; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC05G083630 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC05G083630
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationCiama_Chr05:4076481..4077206
RNA-Seq ExpressionCaUC05G083630
SyntenyCaUC05G083630
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049241.1 hypothetical protein E6C27_scaffold171G004810 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-9577.18Show/hide
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KAG6597359.1 hypothetical protein SDJN03_10539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-8067.89Show/hide
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KGN56847.1 hypothetical protein Csa_010766 [Cucumis sativus]1.0e-10179.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L892 C2H2-type domain-containing protein5.0e-10279.67Show/hide
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A0A5A7U6I9 C2H2-type domain-containing protein5.3e-9677.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCTCCTCCTTCAAGCTCCTCTGTTTGCTCTGTTTTTCCTCACAGCCTTCTCTCCCTCTCCGTCTTTCCCAGGGAATTCCTCCTCCTTTGATAAATCTGGC
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CAAGTGATTTTTGGCTCTGAAGGTCTTAATCACCATTGCAATTACCATTTCTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTGGAGGCCGCTCGAATCCTTGCTCAGGTAAC
TCTCAGCGGCCGCCGTTATGGACCAATTATTTCCATGGCCAAGCCTCTGCTTCTCGAGAACCCCAAATGACGCTTAACGATTATTTTACGATACCGCCGTCTTTG
ATAAGCTATTCCGGCGCCGGTATTGACATGGGTCACTTGCTTCCGCTTCATCCGTTGTTGGCCCAACCTCCGCCGCCGCCGCGGACTACCACCGCCAACGGTATG
AATGTTCAACAGAATCAAGCTGTGGCTCGGCAGAGGAGGCAGGAAAATCAAGTCCGATGGAATAACGGCGGCGGGAAGGGCGGTTGTGGACGGCCGGCGGCGGAG
CAGCAGCCACCTCAAGATGTGATTGATCTGAATTGTGAGGAGAATGATTGTAGCTCAGATGGTTCAGAAGGCTTGGATTTGACATTGAGTCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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