.18Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MA++VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        +NVQRWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDL HLR+VSE+DGQ +AEKEGLSF+ETSAL+A NI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEA++++  PGQGTTI
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        NV+D S  + RR CCS+
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

Q40193 Ras-related protein Rab11C4.9e-10487.1Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MAH+VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        +NVQRWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDL+HLR+VSEDDG  ++EKEGLSF+ETSAL+ATNI+KAFQTILTEIYHI+SKKALAAQEA A  + PGQGTTI
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        NV+DTSG++ ++GCCS+
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

Q96283 Ras-related protein RABA2c9.6e-10085.32Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        M H+VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRT QVEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTH-PGQGTT
        +NV RWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDL+HLRSV+E+DGQ++AEKEGLSF+ETSAL+ATN++KAFQTIL EIYHIISKKALAAQEAAA+ +  PGQGTT
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTH-PGQGTT

Query:  INVSDTSGDSNRRGCCSS
        INV DTSG + +R CCSS
Subjt:  INVSDTSGDSNRRGCCSS

Q9FIF9 Ras-related protein RABA2d9.6e-10084.4Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MAH+V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTH-PGQGTT
        +NV RWLRELRDHADSNIVI+M GNK+DL+HLRSV+E+DGQT+AE EGLSF+ETSAL+ATN++KAFQT+L EIYHIISKKALAAQEAAA+ +  PGQGTT
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTH-PGQGTT

Query:  INVSDTSGDSNRRGCCSS
        INV DTSG + +RGCCS+
Subjt:  INVSDTSGDSNRRGCCSS

Q9LNW1 Ras-related protein RABA2b1.1e-10085.25Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MA+++DHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        ENV RWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDL+HLRSV+++DG+++AEKEGLSF+ETSAL+ATNI+KAFQTIL+EIYHIISKKALAAQEAA ++  PGQGT I
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        N+SD+S  +NR+GCCS+
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B8.1e-10285.25Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MA+++DHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        ENV RWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDL+HLRSV+++DG+++AEKEGLSF+ETSAL+ATNI+KAFQTIL+EIYHIISKKALAAQEAA ++  PGQGT I
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        N+SD+S  +NR+GCCS+
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C4.3e-8773.27Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MA + D EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI
        ENV RWL+ELRDHADSNIVI++IGNK+DL HLR+V+ +D Q+ AEKEGLSFIETSAL+A N++KAFQTIL+E+Y IISKK++++ +  A+  +  +G TI
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTI

Query:  NVSDTSGDSNRRGCCSS
        +V+ TS  + ++ CCSS
Subjt:  NVSDTSGDSNRRGCCSS

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C6.8e-10185.32Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        M H+VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRT QVEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTH-PGQGTT
        +NV RWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDL+HLRSV+E+DGQ++AEKEGLSF+ETSAL+ATN++KAFQTIL EIYHIISKKALAAQEAAA+ +  PGQGTT
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTH-PGQGTT

Query:  INVSDTSGDSNRRGCCSS
        INV DTSG + +R CCSS
Subjt:  INVSDTSGDSNRRGCCSS

AT4G18800.1 RAB GTPase homolog A1D6.9e-7764.19Show/hide
Query:  HKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTFEN
        ++ D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEF LESKSTIGVEF+TR+L V  K +KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+T+  TFEN
Subjt:  HKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTFEN

Query:  VQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTINV
        V+RWLRELRDH D NIV++++GNKSDL HL +V  +D ++ AE E L F+ETSAL++TN++ AF  +LT+IYH++SKKA+ A E + +V   G+   ++V
Subjt:  VQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTINV

Query:  SDTSGDSNRRGCCSS
        S       + GCCS+
Subjt:  SDTSGDSNRRGCCSS

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D6.8e-10184.4Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF
        MAH+V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKRQTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRQTF

Query:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTH-PGQGTT
        +NV RWLRELRDHADSNIVI+M GNK+DL+HLRSV+E+DGQT+AE EGLSF+ETSAL+ATN++KAFQT+L EIYHIISKKALAAQEAAA+ +  PGQGTT
Subjt:  ENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTH-PGQGTT

Query:  INVSDTSGDSNRRGCCSS
        INV DTSG + +RGCCS+
Subjt:  INVSDTSGDSNRRGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTCAAAGTTTGTTCGAGAAATCTGGGGCGGAGACTGCCATGGCTCATAAAGTGGACCACGAGTATGACTATTTGTTCAAGATTGTTCTGATTGGGGATTCTGGCGT
CGGAAAGTCCAACATTCTTTCTAGATTTACCAGAAATGAGTTCTGCTTGGAGTCCAAATCCACCATTGGTGTTGAGTTCTCGACCAGAACTCTCCAGGTAGAAGGAAAGA
CAGTCAAGGCACAGATCTGGGACACAGCAGGTCAGGAGCGATACCGTGCGATTACTAGTGCTTATTATAGAGGAGCTGTTGGTGCTCTCCTCGTCTATGATCTGACAAAA
AGACAGACTTTCGAGAACGTTCAAAGGTGGCTACGGGAGCTGAGAGATCATGCAGACTCTAACATTGTGATTGTGATGATTGGAAATAAATCTGACCTTAGTCATCTTAG
ATCTGTCTCAGAGGATGATGGGCAGACCATGGCAGAGAAGGAAGGCCTTTCATTTATCGAGACATCGGCCTTAGATGCCACTAATATCGACAAGGCATTCCAAACCATCT
TGACAGAGATCTACCATATCATCAGCAAAAAGGCATTGGCAGCCCAGGAAGCAGCTGCTAGCGTCACCCACCCTGGTCAAGGAACGACCATCAACGTCTCCGATACTTCC
GGGGACTCAAACAGAAGGGGTTGCTGTTCTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTCAAAGTTTGTTCGAGAAATCTGGGGCGGAGACTGCCATGGCTCATAAAGTGGACCACGAGTATGACTATTTGTTCAAGATTGTTCTGATTGGGGATTCTGGCGT
CGGAAAGTCCAACATTCTTTCTAGATTTACCAGAAATGAGTTCTGCTTGGAGTCCAAATCCACCATTGGTGTTGAGTTCTCGACCAGAACTCTCCAGGTAGAAGGAAAGA
CAGTCAAGGCACAGATCTGGGACACAGCAGGTCAGGAGCGATACCGTGCGATTACTAGTGCTTATTATAGAGGAGCTGTTGGTGCTCTCCTCGTCTATGATCTGACAAAA
AGACAGACTTTCGAGAACGTTCAAAGGTGGCTACGGGAGCTGAGAGATCATGCAGACTCTAACATTGTGATTGTGATGATTGGAAATAAATCTGACCTTAGTCATCTTAG
ATCTGTCTCAGAGGATGATGGGCAGACCATGGCAGAGAAGGAAGGCCTTTCATTTATCGAGACATCGGCCTTAGATGCCACTAATATCGACAAGGCATTCCAAACCATCT
TGACAGAGATCTACCATATCATCAGCAAAAAGGCATTGGCAGCCCAGGAAGCAGCTGCTAGCGTCACCCACCCTGGTCAAGGAACGACCATCAACGTCTCCGATACTTCC
GGGGACTCAAACAGAAGGGGTTGCTGTTCTTCTTGAGCAGATACAGAAAGATAGAACTGATACTTCACATCAAAGGTTTCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSQSLFEKSGAETAMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTK
RQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIVMIGNKSDLSHLRSVSEDDGQTMAEKEGLSFIETSALDATNIDKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVTHPGQGTTINVSDTS
GDSNRRGCCSS