; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC10G190160 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC10G190160
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Descriptiongibberellin-regulated protein 14
Genome locationCiama_Chr10:24178724..24180404
RNA-Seq ExpressionCaUC10G190160
SyntenyCaUC10G190160
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR003854 - Gibberellin regulated protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581005.1 Gibberellin-regulated protein 14, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-8079.55Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHVP----APSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS
        M+SMAN F FSVFLL  SWVSANANGVSQ+KDAV P VP    APSPPVYKAPSP PPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPP KLPPPPYTPSPPVK    
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHVP----APSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS

Query:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR
          PPVKAPYTPSPP K PSSPPPA    +PPVK           PPSPAAPRPPPV+GK C PECGRRCQLHSRK +CIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR
Subjt:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR

Query:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        EVCGKCYTDMTTHG+R KCP
Subjt:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

XP_008443473.1 PREDICTED: gibberellin-regulated protein 14 [Cucumis melo]2.1e-8279.83Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVS--ANANGVSQEKDAVNPH--VPAPSPPVYKAPS----------PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYT
        MASMANLF FSVFLLFGSWVS  ANANG+SQEKDAV PH  VP PSPPVYK+PS          PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTP PPVKLPPPPYT
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVS--ANANGVSQEKDAVNPH--VPAPSPPVYKAPS----------PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYT

Query:  PSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKA---PSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCY
        PS          PPVKAPYTPSPPV PPSS PP AKA   PSPPVKPPY+PVPPVK PPSPAAPRPPPV+GK C PECGRRCQLHSRKK+C+RAC+TCCY
Subjt:  PSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKA---PSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCY

Query:  RCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        RC+CVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHG R KCP
Subjt:  RCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

XP_022983874.1 gibberellin-regulated protein 14 [Cucurbita maxima]4.9e-7978.64Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHV----PAPSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS
        M+SMANLF FSVF+L  SW SANANG+SQEKDAV P V    PAPSPPVYKAPSP PPVKPPT PVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVK    
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHV----PAPSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS

Query:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR
          PPVKAPYTPSPP K PSSPPPA    +PPVK           PPSPAAPRPPPV+GK C PECGRRCQLHSRK +CIRACLTCCYRC+CVPPGTYGNR
Subjt:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR

Query:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        EVCGKCYTDMTTHG+R KCP
Subjt:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

XP_023526964.1 gibberellin-regulated protein 14 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-8080Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPH----VPAPSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS
        M+SMAN F FSVFLL  SWVSANANGVSQ+KDAV P     VPAPSPPVYKAPSP PPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVK    
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPH----VPAPSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS

Query:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR
          PPVKAPYTPSPP K PSSPPPA    +PPVK           PPSPAAPRPPPV+GK C PECGRRCQLHSRK +CIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR
Subjt:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR

Query:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        EVCGKCYTDMTTHG+R KCP
Subjt:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

XP_038903485.1 gibberellin-regulated protein 14 [Benincasa hispida]1.7e-9286.27Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHVP----APSPPVYKAPS----------PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYT
        MASMANLF FSVFLLFGSWVSANANG+S+EK AV PHVP    APSPPVYKAPS          PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYT
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHVP----APSPPVYKAPS----------PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYT

Query:  PSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKA---PSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCY
        PSPPVKPPSSPPPPVKAPYTP PPVKPPSSPPP AKA   PSPPVKPPY+PVPPVKPPPSPAAPRPPPV GK C+ +CGRRCQLHSR+KICIRACLTCCY
Subjt:  PSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKA---PSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCY

Query:  RCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        RCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSR+KCP
Subjt:  RCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFE6 Uncharacterized protein3.0e-7471.6Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVS--ANANGVSQEKDAVNPHVP----APSPPVYKA----------------------------PSPAPPVKPPTTPVLTPP
        MA MANLF FSV LL GSWVS  ANANG+SQ+KDAV PHVP    APS PVYKA                            P PAPPVKPPT PVLTPP
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVS--ANANGVSQEKDAVNPHVP----APSPPVYKA----------------------------PSPAPPVKPPTTPVLTPP

Query:  PVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQ
        PVKAPYTP PPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS PPP KAPYTPSPPVKPPS                 +PVPPVK PPSPAAPRPPPVLGK C PECGRRCQ
Subjt:  PVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQ

Query:  LHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        LHSRKKIC+RACLTCC RCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSR KCP
Subjt:  LHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

