CuGenDBv2

Gene ID	CaUC10G181510
Organism	Citrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	Ciama_Chr10:2648603..2650867
RNA-Seq Expression	CaUC10G181510
Synteny	CaUC10G181510
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

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        NHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQL NHFILPSSML RLVNI MFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGL+LVWI+QN SIRSN LIR
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Query:  SNKYLVSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDET
        SNKYLVSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPI+TKK+KETSETEERGESEEETDVEIE TSETKGTKQEQE  TEED SPSLFSEEKEDPDKIDET
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        EEIRVNGKEKTKD F
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Q14FA0 Protein TIC 214

4.3e-155

93.65

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        GNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFS+GPSYLFLLRARV+   EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWN
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        NHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNI MFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLILVWIQQNNS+RSN  IR
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        SNKYLVSELRNSMARIFSILLFITCVY LGRIPSPI TKKLKETSETEER   EEETDVEIETT ETKGTKQEQEG TEED S SLFSEEKE+PDKIDET
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Query:  EEIRVNGKEKTKDXF
        EEIRVNGKEKTKD F
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G07739.1 Ycf1 protein

1.0e-79

86.67

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        GNLV LCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGP YLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFH FFW
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        NNHKHFFDYGSTTRN MRNL IQCVF NNLIF+LFNH ILPSSML RLVNI MFRCNNKMLFVTSSFV  +   +L ++W
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ATCG01000.1 Ycf1 protein

4.1e-137

84.06

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        GNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWN
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        NHKHFFDYGSTTRN MRNL IQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSML RLVNI MFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGL+LVWIQQNNSIRSN +IR
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        SNKY  LVSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPI TKKLK                     TSET GTKQ+QE  TEE   PSLFSEE ED DKID
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        E EEIRVNGK+K  KD  F+
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ATCG01130.1 Ycf1 protein

4.1e-137

84.06

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        GNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWN
Subjt:  GNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWN

Query:  NHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLILVWIQQNNSIRSNGLIR
        NHKHFFDYGSTTRN MRNL IQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSML RLVNI MFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGL+LVWIQQNNSIRSN +IR
Subjt:  NHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLILVWIQQNNSIRSNGLIR

Query:  SNKY--LVSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDPDKID
        SNKY  LVSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPI TKKLK                     TSET GTKQ+QE  TEE   PSLFSEE ED DKID
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        E EEIRVNGK+K  KD  F+
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ATMG00370.1 Ycf1 protein

2.1e-80

87.22

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        GNLV LCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFH FFW
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Query:  NNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKW
        NNHKHFFDYGSTTRN MRNL IQCVF NNLIF+LFNH ILPSSML RLVNI MFRCNNKMLFVTSSFV  +   +L ++W
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAAAAGATCCAGTGGAGACGGGGTGGGGCCTGTAGCTCAGAGGATTAGAGCACGTGGCTACGAACCACGGTGTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTCGCCCACAACCGGCC
AAAAAGGGAAGGACTTTTCCCTCTGGGGTATACCCAACCCGAATCAGCATATTTTTTTGTTTTACGCCCCGTAATTCTTCCTCAGCCAGGCTCGGGCAGAATAGCAGAGC
AAGTACAAAATAGCAAAAATGTGTTCCTCGTCATTAATATGTTTGCTCGCGGTAATTGTGACCTCTCGGGAGAATCGATGACTGCATCAAAGATGCACTTGCTAGTACTA
ACCCAGACTGTGGAACAAAGGATTATCCCGGACCTACACCGAGGTATTGACGGATTCGAACCTACGACCAATCGGTTAACAGCCGACCGCTCTACCACTGAGCTACTGAG
GAACAACGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCT
TCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCT
CTGCATCTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTAC
TACCAGAAACTCAATGCGTAATCTTAGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAG
TCAACATTTCTATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGTCACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGATATTA
GTCTGGATACAGCAAAATAATTCTATTAGATCTAATGGACTTATTAGATCTAATAAGTACCTTGTGTCAGAATTGAGAAATTCTATGGCTCGAATCTTTAGTATTCTCTT
ATTTATTACCTGTGTCTACTATTTAGGCAGAATACCGTCACCCATTGTTACTAAGAAACTGAAAGAAACCTCAGAAACGGAGGAAAGGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAG
ATGTCGAAATAGAAACCACTTCCGAAACGAAGGGGACTAAACAGGAACAAGAGGGATTCACCGAAGAAGATACTTCTCCTTCCCTTTTTTCGGAAGAAAAGGAGGATCCG
GACAAAATCGATGAAACGGAAGAGATCCGAGTGAATGGAAAGGAAAAAACAAAGGATNTTTTTTTTAATGGAACTAAAGATATTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKRSSGDGVGPVAQRIRARGYEPRCRGFESLLAHNRPKREGLFPLGYTQPESAYFFVLRPVILPQPGSGRIAEQVQNSKNVFLVINMFARGNCDLSGESMTASKMHLLVL
TQTVEQRIIPDLHRGIDGFEPTTNRLTADRSTTELLRNNGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAP
LHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLIL
VWIQQNNSIRSNGLIRSNKYLVSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGFTEEDTSPSLFSEEKEDP
DKIDETEEIRVNGKEKTKDXFFNGTKDI

CaUC10G181510 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome