; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC10G190860 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC10G190860
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationCiama_Chr10:24960869..24962199
RNA-Seq ExpressionCaUC10G190860
SyntenyCaUC10G190860
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]4.9e-9498.87Show/hide
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XP_022935530.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita moschata]5.2e-8893.22Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]3.2e-9394.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein8.1e-9598.88Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like5.3e-9498.31Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like5.3e-9498.31Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like3.3e-8891.67Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like2.5e-8893.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 62.1e-3962.81Show/hide
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          +L +Y  +     + S+S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 23.6e-3951.43Show/hide
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        L    ++L +Y    I     +++ Q    +        ++T+   HY+   +F P      G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.8e-5184.68Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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        + TNADL+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 62.1e-3962.81Show/hide
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          +L +Y  +     + S+S+
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES5.9e-5077.42Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 251.3e-5284.68Show/hide
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        + TNADL+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein4.2e-5177.42Show/hide
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        ELDA NADL  Y  S     +P +
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein4.2e-5177.42Show/hide
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein4.2e-5177.42Show/hide
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        ELDA NADL  Y  S     +P +
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein4.2e-5177.42Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATCTCCAATGGTAAGAAAGACGGCTCTGAGCGACCAAAAAAAAGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCG
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CTTGTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGAATACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TAAAAACTTGGTTTCAAACATTCTTGTAATTTGCAATAAAGATCAGAAGTACCCTTTTGTTGGATATTAAATATATATCTGTGTGACATATATAGAATAAGTTTGGTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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