; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC08G149200 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC08G149200
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionBRCT domain containing protein
Genome locationCiama_Chr08:20714431..20716550
RNA-Seq ExpressionCaUC08G149200
SyntenyCaUC08G149200
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR036420 - BRCT domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022946828.1 uncharacterized protein LOC111450771 isoform X2 [Cucurbita moschata]3.1e-4068.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KFI3 Uncharacterized protein9.6e-4371.01Show/hide
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A0A1S3BD03 uncharacterized protein LOC1034885291.4e-4169.57Show/hide
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A0A6J1G4S0 uncharacterized protein LOC111450771 isoform X11.5e-4068.12Show/hide
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A0A6J1G4Y5 uncharacterized protein LOC111450771 isoform X21.5e-4068.12Show/hide
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A0A6J1KDR7 uncharacterized protein LOC111493956 isoform X14.4e-4067.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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AT3G43930.1 BRCT domain-containing DNA repair protein1.7e-1538.73Show/hide
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AT3G43930.2 BRCT domain-containing DNA repair protein1.7e-1538.73Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTCTCTCGCTTCTCCGTCTTCAAGGTCTGAACTGGTGAAAGCGCGGTTAGCCGGTCCCTTTACTGGACTTGTAATTTGCGTCACTGGCTTATCCAAAGATCTTGTTGAAA
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GTTGTCTCTCTTGGCTGGTTTGTGGATAGTGTACGGAGAAATGGTAAGAGCAAGCAACGTCAGTCCAATAACTTCTATATAACTTTGTTGAATATTCTGTTGACCATAAA
TCACATAATCCTTGTAAGCTTTCTACAAAGTGATTTTGAGATCAGGGAAGCTTTTTCATGCAGAGGAGTGTTTACTGATATGCAGAATCGTGTCATTGGTTCTGTCTTGG
TGGATTGTCCAGTATTTTCTTTTACTATAGTACATGAGATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGAACACCAGCAAGAACTCTTAACAGTAAAGCCGGAGTTGAATGCTCCACTCTCAAAGCTCTGCTCTTGGTTCAAAAAAGTTCGCCTTTGGGACTAAAGGAGAAGCTTG
GATTACTCTTAAAAGATCCTAAATTTTGTTTTTAATTCCGTTATTTCGTTCCTTTTCAATCCCTATTTTGCTTTTCTGTTCGATTCCTTCTTCTCAATCAAAGTTCCCTT
TTCCCTTTTTCATTTCCGAGATCATTTCTTTTGATTCGGTCAAAAATTCTTCCGAAATCTTCTTTTCATGTCAATTCTGACTCTTGGTTGCAAAATACGCTCTGTTATGT
TTCAAAAGCTTTTCCCGCCTTTGAATAAATTCTACTTTTCTGATTTCTTTTGCCTCTTCTTCCATCTCCTTTCTCGGAATCGGCACGGTGTTCAGTTTCGAGTAATGGTA
AGCTGAGGGGTGTTGGTGGTGGTTATGGGAGGTGGTACGGTCGAAGTGGTTAGTAATAAAGGTTGTTCTAGGCTGTTTTTTGGGTTCTCATCACCGTTATCGTCATTGGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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