| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004145851.1 THO complex subunit 4D [Cucumis sativus] | 2.9e-130 | 91.37 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT ESGR A+S
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
NVVN FPGPS RGGLRNA GRGRG W+RG+GLGGG G GRGRGRGRG+GQG+KKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_008457020.1 PREDICTED: THO complex subunit 4D [Cucumis melo] | 9.2e-132 | 92.45 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLTPESGR A+
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
NVVNPFPGPS RGGLRNA GRGRG W RG+GLGG G GRGRGRGRGR GQG+KKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 4.4e-126 | 88.11 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
+ VNPFPGPS RGGLR+ GRGRGGW+RGL GLGGGGRGRGRG G GRG+GQG+KKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.2e-126 | 88.46 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
N VNPFPGPS RGGLR+ GRGRGGW+RGL GLGGGGRGRGRG G GRG+GQG+KKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 7.5e-134 | 93.53 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVV+GSVRRGPLGINARASAYSIRK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV+
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
NVVNPFPGPS RGGLRN GRGRGGWNRG G+GGGG GRGRGRGRGR GQG+KKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 4.4e-132 | 92.45 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLTPESGR A+
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
NVVNPFPGPS RGGLRNA GRGRG W RG+GLGG G GRGRGRGRGR GQG+KKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A5D3BPA9 THO complex subunit 4D | 1.6e-94 | 85.4 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKL---------------------------MKNVQWQHDLFE
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKL MKNVQWQHDLFE
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKL---------------------------MKNVQWQHDLFE
Query: DSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSA
DSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSA
Subjt: DSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSA
Query: RINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTAS
RINVTG NGR+RRTVVLT SG TAS
Subjt: RINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTAS
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 5.6e-119 | 87.05 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
D+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG+NGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
VVN FPGPS RG LR GRGRGGW+RG G GGGRGRGRGRGR G G+KK VEKSSDELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 2.1e-126 | 88.11 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
+ VNPFPGPS RGGLR+ GRGRGGW+RGL GLGGGGRGRGRG G GRG+GQG+KKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 1.4e-125 | 85.47 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGG------------GGRGRGRGR------GRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
N VNPFPGPS RGGLR+ GRGRGGW+RGLG GG GGRGRGRGR G GRG+GQG+KKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGG------------GGRGRGRGR------GRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q58EA2 THO complex subunit 4-A | 2.6e-28 | 37.68 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGA-GGSFNGGRGVVIGSVRRGPL-GINARASAYSI-------RKASFKLMKNV--QWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTK
D+IK N ++ RGR GRGA GGS GG G IG R G G+ + + R + K + +WQHDLF+ A +G+E G K
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGA-GGSFNGGRGVVIGSVRRGPL-GINARASAYSI-------RKASFKLMKNV--QWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
L VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I+++ E RR
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
P S+ GG+ R RGG LG G R RGRG RGRG+G G+ + S++ELD +L+ Y+A
Subjt: LTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 1.1e-66 | 53.74 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
+++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GV
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
Query: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTP---
T EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +RTVV+
Subjt: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTP---
Query: --------ESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
GR + V P +Q+GG + GRGG+ R G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: --------ESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 1.7e-40 | 43.52 | Show/hide |
Query: GYSFGYDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GIS
G D I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS R + + WQ+D+F + S+ A+ G S
Subjt: GYSFGYDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GIS
Query: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P + +
Subjt: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
Query: RSRRTVVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGW---NRGLGLGGGGRGRGRG-RGR-GRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
P +G + N F G N GRGRGG+ RG G GGG GRG RGR GRG G G+ + S+++LD EL+ YH EAM+
Subjt: RSRRTVVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGW---NRGLGLGGGGRGRGRG-RGR-GRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
Query: T
T
Subjt: T
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 5.5e-39 | 44.12 | Show/hide |
Query: ARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRR-GPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIREL
A+ R RG GAG + G G G RR P + R++ Y KA W HD+F ED +GIE GTKLY+SNLDYGV EDI+EL
Subjt: ARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRR-GPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIREL
Query: FSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASSNVVNPFP
F+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N + + SGR A+ N
Subjt: FSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASSNVVNPFP
Query: GPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
G RG G+GRGG RG G GGGGRG G GRGR G+G P EK S+++LD +L+ YH+ M+T
Subjt: GPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 3.6e-62 | 52.48 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
+++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K + + +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT
Subjt: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
+Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+NGR +R+
Subjt: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
Query: VVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGRGQ---GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
V F G RGG R GRG G R L L GG RGRGRG G GRG G+G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA
Subjt: VVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGRGQ---GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAM
EAM
Subjt: EAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.5e-63 | 52.48 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
+++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K + + +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT
Subjt: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
+Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+NGR +R+
Subjt: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
Query: VVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGRGQ---GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
V F G RGG R GRG G R L L GG RGRGRG G GRG G+G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA
Subjt: VVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGRGQ---GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAM
EAM
Subjt: EAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.5e-63 | 52.48 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
+++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K + + +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT
Subjt: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
+Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+NGR +R+
Subjt: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
Query: VVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGRGQ---GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
V F G RGG R GRG G R L L GG RGRGRG G GRG G+G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA
Subjt: VVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGRGQ---GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAM
EAM
Subjt: EAM
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.2e-41 | 43.52 | Show/hide |
Query: GYSFGYDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GIS
G D I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS R + + WQ+D+F + S+ A+ G S
Subjt: GYSFGYDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GIS
Query: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P + +
Subjt: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
Query: RSRRTVVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGW---NRGLGLGGGGRGRGRG-RGR-GRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
P +G + N F G N GRGRGG+ RG G GGG GRG RGR GRG G G+ + S+++LD EL+ YH EAM+
Subjt: RSRRTVVLTPESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGW---NRGLGLGGGGRGRGRG-RGR-GRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
Query: T
T
Subjt: T
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 7.6e-68 | 53.74 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
+++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GV
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
Query: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTP---
T EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +RTVV+
Subjt: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTP---
Query: --------ESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
GR + V P +Q+GG + GRGG+ R G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: --------ESGRTASSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 9.0e-69 | 55.24 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
+++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GV
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
Query: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTPESG
T EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +RTVV+ G
Subjt: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTPESG
Query: RTA---SSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
R + V P +Q+GG + GRGG+ R G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: RTA---SSNVVNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
