; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CaUC10G191370 (gene) of Watermelon (USVL246-FR2) v1 genome

Gene IDCaUC10G191370
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationCiama_Chr10:25659929..25665533
RNA-Seq ExpressionCaUC10G191370
SyntenyCaUC10G191370
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141207.1 tryptophan synthase alpha chain [Cucumis sativus]7.4e-15391.99Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA KSSR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQSKRFAPMAALAA P VGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELS PISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAV  NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMKNI EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFT+SLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_008465320.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]6.1e-15592.63Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA K SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAV  NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_016903364.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X2 [Cucumis melo]1.4e-15191.67Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA K SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD    GLVVPDVPLEETE+LRKEAV  NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_022932801.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita moschata]1.8e-15189.74Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA KSSRFLPLNKIP+T   S RPC ISV QSKRFAP+AAL ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRGIENFMM I+DAGVRGLVVPDVPLEET +LR+EAV +NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKNI EASEGFVYLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_038906368.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Benincasa hispida]5.5e-15694.23Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        M IA KSS F PLNKIPS+P FS RPCKISV +SKRFAPMA LAASP VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYN ILKRGIENF+MIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAV +NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMK+IAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT KPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD81 Tryptophan synthase3.6e-15391.99Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA KSSR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQSKRFAPMAALAA P VGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELS PISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAV  NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMKNI EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFT+SLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A1S3CNL8 Tryptophan synthase3.0e-15592.63Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA K SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAV  NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A1S4E560 Tryptophan synthase6.8e-15291.67Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA K SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD    GLVVPDVPLEETE+LRKEAV  NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A5D3E2H9 Tryptophan synthase3.0e-15592.63Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA K SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAV  NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A6J1EXE2 Tryptophan synthase8.9e-15289.74Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIA KSSRFLPLNKIP+T   S RPC ISV QSKRFAP+AAL ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDL TTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRGIENFMM I+DAGVRGLVVPDVPLEET +LR+EAV +NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKNI EASEGFVYLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0C6F8 Tryptophan synthase alpha chain3.9e-8056.7Show/hide
Query:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYN
        +S+ F +LR++G+ ALIP++TAGDPDL TTA AL+ L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L R T  + ++ M+  + PE+  PI LFTYYN
Subjt:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYN

Query:  PILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT
        PI  RG+  F+  I  AGVRGLVVPD+PLEE+E L ++A +  IE+ LL  PT+ K+R++ IA  S+GF+YLVS+ GVTG RT V  RVQ L+ ++++VT
Subjt:  PILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT

Query:  KKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
         KP+ VGFGIS+ EH +QV DWGAD  I+GSA V  L E  SP +GL  +  F +SLKS+L
Subjt:  KKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

B8HPH2 Tryptophan synthase alpha chain6.7e-8056.44Show/hide
Query:  VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY
        V +S  F+ LR++ + ALIP+ITAGDP L  TA+AL+VL   G+D+IELGVPYSDPLADGP IQAAATR+L + T  +A++ M+  V P L  P+ LFTY
Subjt:  VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY

Query:  YNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKE
        YNPI  RG+E F+  +  AGV+GLVVPD+PLEE + +  +A    IEL LL  PTTP+ R+  IAE S+GF+YLVS+ GVTG R+ V GRV  LL E+++
Subjt:  YNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKE

Query:  VTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        VT KP+ VGFGIS+PEH +QV +WGAD  I+GSA VK L E  +PE+GL  + +F +SLK+AL+
Subjt:  VTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

O22765 Tryptophan synthase alpha chain1.2e-11678.95Show/hide
Query:  SPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISL
        S  VGLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDL TTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNFN+IISMLK VIP+LSCPI+L
Subjt:  SPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISL

Query:  FTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE
        FTYYNPIL+RG+EN+M +IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA    IELVLLTTPTTPK+RM  I EASEGF+YLVSSVGVTGTR SV+ +VQ+LL++
Subjt:  FTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE

Query:  VKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        +KE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADG+I+GSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  VKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic1.6e-8655.74Show/hide
Query:  IPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAA
        +P+ P  +  P  +   Q+      AA A   +  +S+T   L  +GK A IPYITAGDPDL TTAEAL++L  CG+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+ 
Subjt:  IPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAA

Query:  TRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEA
         R+LA  T  +A++ ML+ V PELSCP+ L +YY PI+ R +      +K+AGV GL+VPD+P      L  EA N N+ELVLLTTP  P+DRMK I +A
Subjt:  TRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEA

Query:  SEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        SEGFVYLVS  GVTG R +V+ RV++L++EVK+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IIGSAMV+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  SEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic5.2e-11770.83Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALA-ASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGV
        M IA KS  F  L    S   F       S    KRF PMA+L+ +SP +GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDL TTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALA-ASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM  I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+N +IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTP +RMK I +ASEGF+YLVSS+GVTG R+SVSG+VQ+LL+++KE T KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LE  TKSLKSAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain3.7e-11870.83Show/hide
Query:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALA-ASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGV
        M IA KS  F  L    S   F       S    KRF PMA+L+ +SP +GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDL TTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALA-ASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM  I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+N +IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTP +RMK I +ASEGF+YLVSS+GVTG R+SVSG+VQ+LL+++KE T KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LE  TKSLKSAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein8.3e-11878.95Show/hide
Query:  SPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISL
        S  VGLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDL TTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNFN+IISMLK VIP+LSCPI+L
Subjt:  SPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISL

