; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC07G140010 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC07G140010
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionLipid transfer protein
Genome locationCiama_Chr07:30813313..30813603
RNA-Seq ExpressionCaUC07G140010
SyntenyCaUC07G140010
Gene Ontology termsGO:0006869 - lipid transport (biological process)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR016140 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain
IPR033872 - Non-specific lipid-transfer protein type 2
IPR036312 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN53818.1 hypothetical protein Csa_014950 [Cucumis sativus]1.9e-3071.88Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK L    L LLVV MAALLT A +A+A+TC+TM LSPC+GA+TSTAPP   CCSKLREQQPCFC Y+KNPSLGGYV+S RAK +IS CGVP+PKC
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

XP_008444080.1 PREDICTED: non-specific lipid-transfer protein 2-like [Cucumis melo]2.9e-3173.96Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK L    L LLVV + ALLT A +AEAVTC+TM+LSPC+GAITSTAPP   CCSKLREQQPCFCGY+KNPSLGGYV+S RAK +IS CGVP PKC
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

XP_022143278.1 non-specific lipid-transfer protein 2-like [Momordica charantia]1.6e-2668.75Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK LPI  L LLVV + ALLT AH+AEAVTCS ++LS C GAI+S+  P A+CCSKLREQ+PC CGYLKNP+L  YVQSP AKTV S CGV FP C
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

XP_022148226.1 non-specific lipid-transfer protein 2-like [Momordica charantia]3.4e-2466.33Show/hide
Query:  MKKLPI--IRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MKKL I  +RL LLVV +AALL  A + EAVTCS  ELSPC+ AI S  PP +ACCSKLREQ+PC CGYL+NP+L  YVQSP AK V S CGV FP C
Subjt:  MKKLPI--IRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

XP_038904866.1 non-specific lipid-transfer protein 2-like [Benincasa hispida]1.1e-3380.21Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK L    L LLVV MAALLT A LAEAVTCSTMELSPC+GA TSTAPP AACCSKL+EQQPCFCGY+KNP LG YV+SPRAKTVIS CGV FPKC
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KW85 AAI domain-containing protein9.1e-3171.88Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK L    L LLVV MAALLT A +A+A+TC+TM LSPC+GA+TSTAPP   CCSKLREQQPCFC Y+KNPSLGGYV+S RAK +IS CGVP+PKC
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

A0A0A0L100 AAI domain-containing protein1.6e-3070.83Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK L    L LLVV MAAL+T A +A+A+TC+TM LSPC+GA+TSTAPP   CCSKLREQQPCFC Y+KNPSLGGYV+S RAK +IS CGVP+PKC
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

A0A1S3B931 non-specific lipid-transfer protein 2-like1.4e-3173.96Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK L    L LLVV + ALLT A +AEAVTC+TM+LSPC+GAITSTAPP   CCSKLREQQPCFCGY+KNPSLGGYV+S RAK +IS CGVP PKC
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

A0A5A7VAB3 Non-specific lipid-transfer protein 2-like1.4e-3173.96Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK L    L LLVV + ALLT A +AEAVTC+TM+LSPC+GAITSTAPP   CCSKLREQQPCFCGY+KNPSLGGYV+S RAK +IS CGVP PKC
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

A0A6J1CQB8 non-specific lipid-transfer protein 2-like8.0e-2768.75Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        MK LPI  L LLVV + ALLT AH+AEAVTCS ++LS C GAI+S+  P A+CCSKLREQ+PC CGYLKNP+L  YVQSP AKTV S CGV FP C
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XBN5 Non-specific lipid-transfer protein 21.8e-1241.67Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        M++L +  L L V  +AA           +C+  +L+ C GAI   A P AACCS LR QQ CFC + K+P  G YV SP A+  +S CG+  P C
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

P82353 Non-specific lipid-transfer protein 22.8e-2164.71Show/hide
Query:  VTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        VTCS ++LSPC+G I S AP P  CC KLREQ+PC CGYLKNPSL  YV SP A+ + S CGVP P+C
Subjt:  VTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

