; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC05G104090 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC05G104090
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase SETD1A
Genome locationCiama_Chr05:34644868..34645386
RNA-Seq ExpressionCaUC05G104090
SyntenyCaUC05G104090
Gene Ontology termsGO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032206.1 hypothetical protein SDJN02_06249, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.4e-3864.41Show/hide
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XP_008446332.1 PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase SETD1A [Cucumis melo]6.7e-5580.11Show/hide
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XP_011655674.1 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A [Cucumis sativus]5.0e-5884.83Show/hide
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XP_022987613.1 uncharacterized protein LOC111485117 [Cucurbita maxima]4.4e-3860.31Show/hide
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XP_038891727.1 uncharacterized protein LOC120081124 [Benincasa hispida]3.4e-6789.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BFM2 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A3.3e-5580.11Show/hide
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A0A5D3D3N5 Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A3.3e-5580.11Show/hide
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A0A6J1FZL9 uncharacterized protein LOC1114493401.2e-3363.58Show/hide
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A0A6J1H1H5 uncharacterized protein LOC1114587173.1e-3761.11Show/hide
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A0A6J1JJY7 uncharacterized protein LOC1114851172.1e-3860.31Show/hide
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        +     A + +C + E+              EE GERERVMRHLLEASDDELGIPN EF+VGEGVDGVAL DALWELEDEAANYYTLF SQLFM
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26920.1 unknown protein1.5e-1544.26Show/hide
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        E E L E E  KRQK        SYNQIL LL + +E+     DL+S I  LQQEISS                   Y+  S +S+   S SS  S    
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Query:  PKCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPN---GEFLVGEGVDGV--------ALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
            +KEE  E+  +E+VM+HLLEASDDELGIPN   GE    +  DG            DA WELEDEAANYYTL QS+LFM
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AT1G69760.1 unknown protein1.6e-2247.89Show/hide
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        KRQR+E E E ++  EE KRQK      SYNQ+L+LL++E E    D++S+ITTLQQEIS+     E + A+        +  + S SSS SSSSSS   
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Query:  ANSPKCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEF-----------LVGEGVDGVALSD----ALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
             C +KE+ E +G++E+VM+HLLEA+DDELGIPN EF              + V+G +L D     LWELEDEAANYYTL QS+LFM
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATCGAAACGCCAGAGGAACGAAGGAGAAACAGAGGAACTCAGGGAAGGAGAAGAACTAAAACGCCAAAAATCATACAACCAGATCCTATCCCTTTTAGAG
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AAGGAGGAATTAGAGGAAGAGGGTGAAAGAGAAAGGGTTATGAGACACCTTCTGGAAGCTTCGGATGATGAACTTGGAATTCCAAACGGGGAGTTTTTGGTGGGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM