; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC10G181590 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC10G181590
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionCytochrome c biogenesis protein CcsA
Genome locationCiama_Chr10:2673162..2674021
RNA-Seq ExpressionCaUC10G181590
SyntenyCaUC10G181590
Gene Ontology termsGO:0017004 - cytochrome complex assembly (biological process)
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InterPro domainsIPR002541 - Cytochrome c assembly protein
IPR045062 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA/CcmC


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ALO22063.1 CcsA [Cucurbita ecuadorensis]1.4e-7962.45Show/hide
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QZL38644.1 cytochrome c biogenesis protein [Citrullus naudinianus]3.6e-8062.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1P8LE41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.7e-8062.83Show/hide
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A0A1P8LFA2 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.7e-8062.83Show/hide
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A0A249RX63 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.7e-8062.83Show/hide
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A0A343A8G1 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.7e-8062.83Show/hide
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A0A343F2D5 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.7e-8062.83Show/hide
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A6MM86 Cytochrome c biogenesis protein CcsA4.7e-6752.79Show/hide
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Q09FZ7 Cytochrome c biogenesis protein CcsA6.8e-6652.61Show/hide
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Q09WW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA2.0e-7055.02Show/hide
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Q0ZIW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA5.6e-6853.9Show/hide
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Q2QD41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA8.8e-8262.08Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01040.1 Cytochrome C assembly protein7.0e-5846.49Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TACGTATTTTAAAAAATATAAAAACCATTTAAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTACTATTTTTACCCAAGGTTTTGCTACTTCAGGTTTTTTAACTGAAATGCATC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTCGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCTTTAAGTGATTTATATGAATCATTACTATTTCTTTCGTGGGGTTTCTCCATTATTTATCTATT
TACGTATTTTAAAAAATATAAAAACCATTTAAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTACTATTTTTACCCAAGGTTTTGCTACTTCAGGTTTTTTAACTGAAATGCATC
AATCCCCCCTATTAGTTCCCGCTCTCCAATCTCATTGGTTAATGATGCACGTAAGGGCAGTATGGGCTAATGAGACATGGGGATCGTATTGGAATTGGGACCCAAAGGAA
ACTTGGGCATTTATTACTTGGACCATATTCGCAATTTATTTACATACGCGAACAAATAAAAATTTTGAAGGTGTAAATTCTGCAATTGTGGCCTCTATGGGTTTTCTTAT
AATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCTATTAGGGATAGGGCTACATAGTTATGGTTCATTTACATTAACATCTAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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