; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC04G078080 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC04G078080
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionBPL/LPL catalytic domain-containing protein
Genome locationCiama_Chr04:27478611..27482751
RNA-Seq ExpressionCaUC04G078080
SyntenyCaUC04G078080
Gene Ontology termsGO:0006464 - cellular protein modification process (biological process)
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GO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004143 - Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL), catalytic domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036090.1 lipoate-protein ligase LplJ [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-13080.34Show/hide
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XP_008443042.1 PREDICTED: lipoate-protein ligase LplJ [Cucumis melo]1.4e-13080.34Show/hide
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XP_038895232.1 lipoate-protein ligase LplJ isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-13281.36Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LSR7 BPL/LPL catalytic domain-containing protein5.6e-13079.66Show/hide
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A0A1S3B7D4 lipoate-protein ligase LplJ6.7e-13180.34Show/hide
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A0A5A7SYE8 Lipoate-protein ligase LplJ6.7e-13180.34Show/hide
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A0A6J1K8Z4 uncharacterized protein LOC1114933561.2e-12778.31Show/hide
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A0A0H3JR16 Lipoate--protein ligase 13.2e-0525.44Show/hide
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A6ZPT1 Putative lipoate-protein ligase A9.3e-0524.63Show/hide
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        ++RRF+GGGTV+ D   V  +++ +++     K F + I+ W + L  ++    D + R  D +    K  G+A  I   +  HH + L + ++   + L
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          P
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O07608 Lipoate-protein ligase LplJ9.0e-0827.49Show/hide
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           D  S    K F +P++     L      G +  L   ND V   RK  GNAQ  TK R   H + ++D
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O13629 Putative lipoate-protein ligase A3.4e-0726.45Show/hide
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        + Q  D  L ++      RK  G+A  I+++R  HH + L + ++  +  YL+ P
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P47512 Probable lipoate-protein ligase A5.4e-0528.45Show/hide
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         I K R + H + L+D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G29010.1 Biotin/lipoate A/B protein ligase family1.0e-8350.85Show/hide
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        M++ + +++  PL+NLVRLKG PIL+QL LEERLLR SSDNWCI+NDGT+ PT+VMG+SGKP +LL++  V+ D+IPVI+RFTGGGTVIVD +T+FV+ I
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        CNKD V  ++P+P+ +M+WS  LY++VF+  + F LRENDYVFG+RKFGGNAQSI K+RWIHHTSFLWDY+VRNM YLK P RVP Y +           
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                                       R H +F+C +KDY+ R  F++KT++A+  QF      L++ +    G Y  TTR+LT +ELE A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATCAAATTCCGGTCATCAGAAGGTTCACAGGGGGTGGAACTGTTATTGTTGATCACAACACAGTATTTGTCACCTTCATATGTAATAAAGATGCTGTTTCCGGACTAAAA
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TGGTGGCAATGCTCAGTCCATTACTAAAAGCCGATGGATCCACCATACATCTTTTCTGTGGGACTATGAGGTTAGGAATATGACATATCTGAAACATCCAAAACGGGTTC
CTGATTACCCCGTCGTGGTGGAGGTAGATCCTGTAGCTTCACTCCAAGGCTGTCAATGTAGATATCTTAAAAACCATGTTCGAACACGAAATAGTGAAAATGATAGCATG
TTTTCACACCCTGAACCTGAATTGAATGCAAGGAGCCATTTGGAATTTTTATGCAGCTTGAAGGACTACATGACAAGACAGGTATTTATTGACAAAACAATAGAAGCAAT
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CTGCAGATCCTAGAGCGAATTGCCTCAATTTGTGGTACATCCTAAACTGTGTTACAGATGCT
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TCTCGCAGATTCTGATCTTCATTTTCGTAGTATCATCAATTACATGGTTGCATTGATTTTTGGCTGTCCGGCCCTATTTTTGCACCGGAAAATCATTCTTAGTCTCCGCC
ATCTGCATTCCACCGGTTCTTTTAGTACTAGTTTTCTGTAAAGCCACTCCCTTGCTCAGAATCCGATTACTCTTCGTGCACGATAATCGAAATTCGATTTGTTTGTTGCT
GCCAATTTAGCAATTTATATTTCTTTTAGTTAATCGATTTGGTCTGGTTTTCGAGAATTTCTGGAATGGATCTGTTTTTCCTGTTTGCTGGGAGTATTTTTCTAGTATGA
TGATGTGGCTACTACGAACTCAATCTGCTCTTGTGATGTTGTGCATGCTCTTTGTGGTGCAGGGAGTTAGGGCAGCTTAATTGAAGTCGATTTCTTGTTTTGGAAGTAGG
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TCTGCAGCAACTACAATTGGAAGAGCGCCTACTTCGAAACTCATCTGATAATTGGTGTATCATAAATGATGGAACAGATAATCCAACTGTTGTGATGGGCGTTTCTGGGA
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ACCTTCATATGTAATAAAGATGCTGTTTCCGGACTAAAACCATTTCCTCAACCTATTATGTCCTGGAGTAGTCTATTATATAATAAAGTATTCCAAGGAACTGATTTTCA
TCTTCGGGAAAATGATTATGTCTTTGGTAACCGCAAGTTTGGTGGCAATGCTCAGTCCATTACTAAAAGCCGATGGATCCACCATACATCTTTTCTGTGGGACTATGAGG
TTAGGAATATGACATATCTGAAACATCCAAAACGGGTTCCTGATTACCCCGTCGTGGTGGAGGTAGATCCTGTAGCTTCACTCCAAGGCTGTCAATGTAGATATCTTAAA
AACCATGTTCGAACACGAAATAGTGAAAATGATAGCATGTTTTCACACCCTGAACCTGAATTGAATGCAAGGAGCCATTTGGAATTTTTATGCAGCTTGAAGGACTACAT
GACAAGACAGGTATTTATTGACAAAACAATAGAAGCAATTGAAACTCAGTTTGCTACAAATTTAAAGCAATTAAAAGAATGTGAATATTCTTTGACTGGAAACTATAGTC
CCACAACAAGGATGCTGACAGAGCAAGAATTGGAAACAGCTGCAGATCCTAGAGCGAATTGCCTCAATTTGTGGTACATCCTAAACTGTGTTACAGATGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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