P86809 Non-specific lipid-transfer protein 26.5e-1859.7Show/hide
Query:  TCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        TCS ++LSPC+ AIT   PP AACC+KL+EQ+PC CGYLK+P+L  YV SP A+   S CGV   KC
Subjt:  TCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

Q10ST8 Non-specific lipid-transfer protein 21.8e-1242.71Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        M+KL +  L L V  +AA            C+  +L+ C GAI   A P AACCS LR QQ CFC + K+P  G YV SP A+  +S CG+  P C
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

Q43681 Probable non-specific lipid-transfer protein AKCS92.0e-1950Show/hide
Query:  KLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        K+ +  +C +VV    L+    +AEAVTC+  ELS C+ AIT  + P + CCSKL+ Q+PC C Y+KNPSL  YV SP AK V+S CGV +P C
Subjt:  KLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G48750.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein4.9e-2149.45Show/hide
Query:  IIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        ++ + +L +  A LL    +AE VTCS M+L+ C  A+TS++PP  ACC+KLREQQPC CGY++NP+L  YV SP A+ V + C +P P C
Subjt:  IIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

AT1G66850.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein1.2e-1441.18Show/hide
Query:  LPIIRLCLLV-VTMAALLTAAHLAE--------AVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFP
        + I+ L L+V V ++    AA  AE         VTC   +L PC+ AIT    P  ACC+KL EQQ C CG+ KNP+   Y+ SP A+ V+  C V +P
Subjt:  LPIIRLCLLV-VTMAALLTAAHLAE--------AVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFP

Query:  KC
         C
Subjt:  KC

AT3G18280.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein6.5e-2150Show/hide
Query:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        M K  ++ L  L   +  +L  A  AEAVTCS M+LSPC  AITS++PP A CC+KL+EQ+PC CGY++NPSL  +V +P A+ V   C +P P+C
Subjt:  MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

AT5G38160.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein7.7e-1442.65Show/hide
Query:  VTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        VTC   +LS C+ A+++ APP   CC KL+E + C C Y++NP    YV SP A+  ++ C V +P C
Subjt:  VTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC

AT5G38170.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein8.2e-1648.53Show/hide
Query:  VTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC
        VTC  ++LS C   + +  PP   CC KL+EQQPCFC Y+K+P    YV S  AK  ++ CGVP+P C
Subjt:  VTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAAAGCTTCCGATCATAAGGCTTTGCCTTTTGGTGGTGACAATGGCTGCGCTCCTAACTGCAGCTCATCTTGCCGAGGCGGTGACTTGCAGCACTATGGAGCTTAG
TCCATGCATGGGTGCAATAACGTCGACCGCACCACCGCCGGCCGCTTGTTGCAGTAAGCTGAGGGAGCAACAACCGTGCTTTTGTGGGTACCTCAAGAATCCAAGCTTGG
GAGGTTACGTGCAATCTCCTCGTGCCAAAACTGTTATTTCCAAATGTGGTGTTCCCTTCCCCAAATGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAAAGCTTCCGATCATAAGGCTTTGCCTTTTGGTGGTGACAATGGCTGCGCTCCTAACTGCAGCTCATCTTGCCGAGGCGGTGACTTGCAGCACTATGGAGCTTAG
TCCATGCATGGGTGCAATAACGTCGACCGCACCACCGCCGGCCGCTTGTTGCAGTAAGCTGAGGGAGCAACAACCGTGCTTTTGTGGGTACCTCAAGAATCCAAGCTTGG
GAGGTTACGTGCAATCTCCTCGTGCCAAAACTGTTATTTCCAAATGTGGTGTTCCCTTCCCCAAATGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKKLPIIRLCLLVVTMAALLTAAHLAEAVTCSTMELSPCMGAITSTAPPPAACCSKLREQQPCFCGYLKNPSLGGYVQSPRAKTVISKCGVPFPKC