Query:  FTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE
        FTYYNPIL+RG+EN+M +IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA    IELVLLTTPTTPK+RM  I EASEGF+YLVSSVGVTGTR SV+ +VQ+LL++
Subjt:  FTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE

Query:  VKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        +KE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADG+I+GSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  VKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCAATCAAATCTTCGAGGTTTCTTCCGCTCAACAAGATACCCAGTACGCCTGCCTTTTCTTCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTCTCCCAATCCAAGCGGTT
TGCTCCAATGGCTGCTCTTGCAGCTTCCCCTGCTGTTGGACTGTCCGAAACCTTCAACAAATTGAGAGAACAAGGGAAGGTCGCATTGATCCCCTACATCACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTTGACCACGGCTGAGGCATTGAAGGTGCTTTCGACTTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCCACTCGGTCCTTGGCTAGGGAGACAAACTTTAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTAC
ATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGGATTGAGAACTTTATGATGATAATAAAAGATGCTGGTGTGCGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAA
TTTTAAGAAAGGAAGCTGTAAATTTCAATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGATAGGATGAAAAACATCGCTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTT
TATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTTACCGGTACCCGCACATCAGTTAGTGGTAGAGTTCAAACTCTCCTTGAGGAAGTTAAAGAGGTTACGAAAAAACCAGTAGCAGTTGG
TTTTGGTATATCAAAACCCGAGCATGTGAAACAGGTGGCTGACTGGGGGGCAGATGGTATTATTATTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAATCCCCTG
AGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTGAAATCTGCACTCTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTACACATTTTCATTATTCGACCTCAATACGATGGATGAATCCATATTTTTATCTATCATAAAATTGTTTTAAAAAATCTAGAAGTAAAAAATAAAATGTCTAGTTCA
ATAAAGTACGAAAAATTCGGATTTTAAAGCTTCCATTAAAATGGAAATGTGGTCCTAAAACCAGGATTGATTGCTCTCCCAATGGAGCTTTCAAGTGAGATTCAAATCTC
TGTTTCTAATTTTTCATTTGGAAGCTTTTCTTTAGAGATCCTTCAACCTTCTCAAATAATCATAACTGCAAGCAGCAGATTCAAACAATATCATTCCCAGCTCTCAGATT
CTGGTGGGTTTTGATCCTTTTTTACCTTCCTTCTTTGCATCAATGCTATAATAAGCAAGATCTATTGCTGTATGTCAAACCAAACACAAACTGAACCAACAAAATTCAAC
CCATCCAAACCATTAAGCCGCCATTTTTTAGCCTCTTGTTCTACAAAACTTCTCCATACAACAACCCCAATACGGCTTGTTTTTTGTAACTGCGGCCGTTGTAAAAATCG
ACCTCCTAAACTTCGTATTTATTATGTATTTGAATGTGAAGAGTTTTTGAATCGAATTGAATTGGGGGAGAAGAAACCCATTTCACCAATCTAAATTTCCACCAAAACCC
TCTTTACCAAATGGACATTGCAATCAAATCTTCGAGGTTTCTTCCGCTCAACAAGATACCCAGTACGCCTGCCTTTTCTTCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTCTCCCAAT
CCAAGCGGTTTGCTCCAATGGCTGCTCTTGCAGCTTCCCCTGCTGTTGGACTGTCCGAAACCTTCAACAAATTGAGAGAACAAGGGAAGGTCGCATTGATCCCCTACATC
ACTGCTGGTGATCCTGATCTTTTGACCACGGCTGAGGCATTGAAGGTGCTTTCGACTTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGA
TGGTCCTGTTATACAGGCTGCAGCCACTCGGTCCTTGGCTAGGGAGACAAACTTTAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTT
CCCTTTTTACATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGGATTGAGAACTTTATGATGATAATAAAAGATGCTGGTGTGCGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAG
GAGACTGAAATTTTAAGAAAGGAAGCTGTAAATTTCAATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGATAGGATGAAAAACATCGCTGAAGCTTCAGA
GGGATTTGTTTATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTTACCGGTACCCGCACATCAGTTAGTGGTAGAGTTCAAACTCTCCTTGAGGAAGTTAAAGAGGTTACGAAAAAACCAG
TAGCAGTTGGTTTTGGTATATCAAAACCCGAGCATGTGAAACAGGTGGCTGACTGGGGGGCAGATGGTATTATTATTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCC
CAATCCCCTGAGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTGAAATCTGCACTCTCTTGATGGCATAACCCAGGCTGTTTCTTTCATCTGTAAACAAGTGC
TCAACTTGCACTGTCATCCTAAAATTACACTTCCAATATTTCCCTGTTCTTCTTTTTTGAAACAGTATTTCCCTTTTCTTTTAACAGTGAATAAAATTATCAGCTCGTAT
TTTCTTCGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAIKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLLTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVNFNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFV
YLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS