| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0061942.1 THO complex subunit 4A-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 6.0e-87 | 52.23 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPK APETTWQHDMFAD S F Q GRASAIQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKR+GIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG T A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPRSFLGVYIVTTVKISSLWFIHECYISELTVYDFWNTLGGSMRLYVFLVKSVHYALQICIMHLYLKQNFKDLCNDYALVFKYLYYELSLALLTS
+N NGAPR G GG
Subjt: DNLNGAPRSFLGVYIVTTVKISSLWFIHECYISELTVYDFWNTLGGSMRLYVFLVKSVHYALQICIMHLYLKQNFKDLCNDYALVFKYLYYELSLALLTS
Query: ILYNQWYYLYHNDVPFHTETGSKVGVVHHHVNVVVVLEEGVGGEEVQVKKYPLKILMLTWKTFGLFYCLAFPDHICEDDIGWNKTTAANYTTNELGFPVE
P + G G G G +K L L+L + + PDHIC+ DI WNK AANYTTNEL FP+E
Subjt: ILYNQWYYLYHNDVPFHTETGSKVGVVHHHVNVVVVLEEGVGGEEVQVKKYPLKILMLTWKTFGLFYCLAFPDHICEDDIGWNKTTAANYTTNELGFPVE
Query: GTST
GTST
Subjt: GTST
|
|
| KAG7035419.1 THO complex subunit 4A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.3e-86 | 80.09 | Show/hide |
Query: FLFNYSLNMAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQA
FLF++SLNMAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSG SRGRGRGSGPGPVRR PNRAA+RTPYSAPK APETTWQHDMF D G+ FPVQA
Subjt: FLFNYSLNMAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQA
Query: GRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG
GRAS+IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRR DA AAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNI+T AVG
Subjt: GRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG
Query: LTTAANPFDNLNGAPR
A NPF+N NGAPR
Subjt: LTTAANPFDNLNGAPR
|
|
| XP_004143092.1 THO complex subunit 4A [Cucumis sativus] | 6.6e-86 | 83.17 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAA+RTPYSAPK APETTWQHDMFAD S F VQ GRASAIQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKR+GIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG T A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPR
+N NGAPR
Subjt: DNLNGAPR
|
|
| XP_008448388.1 PREDICTED: THO complex subunit 4A-like isoform X2 [Cucumis melo] | 6.6e-86 | 83.25 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPK APETTWQHDMFAD S F Q GRASAIQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKR+GIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG T A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPRS
+N NGAPRS
Subjt: DNLNGAPRS
|
|
| XP_038901991.1 THO complex subunit 4A-like [Benincasa hispida] | 2.7e-87 | 84.13 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAA+RTPYSAPK APETTWQHDMFAD GS F Q GRASAIQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG T A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPR
+NLNGAPR
Subjt: DNLNGAPR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KBU2 RRM domain-containing protein | 3.2e-86 | 83.17 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAA+RTPYSAPK APETTWQHDMFAD S F VQ GRASAIQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKR+GIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG T A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPR
+N NGAPR
Subjt: DNLNGAPR
|
|
| A0A1S3BIZ4 THO complex subunit 4A-like isoform X2 | 3.2e-86 | 83.25 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPK APETTWQHDMFAD S F Q GRASAIQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKR+GIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG T A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPRS
+N NGAPRS
Subjt: DNLNGAPRS
|
|
| A0A1S3BK70 THO complex subunit 4A-like isoform X1 | 9.3e-86 | 83.17 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPK APETTWQHDMFAD S F Q GRASAIQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKR+GIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG T A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPR
+N NGAPR
Subjt: DNLNGAPR
|
|
| A0A5A7V158 THO complex subunit 4A-like isoform X1 | 2.9e-87 | 52.23 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPK APETTWQHDMFAD S F Q GRASAIQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKR+GIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVG T A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPRSFLGVYIVTTVKISSLWFIHECYISELTVYDFWNTLGGSMRLYVFLVKSVHYALQICIMHLYLKQNFKDLCNDYALVFKYLYYELSLALLTS
+N NGAPR G GG
Subjt: DNLNGAPRSFLGVYIVTTVKISSLWFIHECYISELTVYDFWNTLGGSMRLYVFLVKSVHYALQICIMHLYLKQNFKDLCNDYALVFKYLYYELSLALLTS
Query: ILYNQWYYLYHNDVPFHTETGSKVGVVHHHVNVVVVLEEGVGGEEVQVKKYPLKILMLTWKTFGLFYCLAFPDHICEDDIGWNKTTAANYTTNELGFPVE
P + G G G G +K L L+L + + PDHIC+ DI WNK AANYTTNEL FP+E
Subjt: ILYNQWYYLYHNDVPFHTETGSKVGVVHHHVNVVVVLEEGVGGEEVQVKKYPLKILMLTWKTFGLFYCLAFPDHICEDDIGWNKTTAANYTTNELGFPVE
Query: GTST
GTST
Subjt: GTST
|
|
| A0A6J1G721 THO complex subunit 4A-like | 4.3e-83 | 80.29 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSG SRGRGRGSGPGPVRR PNRAA+RTPYSAPK APETTWQHDMF D G+ FPVQAGRAS+IQT
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRGSGPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQT
Query: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
GTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG+MKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRR DA AAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNI+T AVG A NPF
Subjt: GTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTAANPF
Query: DNLNGAPR
+N NGAPR
Subjt: DNLNGAPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q3T0I4 THO complex subunit 4 | 1.4e-30 | 41.2 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRG-------------------SGPGPVRRFPNRAASR---------TPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAP
MA +DMSLDDIIK N+ R G GRGRG G GP+R P A PYS PK + P
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRGRGRG-------------------SGPGPVRRFPNRAASR---------TPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAP
Query: ETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQL
+ WQHD+F DSG G + ++TG KL +SNLD+GVS+ DI QELF+E G +K+ +HYD+SGRS GTA+V F R+ DA+ A+K+YN V L
Subjt: ETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQL
Query: DGKPMKIEIVGTNIST
DG+PM I++V + I T
Subjt: DGKPMKIEIVGTNIST
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 3.2e-35 | 46.23 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGN---SRGRGR-----GSGPGPVRRFPNRAASR-TPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQ
M+ L+M+LD+I+K K +RSG SRGRGR G G GP RR P +R + ++ K RV S WQ +F D ++
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGN---SRGRGR-----GSGPGPVRRFPNRAASR-TPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQ
Query: AGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPA
A AS ++ GT+L+++NLD GV+NEDI+ ELFSE+GE++RY IHYDK+GR GTAEVV+ RR DA A+KKYNNV LDG+PM++EI+G N S+ A
Subjt: AGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPA
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 4.7e-50 | 56.82 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRG-----------RGRGSGPGPVRRFPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGS--
M+ LDMSLDDIIK+N+K RG G GS GP RRF NR +RT PYS P + + +A + WQ+D+FA S
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRG-----------RGRGSGPGPVRRFPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGS--
Query: -AF----PVQAGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEI
AF G S+I+TGTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG++KRYGIHYD+SGRSKGTAEVVFSRR DA+AAVK+YNNVQLDGK MKIEI
Subjt: -AF----PVQAGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEI
Query: VGTNISTPAVG-LTTAANPF
VGTN+S PA+ L TA PF
Subjt: VGTNISTPAVG-LTTAANPF
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 2.6e-53 | 59.43 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRAS
M+ LDMSLDD+I N+KSR +G +RG G GSGPGP RR PNR ++R+ PY + K APE+TW HDMF+D ++GR+S
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRAS
Query: A-IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTT
A I+TGTKLYISNLDYGV NEDIK ELF+EVGE+KRY +H+D+SGRSKGTAEVV+SRR DA+AAVKKYN+VQLDGKPMKIEIVGTN+ T A
Subjt: A-IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTT
Query: AANPFDNLNGAP
AN N NGAP
Subjt: AANPFDNLNGAP
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 1.4e-30 | 40.57 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSR----------GRGRGS---------GPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTW--QHD
M+ L+M+LD+I+K +K RS +R GRGRG G GPVRR P +R S FS + W Q+D
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSR----------GRGRGS---------GPGPVRRFPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTW--QHD
Query: MFADSGSAFPVQAGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKI
++ ++ ++A S ++ GT +YI+NLD GV+NEDI+ EL++E+GE+KRY IHYDK+GR G+AEVV+ RR DA+ A++KYNNV LDG+PMK+
Subjt: MFADSGSAFPVQAGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKI
Query: EIVGTNISTPAV
EI+G N + V
Subjt: EIVGTNISTPAV
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.3e-51 | 56.82 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRG-----------RGRGSGPGPVRRFPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGS--
M+ LDMSLDDIIK+N+K RG G GS GP RRF NR +RT PYS P + + +A + WQ+D+FA S
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSRSGNSRG-----------RGRGSGPGPVRRFPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGS--
Query: -AF----PVQAGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEI
AF G S+I+TGTKLYISNLDYGVSNEDIK ELFSEVG++KRYGIHYD+SGRSKGTAEVVFSRR DA+AAVK+YNNVQLDGK MKIEI
Subjt: -AF----PVQAGRASAIQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEI
Query: VGTNISTPAVG-LTTAANPF
VGTN+S PA+ L TA PF
Subjt: VGTNISTPAVG-LTTAANPF
|
|
| AT5G59950.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.9e-54 | 59.43 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRAS
M+ LDMSLDD+I N+KSR +G +RG G GSGPGP RR PNR ++R+ PY + K APE+TW HDMF+D ++GR+S
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRAS
Query: A-IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTT
A I+TGTKLYISNLDYGV NEDIK ELF+EVGE+KRY +H+D+SGRSKGTAEVV+SRR DA+AAVKKYN+VQLDGKPMKIEIVGTN+ T A
Subjt: A-IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTT
Query: AANPFDNLNGAP
AN N NGAP
Subjt: AANPFDNLNGAP
|
|
| AT5G59950.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.3e-54 | 59.72 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASA
M+ LDMSLDD+I N+KSR +G +RG G GSGPGP RR PNR ++R SAP + APE+TW HDMF+D ++GR+SA
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRTPYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRASA
Query: -IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTA
I+TGTKLYISNLDYGV NEDIK ELF+EVGE+KRY +H+D+SGRSKGTAEVV+SRR DA+AAVKKYN+VQLDGKPMKIEIVGTN+ T A
Subjt: -IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTTA
Query: ANPFDNLNGAP
AN N NGAP
Subjt: ANPFDNLNGAP
|
|
| AT5G59950.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.9e-54 | 59.43 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRAS
M+ LDMSLDD+I N+KSR +G +RG G GSGPGP RR PNR ++R+ PY + K APE+TW HDMF+D ++GR+S
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRAS
Query: A-IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTT
A I+TGTKLYISNLDYGV NEDIK ELF+EVGE+KRY +H+D+SGRSKGTAEVV+SRR DA+AAVKKYN+VQLDGKPMKIEIVGTN+ T A
Subjt: A-IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTT
Query: AANPFDNLNGAP
AN N NGAP
Subjt: AANPFDNLNGAP
|
|
| AT5G59950.5 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-54 | 59.35 | Show/hide |
Query: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRAS
M+ LDMSLDD+I N+KSR +G +RG G GSGPGP RR PNR ++R+ PY + K APE+TW HDMF+D ++GR+S
Subjt: MAAPLDMSLDDIIKNNKKSR--SGNSRGRGRGSGPGPVRR-FPNRAASRT-PYSAPKVCFRVLSRFSSFEFWIEAPETTWQHDMFADSGSAFPVQAGRAS
Query: A-IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTT
A I+TGTKLYISNLDYGV NEDIK ELF+EVGE+KRY +H+D+SGRSKGTAEVV+SRR DA+AAVKKYN+VQLDGKPMKIEIVGTN+ T A
Subjt: A-IQTGTKLYISNLDYGVSNEDIKWRCLQELFSEVGEMKRYGIHYDKSGRSKGTAEVVFSRRLDAVAAVKKYNNVQLDGKPMKIEIVGTNISTPAVGLTT
Query: AANPFDNLNGAPRS
AN N NGAP S
Subjt: AANPFDNLNGAPRS
|
|
