; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC06G111190 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC06G111190
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Descriptionouter envelope pore protein 16-2, chloroplastic
Genome locationCiama_Chr06:5565701..5570766
RNA-Seq ExpressionCaUC06G111190
SyntenyCaUC06G111190
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK02947.1 outer envelope pore protein 16-2 [Cucumis melo var. makuwa]3.5e-5778.44Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVL-TFVRVA
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNS+ PPELSSIRKQRFPGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG+ Y   L      LSC          P+L    R+A
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVL-TFVRVA

Query:  AGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        AGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL SD+SSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  AGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

XP_008458360.1 PREDICTED: outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic [Cucumis melo]9.6e-5574.1Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNS+ PPELSSIRKQRFPGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG                                 +AA
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA

Query:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL SD+SSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

XP_011657265.1 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic [Cucumis sativus]1.5e-5272.29Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN   PPELSS+RKQRFPGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG                                 +AA
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA

Query:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL +D SSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

XP_023514075.1 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-4869.28Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA
        IGALQSVSREAYFTVAGS+DS++  PPELSS RK+  PGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG                                 +AA
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA

Query:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL SDDSSHE IVQ AITGAAVS AANIFAGIF
Subjt:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

XP_038875334.1 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic [Benincasa hispida]2.1e-5473.49Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNS+ PPEL+SIRKQRFPGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG                                 +AA
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA

Query:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGA+TGVAVAL SD+SSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
Subjt:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCC7 Uncharacterized protein7.4e-5372.29Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN   PPELSS+RKQRFPGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG                                 +AA
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA

Query:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL +D SSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

A0A1S3C7N2 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic4.6e-5574.1Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNS+ PPELSSIRKQRFPGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG                                 +AA
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA

Query:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL SD+SSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

A0A5D3BTY5 Outer envelope pore protein 16-21.7e-5778.44Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVL-TFVRVA
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNS+ PPELSSIRKQRFPGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG+ Y   L      LSC          P+L    R+A
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVL-TFVRVA

Query:  AGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        AGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL SD+SSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  AGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

A0A6J1EQH2 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic-like isoform X11.0e-4667.47Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA
        IGALQSVSREAYFTVAGS+DS++   PEL   RK+  PGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG                                 +AA
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA

Query:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL SDDSSHE IVQ AITGAAVS AANIFAGIF
Subjt:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

A0A6J1KKF2 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic-like isoform X11.2e-4768.67Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA
        IGALQSVSREAYFTVAGS+DS++  P ELSS RK+  PGLKGETN+ESLEAMVK VG ESI+WG                                 +AA
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAA

Query:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL SDDSSHE IVQ AITGAAVS AANIFAGIF
Subjt:  GVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WMZ5 Outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic1.2e-3146.2Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTV--AGSVDSNSIAPP-ELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVR
        +GALQ+VSREAYFTV      DSN++ PP E++  +K RFP L+GE+++ SL+A+VK  G ES++WG                                 
Subjt:  IGALQSVSREAYFTV--AGSVDSNSIAPP-ELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVR

Query:  VAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL-ISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        +AAG+YSG+TYG+ E R GAHDW+NSA+AGA+TG A+A+  S+ +SHE +VQ A+TGAA+STAAN+ + +F
Subjt:  VAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL-ISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

Q41050 Outer envelope pore protein 16, chloroplastic1.6e-0750Show/hide
Query:  AGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAA
        AGVY G+ YG++  RG  DWKN+   GAVTG  V+  S++   + I   AITGAA++TAA
Subjt:  AGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G16160.1 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein3.4e-3446.75Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPP-ELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVA
        +GALQ+VSREAYFTV    DSN++ PP E++  +K RFP L+GE+++ SL+A+VK  G ES++WG                                 +A
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPP-ELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVA

Query:  AGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL-ISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        AG+YSG+TYG+ E R GAHDW+NSA+AGA+TG A+A+  S+ +SHE +VQ A+TGAA+STAAN+ + +F
Subjt:  AGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL-ISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

AT4G16160.2 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein8.4e-3346.2Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTV--AGSVDSNSIAPP-ELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVR
        +GALQ+VSREAYFTV      DSN++ PP E++  +K RFP L+GE+++ SL+A+VK  G ES++WG                                 
Subjt:  IGALQSVSREAYFTV--AGSVDSNSIAPP-ELSSIRKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVR

Query:  VAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL-ISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        +AAG+YSG+TYG+ E R GAHDW+NSA+AGA+TG A+A+  S+ +SHE +VQ A+TGAA+STAAN+ + +F
Subjt:  VAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVTGVAVAL-ISDDSSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGAACGTTTCTTCTCACTGACTTTAGCAATCAAATCGAGTGCACTGCAGATTTTGGAGTTCAATCTCTGATTCCATACAAGATTTCGAAGAAGAAATGGGCAGTAGA
AGCCTTGAGAATCGTTCATTGGTTGATGAAATCCGATGCTCCCATGGCGGAAGCTTCTTCTACGACCTTGGCCATCCTCTTCTCAATCGTATTGCTGATAGCTTCGTCAA
GGCCGCTGGGGTTCATAGGCGCATTGCAATCTGTGTCTCGTGAGGCTTATTTTACGGTTGCAGGAAGTGTTGATTCGAACAGTATAGCACCACCTGAATTATCGAGTATT
AGAAAGCAACGTTTTCCAGGTCTTAAAGGTGAAACCAACAGAGAGTCTCTTGAAGCCATGGTGAAGAGAGTGGGATTAGAATCCATCGAATGGGGTCAGTATTACTTCTC
TGAATTAACATTCTGGCTTAAATGGCTTTCTTGCATATCTGGTTTATGTTTCTATAAAATTCTCCCAGTGTTAACTTTTGTAAGAGTGGCTGCTGGTGTTTACTCTGGTC
TCACGTACGGTTTAAAGGAGGCTCGTGGAGCACATGACTGGAAGAATAGCGCAATTGCGGGTGCTGTGACCGGGGTAGCTGTGGCGCTTATATCGGATGATTCTTCCCAT
GAGCATATCGTACAATACGCCATCACCGGTGCTGCCGTGTCGACGGCTGCAAATATTTTTGCTGGCATATTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGAACGTTTCTTCTCACTGACTTTAGCAATCAAATCGAGTGCACTGCAGATTTTGGAGTTCAATCTCTGATTCCATACAAGATTTCGAAGAAGAAATGGGCAGTAGA
AGCCTTGAGAATCGTTCATTGGTTGATGAAATCCGATGCTCCCATGGCGGAAGCTTCTTCTACGACCTTGGCCATCCTCTTCTCAATCGTATTGCTGATAGCTTCGTCAA
GGCCGCTGGGGTTCATAGGCGCATTGCAATCTGTGTCTCGTGAGGCTTATTTTACGGTTGCAGGAAGTGTTGATTCGAACAGTATAGCACCACCTGAATTATCGAGTATT
AGAAAGCAACGTTTTCCAGGTCTTAAAGGTGAAACCAACAGAGAGTCTCTTGAAGCCATGGTGAAGAGAGTGGGATTAGAATCCATCGAATGGGGTCAGTATTACTTCTC
TGAATTAACATTCTGGCTTAAATGGCTTTCTTGCATATCTGGTTTATGTTTCTATAAAATTCTCCCAGTGTTAACTTTTGTAAGAGTGGCTGCTGGTGTTTACTCTGGTC
TCACGTACGGTTTAAAGGAGGCTCGTGGAGCACATGACTGGAAGAATAGCGCAATTGCGGGTGCTGTGACCGGGGTAGCTGTGGCGCTTATATCGGATGATTCTTCCCAT
GAGCATATCGTACAATACGCCATCACCGGTGCTGCCGTGTCGACGGCTGCAAATATTTTTGCTGGCATATTTTAGGGTCACCAGTATTAGGAGGTATGTGTATGGCCGCC
GTAGCCATTTCACAAAATCTGGGATGTTCGTCTTCTCATGCTCATTCTATCTTTAATTACGATGACTATGATGCTTTCTCTTTTGGATTCTTGGTTTAATATTAAGTTTG
TCTCTGATCTTTTCTTTTTAATTAAGATTAACTAGAAAAGTGGTACTCTGTTTTTCGAATAAATCTTGGGATTTTGTGTAGTAGGTTATTAAGAACAGTAGGCATTGGCT
AGTGGGATTTTTGAAGTACACAATGAACCTTCTTCAAGTTTTAATAAGTTTGTGTAGTAACATCTTTTGTGGGGACGATCTTCCATTATGAGATCAAAGCAAGTCAGATC
TCAGAACGTTATTTACCAACATTTTGGAGCTTCAAATCCGCAATTGTTTTTGAATTTCTAGAATTTCAAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRTFLLTDFSNQIECTADFGVQSLIPYKISKKKWAVEALRIVHWLMKSDAPMAEASSTTLAILFSIVLLIASSRPLGFIGALQSVSREAYFTVAGSVDSNSIAPPELSSI
RKQRFPGLKGETNRESLEAMVKRVGLESIEWGQYYFSELTFWLKWLSCISGLCFYKILPVLTFVRVAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALISDDSSH
EHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF