; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC09G176560 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC09G176560
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Description40S ribosomal protein S15a
Genome locationCiama_Chr09:35802101..35804814
RNA-Seq ExpressionCaUC09G176560
SyntenyCaUC09G176560
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000630 - Ribosomal protein S8
IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EXC35054.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Morus notabilis]1.9e-6384.46Show/hide
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KAA8539431.1 hypothetical protein F0562_026123 [Nyssa sinensis]1.5e-6389.44Show/hide
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KAG6678312.1 hypothetical protein I3842_14G074000 [Carya illinoinensis]3.3e-6378.03Show/hide
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XP_019463034.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S15a-1 isoform X3 [Lupinus angustifolius]4.3e-6391.79Show/hide
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XP_037497885.1 40S ribosomal protein S15a-1 isoform X1 [Jatropha curcas]1.5e-6392.59Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KZP3 Uncharacterized protein4.0e-7586.36Show/hide
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A0A1S3CPB7 40S ribosomal protein S15a-13.6e-63100Show/hide
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A0A5A7SSH5 40S ribosomal protein S15a-13.6e-63100Show/hide
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A0A5J5BE85 Uncharacterized protein7.2e-6489.44Show/hide
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W9T070 40S ribosomal protein S15a-19.3e-6484.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80646 40S ribosomal protein S15a-32.3e-5989.52Show/hide
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P42798 40S ribosomal protein S15a-11.1e-6496.77Show/hide
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Q00332 40S ribosomal protein S15a3.1e-6495.97Show/hide
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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a2.6e-6395.16Show/hide
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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-41.4e-6496.77Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07770.1 ribosomal protein S15A7.6e-6696.77Show/hide
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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A7.6e-6696.77Show/hide
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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein2.1e-6085.38Show/hide
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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D9.9e-6696.77Show/hide
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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein7.6e-6696.77Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGGCCGAACTCCGAAGCCCTATAATTCGAACCGAGCCCTATTTTAAACACAATATAAATATATTAGGTTTCAACTCCACTCCTCTCTCTTTTCTCTCAGCCGTTAA
AGAAGAAGCCCTAGTCCCCATCCGGAGTCGGCAACTTTCGTCTTGTGGCCTTCTTTCTCTCTCGGTAGCAATGGTGCGTGTGAGTGTTCTGAATGATGCTCTTAAAAGCA
TGTATAATGCTGAGAAACGGGGGAAGCGTCAGGTCATGATAAGACCGTCTTCTAAAGTTATTATCAAGTTTCTTCTTGTTATGCAGAAGCACGGATACATTGGGGAATTT
GAGTTCGTTGATGATCATAGATCAGGGAAAATCGTTGTTGAACTGAACGGGAGACTCAACAAATGTGGTGTCATAAGTCCCCGTTTCGATGTTGGTGTCAAGGAGATTGA
AGGTTGGACTGCTAGGTTGCTACCCTCTAGACAGTTTGGATTCATTGTCTTGACAACATCTGCGGGAATCATGGATCACGAAGAGGCCAGAAGAAAGAATGTTGGTGGTA
AAAGTCAATTGCTGATCTCACGGGTTACATGGGAAGGGAAATGTGTGGTTCACGGAACAAAGGTTCCGCCTTCCGGCCTTCTACGATTGGTTGCCTGCGGTGGCATCAAC
CGTACGCTCGGATTCTTTTGCAACTGCAGCCTGCAGGCACTTATTCTACTAATTTCCACCAATGGACACTCTCCC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAATAAATATGTGGGCCGAACTCCGAAGCCCTATAATTCGAACCGAGCCCTATTTTAAACACAATATAAATATATTAGGTTTCAACTCCACTCCTCTCTCTTTTCTCTCA
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TAAAAGCATGTATAATGCTGAGAAACGGGGGAAGCGTCAGGTCATGATAAGACCGTCTTCTAAAGTTATTATCAAGTTTCTTCTTGTTATGCAGAAGCACGGATACATTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWAELRSPIIRTEPYFKHNINILGFNSTPLSFLSAVKEEALVPIRSRQLSSCGLLSLSVAMVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIIKFLLVMQKHGYIGEF
EFVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDVGVKEIEGWTARLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKNVGGKSQLLISRVTWEGKCVVHGTKVPPSGLLRLVACGGIN
RTLGFFCNCSLQALILLISTNGHSP