A0A1S3B840 gibberellin-regulated protein 141.0e-8279.83Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVS--ANANGVSQEKDAVNPH--VPAPSPPVYKAPS----------PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYT
        MASMANLF FSVFLLFGSWVS  ANANG+SQEKDAV PH  VP PSPPVYK+PS          PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTP PPVKLPPPPYT
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVS--ANANGVSQEKDAVNPH--VPAPSPPVYKAPS----------PAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYT

Query:  PSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKA---PSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCY
        PS          PPVKAPYTPSPPV PPSS PP AKA   PSPPVKPPY+PVPPVK PPSPAAPRPPPV+GK C PECGRRCQLHSRKK+C+RAC+TCCY
Subjt:  PSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKA---PSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCY

Query:  RCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        RC+CVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHG R KCP
Subjt:  RCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

A0A6J1D924 gibberellin-regulated protein 141.7e-6966.93Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEK------DAVNPHV----PAPSPPVYKAPSPAPPVK--PPTTPVLTP---PPVKAPYTPVPPVKLPP---
        MASMANL+ F V LLF SWVSANANG+S EK      D V P V    P PSPP YK P+PAPPVK  PP  P++ P   PPVKAPYTP PPVKLPP   
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEK------DAVNPHV----PAPSPPVYKAPSPAPPVK--PPTTPVLTP---PPVKAPYTPVPPVKLPP---

Query:  --------------PPYTPSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAK---APSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRC
                      PP +P+PPVKPPSSP PP KAPY PSPPVKPPSSP P  K    PSPPVK PY+P PPV  PPSPAAP+PPPV G++C P+CGRRC
Subjt:  --------------PPYTPSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAK---APSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRC

Query:  QLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        +LHSRK++CIRAC+TCCYRCKCVPPGTYGNRE+CGKCYTDMTTHG+R+KCP
Subjt:  QLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

A0A6J1F0Y7 gibberellin-regulated protein 142.4e-7979.09Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHVP----APSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS
        M+SMAN F FSVFLL  SWVSANANGVSQ+KDAV P VP    APSPPVYKAPSP PPVKPPTTPVL PPPVKAPYTPVPP KLPPPPYTPSPPVK    
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHVP----APSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS

Query:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR
          PPVKAPYTPSPP K PSSPPPA    +PPVK           PPSPAAPRPPPV+GK C PECGRRCQLHSRK +CIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR
Subjt:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR

Query:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        EVCGKCYTDMTTHG+R KCP
Subjt:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

A0A6J1J8R5 gibberellin-regulated protein 142.4e-7978.64Show/hide
Query:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHV----PAPSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS
        M+SMANLF FSVF+L  SW SANANG+SQEKDAV P V    PAPSPPVYKAPSP PPVKPPT PVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVK    
Subjt:  MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHV----PAPSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSS

Query:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR
          PPVKAPYTPSPP K PSSPPPA    +PPVK           PPSPAAPRPPPV+GK C PECGRRCQLHSRK +CIRACLTCCYRC+CVPPGTYGNR
Subjt:  PPPPVKAPYTPSPPVKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNR

Query:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
        EVCGKCYTDMTTHG+R KCP
Subjt:  EVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LFR3 Gibberellin-regulated protein 147.0e-2845.26Show/hide
Query:  LFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAV----NPHVPAPSPPVYKAPSPA-----PPVKPPTTPV------LTPPPVKAPYTPV---------PPVKLP-
        L   SVF+ F  + +      ++E +A+     P +P+PSP   K PSPA     P  KPPT P        T PPVK P  PV         PP+KLP 
Subjt:  LFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAV----NPHVPAPSPPVYKAPSPA-----PPVKPPTTPV------LTPPPVKAPYTPV---------PPVKLP-

Query:  --PPPY-TPSPPVKPPSSPPP---------------PVKAPYTP---SPPVKPPSSPPPAA--KAP--SPPVKPPYS-----------PVPPVKPPPSPA
          PP Y  P+P VKPPS  PP               PVK P TP   SPPV+PP+  PP +  K P  +PPVKPP +           P  PVKPP +P 
Subjt:  --PPPY-TPSPPVKPPSSPPP---------------PVKAPYTP---SPPVKPPSSPPPAA--KAP--SPPVKPPYS-----------PVPPVKPPPSPA

Query:  A--PRPPPVLGK-DCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
           P PPPV  + DC P CG RC  HSRK +C+RAC+TCCYRCKCVPPGTYGN+E CG CY +M T G + KCP
Subjt:  A--PRPPPVLGK-DCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14920.1 Gibberellin-regulated family protein5.0e-2945.26Show/hide
Query:  LFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAV----NPHVPAPSPPVYKAPSPA-----PPVKPPTTPV------LTPPPVKAPYTPV---------PPVKLP-
        L   SVF+ F  + +      ++E +A+     P +P+PSP   K PSPA     P  KPPT P        T PPVK P  PV         PP+KLP 
Subjt:  LFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAV----NPHVPAPSPPVYKAPSPA-----PPVKPPTTPV------LTPPPVKAPYTPV---------PPVKLP-

