| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0042968.1 transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-16 | 42.86 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNF--------SVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEMPVF
+Q+LP++DE L LT SIK + Q KQQ + K+ I N S ++ S D ++E ++ T R+ D DR+KFKKVEMPVF
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNF--------SVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEMPVF
Query: NGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
NGTNPD WLFRADR+FKIH +TV +I+F +AL+
Subjt: NGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| KAA0043539.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.0e-16 | 38.13 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVAN--QSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRF-----DEGEGDRNKFKKVEMPVFN
+++LP+++E + L SI + Q +KQ ++ + I+ + S + K+ + +PTT+ + +E DR+KFKKVEMPVF+
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVAN--QSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRF-----DEGEGDRNKFKKVEMPVFN
Query: GTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
GT+PDSWLFRADRYFKIH LS+ +TV +I+F AL+
Subjt: GTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| KAA0050511.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-15 | 38.62 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVANQSSVDRKIAEETSETPT-------------TLRYTRFDEGEGDRNKFKKV
+++LPV++E + L SI + Q +KQ + ++ +I G + + S +RKI E ++ T L +E DR+KFKKV
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVANQSSVDRKIAEETSETPT-------------TLRYTRFDEGEGDRNKFKKV
Query: EMPVFNGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
EMPVF+GT PDSWLFRADRYFKIH L++ +TV +I+F AL+
Subjt: EMPVFNGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| TYK11117.1 transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-16 | 42.86 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNF--------SVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEMPVF
+Q+LP++DE L LT SIK + Q KQQ + K+ I N S ++ S D ++E ++ T R+ D DR+KFKKVEMPVF
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNF--------SVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEMPVF
Query: NGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
NGTNPD WLFRADR+FKIH +TV +I+F +AL+
Subjt: NGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| XP_031745972.1 uncharacterized protein LOC116406393 [Cucumis sativus] | 4.8e-17 | 40.56 | Show/hide |
Query: KCVQKLPVMDETLISLTNSIKGL---------TIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEM
K V K+P ++E+L ++++ + +I E+ S+K+ + A G S +SS R+ ET E R T +EG +R+KFKKVEM
Subjt: KCVQKLPVMDETLISLTNSIKGL---------TIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEM
Query: PVFNGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
PVFNG +PDSWLFRADRYF+IH+LS+ + V I+F+ ALN
Subjt: PVFNGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TJJ0 Transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 | 8.7e-17 | 42.86 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNF--------SVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEMPVF
+Q+LP++DE L LT SIK + Q KQQ + K+ I N S ++ S D ++E ++ T R+ D DR+KFKKVEMPVF
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNF--------SVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEMPVF
Query: NGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
NGTNPD WLFRADR+FKIH +TV +I+F +AL+
Subjt: NGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| A0A5A7TQU2 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 4.3e-16 | 38.13 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVAN--QSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRF-----DEGEGDRNKFKKVEMPVFN
+++LP+++E + L SI + Q +KQ ++ + I+ + S + K+ + +PTT+ + +E DR+KFKKVEMPVF+
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVAN--QSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRF-----DEGEGDRNKFKKVEMPVFN
Query: GTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
GT+PDSWLFRADRYFKIH LS+ +TV +I+F AL+
Subjt: GTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| A0A5D3C5N7 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 7.4e-16 | 38.62 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVANQSSVDRKIAEETSETPT-------------TLRYTRFDEGEGDRNKFKKV
+++LPV++E + L SI + Q +KQ + ++ +I G + + S +RKI E ++ T L +E DR+KFKKV
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVANQSSVDRKIAEETSETPT-------------TLRYTRFDEGEGDRNKFKKV
Query: EMPVFNGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
EMPVF+GT PDSWLFRADRYFKIH L++ +TV +I+F AL+
Subjt: EMPVFNGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| A0A5D3CGL5 Transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 | 8.7e-17 | 42.86 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNF--------SVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEMPVF
+Q+LP++DE L LT SIK + Q KQQ + K+ I N S ++ S D ++E ++ T R+ D DR+KFKKVEMPVF
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNF--------SVANQSSVDRKIAEETSETPTTLRYTRFDEGEGDRNKFKKVEMPVF
Query: NGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
NGTNPD WLFRADR+FKIH +TV +I+F +AL+
Subjt: NGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
| A0A5D3DM31 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 7.4e-16 | 38.62 | Show/hide |
Query: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVANQSSVDRKIAEETSETPT-------------TLRYTRFDEGEGDRNKFKKV
+++LPV++E + L SI + Q +KQ + ++ +I G + + S +RKI E ++ T L +E DR+KFKKV
Subjt: VQKLPVMDETLISLTNSIKGLTIQAEKQQVSDKMRKFFASFILGNFSVANQSSVDRKIAEETSETPT-------------TLRYTRFDEGEGDRNKFKKV
Query: EMPVFNGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
EMPVF+GT PDSWLFRADRYFKIH L++ +TV +I+F AL+
Subjt: EMPVFNGTNPDSWLFRADRYFKIHRLSEDYTMTVTIINFKSTALN
|
|
