; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC04G076860 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC04G076860
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X2
Genome locationCiama_Chr04:26153553..26156315
RNA-Seq ExpressionCaUC04G076860
SyntenyCaUC04G076860
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137488.1 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X2 [Cucumis sativus]1.9e-18892.45Show/hide
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A0A0A0LQF5 RING-type domain-containing protein9.4e-18992.45Show/hide
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A0A1S3CET5 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X26.1e-18892.18Show/hide
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A0A1S3CEY2 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X33.5e-18393.04Show/hide
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A0A5D3BIX1 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X26.1e-18892.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49500 E3 ubiquitin-protein ligase MBR24.1e-2435.89Show/hide
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        GP +  S++ AA+     +R H S + +  L  + +R+   L  R +       L +D+D    R+  +S  R          +   E  M    L+  G
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          ++HD+ R++RLDVDNMSYEELL LGERIG VSTGL E+ I   +++ K       ++   S  D + C +CQE+Y   D++G L CGH +H  C+KQW
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Q5QLR5 Probable E3 ubiquitin-protein ligase ZFP12.6e-1835.58Show/hide
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Q7XTV7 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HIP11.7e-2548.28Show/hide
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        S+  GG  D+HD+ R++RLD+DNMSYEELL L ERIG+VSTGL E+E+   +++ K       ++  L  S  +  C ICQE+Y   D++G L+CGH +H
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        + C++QWL  KNTCP+
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Q9FMM4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A2.9e-2545.97Show/hide
Query:  LAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRK-CSICQEDYEPDDEMGK
        L ++M+   S+L  G    HD++R++RLDVDNMSYEELL L ERIG V TG+ E+ I   +++ K        ++  S  D + C +CQE+Y   ++MG 
Subjt:  LAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRK-CSICQEDYEPDDEMGK

Query:  LECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV
        LECGH +H QCIK+WL  KN CP+
Subjt:  LECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV

Q9ZQF9 E3 ubiquitin-protein ligase MBR12.0e-2643.75Show/hide
Query:  RSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQ
        R+  +S  R   H      +   E  M    L+  G  D+HD+ RE+RLDVDNMSYEELL LGERIG VSTGL E+ I   +++ K    +  +  L   
Subjt:  RSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQ

Query:  MDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV
        ++  C ICQE+Y   D +G L+CGH +H  CIKQW+  KN CP+
Subjt:  MDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17970.1 RING/U-box superfamily protein4.8e-6041.38Show/hide
Query:  TVGEHMKLRKPKTH-LNHLNQPISESDPNPSSIP-SIIQSTR-CKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIMTNRKKNNFSSATLRGLGC---TTAASQ
        T+GEH++LR+ +   + HL+   ++ DP  S +   I Q  R C S +SS     F    TS  NES         +K  + +++ RG+GC     AA+Q
Subjt:  TVGEHMKLRKPKTH-LNHLNQPISESDPNPSSIP-SIIQSTR-CKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIMTNRKKNNFSSATLRGLGC---TTAASQ

Query:  QVSVPAVIRTSADWEKKKTRKKKQKNSKNQTQQGIVDASHFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADA--AASVDCVVARRHASGRGKIDLEKITQRE
        +VSVP+VIR SAD + +  + KK+K  K++ ++     S+   +  I S    D  DVWC PG+GFS DA    SVD    R   S R KID++      
Subjt:  QVSVPAVIRTSADWEKKKTRKKKQKNSKNQTQQGIVDASHFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADA--AASVDCVVARRHASGRGKIDLEKITQRE

Query:  ---RSCLGRRTVNPETLL--FLDSDSDLPTARSLE--LSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIG
            S L  R +N ET      +SDS   T+   E  +  SR   H+    PD L E+ M Q+  +MG   D  D + ELRLDVD+MSYE+LLELG+RIG
Subjt:  ---RSCLGRRTVNPETLL--FLDSDSDLPTARSLE--LSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIG

Query:  HVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV
        +V+TGLKE EI  C+ K+KP V + L       +DRKCSICQ++YE +DE+G+L CGHS+H+ C+KQWL+ KN CPV
Subjt:  HVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV

AT1G45180.1 RING/U-box superfamily protein5.2e-3044.7Show/hide
Query:  HVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDY
        H+R      L ++M+   S+++G   D+HD++R++RLDVDNM+YEELL L ERIG V TGL E+ I   +++ K       ++   SQ    C +CQE+Y
Subjt:  HVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDY

Query:  EPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV
        + ++E+G+LECGH +H QCIK+WL  KN CP+
Subjt:  EPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV

AT1G73760.1 RING/U-box superfamily protein2.4e-7545.5Show/hide
Query:  PVATHTPTVGEHMKLRKPKTHLNHLNQPISESD----PNPSSIPSIIQSTRCKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIMTNRKKNNFSSATLRGLGCT
        P ++ + T+G+HM+L++P+ H N    PIS +D    P PS +         KS +SS  L              LP    T +KK N  +A+ RGLGCT
Subjt:  PVATHTPTVGEHMKLRKPKTHLNHLNQPISESD----PNPSSIPSIIQSTRCKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIMTNRKKNNFSSATLRGLGCT

Query:  TAASQQVSVPAVIRTSADWE----KKKTRKKKQKNSKNQTQQGIVDASHFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADA--AASVDCVVA---RRHASGR
        T+ASQQVSVPAVIR+SADW+    K K  KKK KN  + +  G          S  +S +C    DVWCGPG+GFS DA    S+D VV+   RR+   R
Subjt:  TAASQQVSVPAVIRTSADWE----KKKTRKKKQKNSKNQTQQGIVDASHFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADA--AASVDCVVA---RRHASGR

Query:  GKIDLEKITQRER-------SCLGRRTVNPETLLFLDSDSDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMS
         KID +K             S L RR++N E+  + DSDS   T+R+ +    RY+RH+R P PDGLAE+MM Q+  +MGG     DQFR++RL+VDNM+
Subjt:  GKIDLEKITQRER-------SCLGRRTVNPETLLFLDSDSDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMS

Query:  YEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV
        YE+LLELGERIGHV+TGL E +I  C+RK+KP    + TT      DRKC ICQ++YE  DE+G+L CGH +HI C+ QWL  KN+CPV
Subjt:  YEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV

AT2G15530.4 RING/U-box superfamily protein8.2e-2843.45Show/hide
Query:  RSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQ
        R+  +S  R   H      +   E  M    L+  G  D+HD+ RE+RLDVDNMSYEELL LGERIG VSTGL E+ I   +++ K    +  +  L   
Subjt:  RSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQ

Query:  MDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPVY
        ++  C ICQE+Y   D +G L+CGH +H  CIKQW+  KN CP++
Subjt:  MDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPVY

AT4G31450.1 RING/U-box superfamily protein2.0e-2947.62Show/hide
Query:  EIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIR----KMKPLVVNELT-THLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEM
        ++++ ++ LL+GG    HDQ R++RLD+DNMSYEELL L ERIG VST L E+ I  C++    +MKPL    +T +   ++ D KCSICQE+Y   DE+
Subjt:  EIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIR----KMKPLVVNELT-THLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEM

Query:  GKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV
        G+L C H+YH++C+++WL  K+ CP+
Subjt:  GKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTGTTGCTACACACACTCCCACTGTTGGTGAACACATGAAATTGAGAAAACCCAAAACCCATTTGAACCATTTGAACCAACCCATTTCAGAATCAGATCCAAACCC
ATCATCAATCCCTTCTATAATTCAATCCACTCGCTGCAAATCCACCATTTCTTCTCTTCTGCTCTCTACTTTTTCCAATAATACAACTAGTGGTGGAAATGAATCTTTAC
CCTCTTCCATTATGACCAACAGGAAGAAGAATAACTTCTCTTCTGCAACTCTCAGAGGACTCGGTTGTACCACCGCCGCTTCTCAGCAGGTATCTGTCCCGGCTGTAATC
CGAACTTCAGCGGATTGGGAAAAGAAGAAGACCAGGAAAAAAAAACAGAAGAACTCCAAGAACCAAACCCAACAAGGAATTGTTGATGCCTCTCATTTTCACCCTAATTC
GAATATCAACTCTGCTAGCTGTTTAGACGCTCAAGATGTTTGGTGTGGCCCTGGGATTGGATTCTCTGCTGATGCGGCTGCTTCTGTGGATTGTGTTGTTGCTAGAAGAC
ATGCTTCTGGAAGGGGAAAAATCGATTTGGAGAAGATTACTCAGAGGGAGCGTTCTTGTTTAGGAAGGCGAACAGTGAACCCGGAAACTCTCTTATTTTTGGATTCTGAT
TCTGATCTTCCAACTGCTCGATCATTGGAACTGTCTAGGAGTCGTTATTATCGCCATGTTCGTCATCCATCCCCTGATGGGCTTGCTGAGATTATGATGTTTCAGAGCAG
TTTGCTGATGGGTGGAAGGTTCGATCTACACGACCAATTTAGGGAATTACGACTTGACGTTGATAACATGTCGTATGAGGAGCTGCTTGAACTTGGTGAAAGGATCGGCC
ATGTCAGTACCGGGCTGAAAGAAGACGAGATAGGAGGATGTATTAGAAAAATGAAGCCCCTTGTTGTGAATGAGCTAACAACTCATTTATTATCCCAAATGGATAGGAAG
TGCAGCATCTGTCAGGAGGACTATGAACCAGATGATGAAATGGGTAAGCTGGAATGTGGGCACAGCTACCACATACAATGTATAAAACAGTGGCTTGCACACAAGAATAC
GTGCCCGGTCTATTTCATTGCCTTTTTACATGAGCAAAAGCATTCGTTCATTTGTGTGAAGCTTCCCTATCTGCTTATAATAGATATGATGGGCGCCATTTTCTTGTTCC
TCAGTTCTCTAGAGATTTCATGTTATGGTGATTTTGGATTTGACTTGATTGCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAGAGAAAAAATGAAAAAAAGTTGTTCACAGATTCCTGAGTGTGTTAGACTCTGCTCTCTTTGATGGCACATACCCACAAACTCTAACAAGAAGACAAACACAGCCCAC
CTAACAAACAGCACAGGAAAGGAGTAAAATCGCTTCGTAATCACTCCTTTTTCTTTTTTATTTTTCTTCCATTCCTCTGCATTCAAATCTGGGAAGGGAACAAAAAGATT
GATTAAACTAAAGTTTATTAAAGTTTATGCTTTTCTCTCTTTCAACTCAATTTCAGTCCCACTCCATTCCCTTTCACTTTCTGTTCTAAAAGGCTTAAATCACTTGTATC
TCTTTGTTCTTCCTTCCATTCATTTCCCTTTCTCTTTGTTTCAATCTCTACTTTCTTCCTTCTCCTCCAGTTTCATTGTTTCATTCTAATCTTTGTTTAAGAATCATGCC
TGTTGCTACACACACTCCCACTGTTGGTGAACACATGAAATTGAGAAAACCCAAAACCCATTTGAACCATTTGAACCAACCCATTTCAGAATCAGATCCAAACCCATCAT
CAATCCCTTCTATAATTCAATCCACTCGCTGCAAATCCACCATTTCTTCTCTTCTGCTCTCTACTTTTTCCAATAATACAACTAGTGGTGGAAATGAATCTTTACCCTCT
TCCATTATGACCAACAGGAAGAAGAATAACTTCTCTTCTGCAACTCTCAGAGGACTCGGTTGTACCACCGCCGCTTCTCAGCAGGTATCTGTCCCGGCTGTAATCCGAAC
TTCAGCGGATTGGGAAAAGAAGAAGACCAGGAAAAAAAAACAGAAGAACTCCAAGAACCAAACCCAACAAGGAATTGTTGATGCCTCTCATTTTCACCCTAATTCGAATA
TCAACTCTGCTAGCTGTTTAGACGCTCAAGATGTTTGGTGTGGCCCTGGGATTGGATTCTCTGCTGATGCGGCTGCTTCTGTGGATTGTGTTGTTGCTAGAAGACATGCT
TCTGGAAGGGGAAAAATCGATTTGGAGAAGATTACTCAGAGGGAGCGTTCTTGTTTAGGAAGGCGAACAGTGAACCCGGAAACTCTCTTATTTTTGGATTCTGATTCTGA
TCTTCCAACTGCTCGATCATTGGAACTGTCTAGGAGTCGTTATTATCGCCATGTTCGTCATCCATCCCCTGATGGGCTTGCTGAGATTATGATGTTTCAGAGCAGTTTGC
TGATGGGTGGAAGGTTCGATCTACACGACCAATTTAGGGAATTACGACTTGACGTTGATAACATGTCGTATGAGGAGCTGCTTGAACTTGGTGAAAGGATCGGCCATGTC
AGTACCGGGCTGAAAGAAGACGAGATAGGAGGATGTATTAGAAAAATGAAGCCCCTTGTTGTGAATGAGCTAACAACTCATTTATTATCCCAAATGGATAGGAAGTGCAG
CATCTGTCAGGAGGACTATGAACCAGATGATGAAATGGGTAAGCTGGAATGTGGGCACAGCTACCACATACAATGTATAAAACAGTGGCTTGCACACAAGAATACGTGCC
CGGTCTATTTCATTGCCTTTTTACATGAGCAAAAGCATTCGTTCATTTGTGTGAAGCTTCCCTATCTGCTTATAATAGATATGATGGGCGCCATTTTCTTGTTCCTCAGT
TCTCTAGAGATTTCATGTTATGGTGATTTTGGATTTGACTTGATTGCATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPVATHTPTVGEHMKLRKPKTHLNHLNQPISESDPNPSSIPSIIQSTRCKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIMTNRKKNNFSSATLRGLGCTTAASQQVSVPAVI
RTSADWEKKKTRKKKQKNSKNQTQQGIVDASHFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADAAASVDCVVARRHASGRGKIDLEKITQRERSCLGRRTVNPETLLFLDSD
SDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGGCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRK
CSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIQCIKQWLAHKNTCPVYFIAFLHEQKHSFICVKLPYLLIIDMMGAIFLFLSSLEISCYGDFGFDLIA