Query:  --PPPY-TPSPPVKPPSSPPP---------------PVKAPYTP---SPPVKPPSSPPPAA--KAP--SPPVKPPYS-----------PVPPVKPPPSPA
          PP Y  P+P VKPPS  PP               PVK P TP   SPPV+PP+  PP +  K P  +PPVKPP +           P  PVKPP +P 
Subjt:  --PPPY-TPSPPVKPPSSPPP---------------PVKAPYTP---SPPVKPPSSPPPAA--KAP--SPPVKPPYS-----------PVPPVKPPPSPA

Query:  A--PRPPPVLGK-DCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP
           P PPPV  + DC P CG RC  HSRK +C+RAC+TCCYRCKCVPPGTYGN+E CG CY +M T G + KCP
Subjt:  A--PRPPPVLGK-DCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTCAATGGCCAATCTCTTTGCTTTTAGCGTTTTTCTTCTATTTGGCTCATGGGTTTCAGCCAATGCCAATGGAGTGTCCCAAGAGAAGGATGCTGTTAACCCCCA
TGTTCCAGCTCCTTCTCCTCCAGTTTACAAAGCGCCGTCGCCAGCCCCGCCTGTGAAGCCACCAACAACCCCTGTTTTGACACCACCACCAGTTAAAGCACCATATACCC
CTGTTCCACCTGTTAAGCTTCCACCACCTCCTTATACTCCTTCTCCGCCGGTGAAGCCGCCGTCTTCTCCTCCGCCGCCGGTAAAGGCACCGTACACTCCTTCTCCACCG
GTGAAGCCACCGTCTTCACCTCCCCCGGCGGCTAAAGCTCCATCTCCTCCTGTGAAGCCACCTTACTCCCCTGTTCCACCTGTGAAGCCGCCTCCGTCTCCGGCAGCTCC
CAGGCCACCACCAGTCTTAGGCAAGGACTGCACCCCAGAGTGTGGAAGAAGATGCCAACTTCATTCAAGGAAAAAAATATGCATAAGGGCATGTTTGACATGCTGCTACA
GGTGCAAGTGTGTTCCACCGGGTACATACGGCAATAGAGAAGTCTGTGGAAAGTGCTACACTGATATGACCACTCATGGCAGCAGAGTCAAGTGCCCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCTCAATGGCCAATCTCTTTGCTTTTAGCGTTTTTCTTCTATTTGGCTCATGGGTTTCAGCCAATGCCAATGGAGTGTCCCAAGAGAAGGATGCTGTTAACCCCCA
TGTTCCAGCTCCTTCTCCTCCAGTTTACAAAGCGCCGTCGCCAGCCCCGCCTGTGAAGCCACCAACAACCCCTGTTTTGACACCACCACCAGTTAAAGCACCATATACCC
CTGTTCCACCTGTTAAGCTTCCACCACCTCCTTATACTCCTTCTCCGCCGGTGAAGCCGCCGTCTTCTCCTCCGCCGCCGGTAAAGGCACCGTACACTCCTTCTCCACCG
GTGAAGCCACCGTCTTCACCTCCCCCGGCGGCTAAAGCTCCATCTCCTCCTGTGAAGCCACCTTACTCCCCTGTTCCACCTGTGAAGCCGCCTCCGTCTCCGGCAGCTCC
CAGGCCACCACCAGTCTTAGGCAAGGACTGCACCCCAGAGTGTGGAAGAAGATGCCAACTTCATTCAAGGAAAAAAATATGCATAAGGGCATGTTTGACATGCTGCTACA
GGTGCAAGTGTGTTCCACCGGGTACATACGGCAATAGAGAAGTCTGTGGAAAGTGCTACACTGATATGACCACTCATGGCAGCAGAGTCAAGTGCCCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASMANLFAFSVFLLFGSWVSANANGVSQEKDAVNPHVPAPSPPVYKAPSPAPPVKPPTTPVLTPPPVKAPYTPVPPVKLPPPPYTPSPPVKPPSSPPPPVKAPYTPSPP
VKPPSSPPPAAKAPSPPVKPPYSPVPPVKPPPSPAAPRPPPVLGKDCTPECGRRCQLHSRKKICIRACLTCCYRCKCVPPGTYGNREVCGKCYTDMTTHGSRVKCP